More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1730 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_1730  phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 214 aa  443  1.0000000000000001e-124  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1760  phosphoglycerate mutase family protein  29.5 
 
 		 199 aa  95.1  7e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000115709  normal  0.449804 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1761  phosphoglycerate mutase family protein  27.32 
 
 		 208 aa  87.4  1e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000435031  normal  0.107927 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2113  phosphatase PhoE  29.51 
 
 		 203 aa  82  0.000000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0276195  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2076  phosphatase PhoE  29.51 
 
 		 205 aa  81.6  0.000000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2145  phosphatase PhoE  28.96 
 
 		 203 aa  81.6  0.000000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  31.06 
 
 		 209 aa  81.3  0.000000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0078  phosphoglycerate mutase family protein  30 
 
 		 207 aa  80.1  0.00000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.570626  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0695  phosphoglycerate mutase family protein  31.61 
 
 		 217 aa  80.9  0.00000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.597978  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0100  phosphoglycerate mutase family protein  30 
 
 		 207 aa  79.7  0.00000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.124325  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1849  phosphatase PhoE  28.96 
 
 		 203 aa  79.3  0.00000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2034  phosphatase PhoE  28.42 
 
 		 203 aa  79.3  0.00000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1897  phosphatase PhoE  28.96 
 
 		 203 aa  79  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1859  phosphatase PhoE  28.96 
 
 		 203 aa  78.6  0.00000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.324195  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1975  Phosphoglycerate mutase  28.42 
 
 		 207 aa  78.6  0.00000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00690294  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3275  phosphatase PhoE  27.87 
 
 		 203 aa  78.6  0.00000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  26.96 
 
 		 222 aa  77.8  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1204  phosphoglycerate mutase  28.14 
 
 		 207 aa  77.8  0.0000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  26.96 
 
 		 222 aa  77.8  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1322  Phosphoglycerate mutase  31.85 
 
 		 209 aa  77  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1422  phosphoglycerate mutase family protein  26.95 
 
 		 207 aa  76.3  0.0000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.314707  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1894  phosphatase PhoE  28.12 
 
 		 203 aa  76.6  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00837019  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0369  phosphoglycerate mutase  29.95 
 
 		 200 aa  75.1  0.0000000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2449  phosphoglycerate mutase  31.58 
 
 		 204 aa  75.1  0.0000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0114  Phosphoglycerate mutase  27.88 
 
 		 210 aa  74.3  0.000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000110333  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2273  Phosphoglycerate mutase  29.01 
 
 		 208 aa  74.3  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2989  Phosphoglycerate mutase  27.11 
 
 		 217 aa  74.3  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.30555e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1230  phosphoglycerate mutase  26.95 
 
 		 207 aa  73.6  0.000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3375  Phosphoglycerate mutase  29.03 
 
 		 213 aa  72.8  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0008  phosphoglycerate mutase  28.93 
 
 		 241 aa  73.2  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0357979 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2324  phosphoglycerate mutase  27.42 
 
 		 213 aa  72.8  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0703569 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2311  phosphoglycerate mutase  25.45 
 
 		 440 aa  72.8  0.000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.3615 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0701  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  25.93 
 
 		 442 aa  72.4  0.000000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4252  phosphoglycerate mutase  28.93 
 
 		 245 aa  71.6  0.000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3274  Phosphoglycerate mutase  25.56 
 
 		 370 aa  70.9  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000275954  hitchhiker  0.000874495 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2177  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  26.06 
 
 		 212 aa  70.9  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2646  Phosphoglycerate mutase  27.51 
 
 		 214 aa  70.1  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.451935 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0209  phosphoglycerate mutase  28.18 
 
 		 218 aa  70.5  0.00000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2787  Phosphoglycerate mutase  27.13 
 
 		 220 aa  70.1  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3618  bifunctional RNase H/acid phosphatase  28.24 
 
 		 369 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0045  phosphoglycerate mutase  28.29 
 
 		 217 aa  70.5  0.00000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.192648  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0968  Phosphoglycerate mutase  27.68 
 
 		 212 aa  69.7  0.00000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.667484  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1699  phosphoglycerate mutase  26.34 
 
 		 213 aa  69.7  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.812426  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1597  Phosphoglycerate mutase  28.74 
 
 		 206 aa  70.1  0.00000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4141  phosphoglycerate mutase  28.16 
 
 		 196 aa  69.7  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.287698 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00607  predicted alpha-ribazole-5'-P phosphatase  30.18 
 
 		 203 aa  69.3  0.00000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000725652  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2253  Phosphoglycerate mutase  27.14 
 
 		 203 aa  69.3  0.00000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00114118  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0727  alpha-ribazole phosphatase  30.18 
 
 		 203 aa  69.3  0.00000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000487704  normal  0.192993 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00596  hypothetical protein  30.18 
 
 		 203 aa  69.3  0.00000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000603804  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  27.67 
 
 		 214 aa  68.9  0.00000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1026  Phosphoglycerate mutase  30.43 
 
 		 212 aa  68.9  0.00000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.411321  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0389  Phosphoglycerate mutase  28.03 
 
 		 226 aa  68.6  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0252032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1600  phosphoglycerate mutase  27.85 
 
 		 209 aa  68.6  0.00000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0374  Phosphoglycerate mutase  28.03 
 
 		 226 aa  68.6  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0499  putative phosphoglycerate mutase 2 protein  24.47 
 
 		 227 aa  68.6  0.00000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.725562  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05721  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  29.34 
 
 		 442 aa  68.2  0.00000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.169271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23210  fructose-2,6-bisphosphatase  27.67 
 
 		 189 aa  68.2  0.0000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235832 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1847  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  28.74 
 
 		 442 aa  67.8  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0233931  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0479  phosphoglycerate mutase  27.69 
 
 		 229 aa  67.8  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.364165  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0420  phosphoglycerate mutase  24.75 
 
 		 224 aa  67.4  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.104537 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1381  Phosphoglycerate mutase  28.25 
 
 		 240 aa  67.8  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2988  alpha-ribazole phosphatase  30 
 
 		 203 aa  67  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000161375  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2605  phosphoglycerate mutase family protein  29.3 
 
 		 180 aa  67  0.0000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1226  Phosphoglycerate mutase  26.82 
 
 		 195 aa  67  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.129631  normal  0.708444 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1538  Phosphoglycerate mutase  28.09 
 
 		 213 aa  67  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1087  Phosphoglycerate mutase  26.63 
 
 		 199 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1615  phosphoglycerate mutase  24.35 
 
 		 237 aa  67  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.979507  normal  0.794966 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1503  Phosphoglycerate mutase  26.47 
 
 		 211 aa  67  0.0000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4242  phosphoglycerate mutase  27.59 
 
 		 447 aa  66.2  0.0000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3007  phosphoglycerate mutase family protein, putative  26.88 
 
 		 217 aa  66.6  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0690  alpha-ribazole phosphatase  29.59 
 
 		 203 aa  66.6  0.0000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000194009  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4087  phosphoglycerate mutase  27.59 
 
 		 215 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1657  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  28.99 
 
 		 444 aa  66.6  0.0000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2789  Phosphoglycerate mutase  24.06 
 
 		 212 aa  66.6  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0651  phosphoglycerate mutase  24 
 
 		 235 aa  66.6  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.761339 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2693  phosphoglycerate mutase  25.79 
 
 		 206 aa  66.2  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0664  alpha-ribazole phosphatase  29.59 
 
 		 203 aa  66.6  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000732678  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3312  Phosphoglycerate mutase  24.06 
 
 		 212 aa  66.6  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.176703  normal  0.738547 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2892  bifunctional RNase H/acid phosphatase  28.82 
 
 		 356 aa  65.9  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.816574  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1694  Phosphoglycerate mutase  24.75 
 
 		 230 aa  65.9  0.0000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.873195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1797  Phosphoglycerate mutase  25.81 
 
 		 192 aa  65.5  0.0000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0658  alpha-ribazole phosphatase  29.59 
 
 		 203 aa  65.9  0.0000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000037528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1649  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  23.9 
 
 		 191 aa  65.5  0.0000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.581113  hitchhiker  0.00512316 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0485  phosphoglycerate mutase  27.87 
 
 		 445 aa  65.5  0.0000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.081071 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1664  phosphoglycerate mutase  29.65 
 
 		 225 aa  65.5  0.0000000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3007  alpha-ribazole phosphatase  29.59 
 
 		 203 aa  65.1  0.0000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000150204  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  27.61 
 
 		 213 aa  65.1  0.0000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0181  phosphoglycerate mutase  24.85 
 
 		 207 aa  64.7  0.000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.215594 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01925  alpha-ribazole-5''''-phosphate phosphatase  28.26 
 
 		 196 aa  64.3  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.920687  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1298  Phosphoglycerate mutase  22.39 
 
 		 211 aa  64.7  0.000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000085953  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1967  Phosphoglycerate mutase  29.07 
 
 		 447 aa  64.3  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0238  phosphoglycerate mutase  24.1 
 
 		 204 aa  64.3  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.688849  normal  0.278174 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5889  bifunctional RNase H/acid phosphatase  22.81 
 
 		 427 aa  64.3  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05171  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  30.58 
 
 		 443 aa  63.9  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1007  Phosphoglycerate mutase  29.01 
 
 		 204 aa  63.9  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.628079 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0515  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  28.49 
 
 		 442 aa  63.5  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.85164  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0606  phosphoglycerate mutase  30.13 
 
 		 218 aa  63.5  0.000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4185  phosphoglycerate mutase  25 
 
 		 200 aa  63.9  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3133  Phosphoglycerate mutase  28.5 
 
 		 200 aa  63.5  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2647  Phosphoglycerate mutase  25.27 
 
 		 212 aa  63.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.372085 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>