265 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1297 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_1297  DNA-3-methyladenine glycosylase I  100 
 
 
179 aa  375  1e-103  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.112534  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3094  DNA-3-methyladenine glycosylase I  45.98 
 
 
198 aa  163  1.0000000000000001e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3404  DNA-3-methyladenine glycosylase I  47.13 
 
 
208 aa  162  2.0000000000000002e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0567  DNA-3-methyladenine glycosylase I  43.93 
 
 
191 aa  160  6e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.118693  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0015  DNA-3-methyladenine glycosylase I  44.63 
 
 
202 aa  158  4e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000494499 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3977  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  43.35 
 
 
187 aa  158  4e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2514  DNA-3-methyladenine glycosylase I  43.6 
 
 
196 aa  157  5e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1181  DNA-3-methyladenine glycosylase I  44.25 
 
 
198 aa  157  5e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3988  DNA-3-methyladenine glycosylase I  44.32 
 
 
221 aa  157  6e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.138626  decreased coverage  0.000983487 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0211  DNA-3-methyladenine glycosylase  42.29 
 
 
210 aa  157  7e-38  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03399  3-methyl-adenine DNA glycosylase I, constitutive  43.35 
 
 
187 aa  157  8e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3870  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  43.35 
 
 
187 aa  157  8e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03350  hypothetical protein  43.35 
 
 
187 aa  157  8e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0570  DNA-3-methyladenine glycosylase I  41.62 
 
 
183 aa  155  2e-37  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.890211 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3242  DNA-3-methyladenine glycosylase I  46.82 
 
 
208 aa  156  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1605  DNA-3-methyladenine glycosylase I  41.34 
 
 
186 aa  156  2e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.665009  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0014  DNA-3-methyladenine glycosylase I  44.69 
 
 
203 aa  155  3e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0000350265  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4170  DNA-3-methyladenine glycosylase I  41.62 
 
 
187 aa  155  3e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0590  DNA-3-methyladenine glycosylase I  45.09 
 
 
193 aa  154  5.0000000000000005e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.444252  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0016  DNA-3-methyladenine glycosylase I  42.29 
 
 
196 aa  154  5.0000000000000005e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000166004 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0175  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  42.77 
 
 
193 aa  154  6e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4925  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  42.77 
 
 
187 aa  154  6e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.571955  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4452  DNA-3-methyladenine glycosylase I  41.04 
 
 
187 aa  154  6e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.748727  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1224  DNA-3-methyladenine glycosylase I  43.75 
 
 
190 aa  154  7e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0396149  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4044  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  42.77 
 
 
187 aa  154  8e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0167  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  42.77 
 
 
187 aa  154  8e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3749  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  42.77 
 
 
187 aa  154  8e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0163  DNA-3-methyladenine glycosylase I  42.77 
 
 
187 aa  153  1e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0775  DNA-3-methyladenine glycosylase I  43.02 
 
 
235 aa  153  1e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.272148  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0106  DNA-3-methyladenine glycosylase I  44.19 
 
 
198 aa  152  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.119209  normal  0.580749 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2619  DNA-3-methyladenine glycosylase I  42.53 
 
 
191 aa  152  2e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.3294  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04565  DNA-3-methyladenine glycosidase I  43.43 
 
 
189 aa  152  2.9999999999999998e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.902141  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0153  DNA-3-methyladenine glycosylase I  42.37 
 
 
194 aa  152  2.9999999999999998e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3837  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  41.62 
 
 
193 aa  152  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.363143  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0555  DNA-3-methyladenine glycosylase I  42.61 
 
 
214 aa  151  5e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.870987  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2351  DNA-3-methyladenine glycosylase I  39.66 
 
 
194 aa  151  5.9999999999999996e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.117632  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7198  DNA-3-methyladenine glycosylase I  44.63 
 
 
227 aa  151  5.9999999999999996e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.717856  normal  0.74062 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0008  DNA-3-methyladenine glycosylase I  41.14 
 
 
186 aa  151  5.9999999999999996e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3019  DNA-3-methyladenine glycosylase I  43.35 
 
 
191 aa  150  8e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4822  DNA-3-methyladenine glycosylase I  45.96 
 
 
213 aa  150  8e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.724787 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4025  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  41.04 
 
 
193 aa  150  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.612137  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3518  DNA-3-methyladenine glycosylase I  42.53 
 
 
202 aa  150  1e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.104093  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06520  DNA-3-methyladenine glycosylase I  42.37 
 
 
211 aa  149  1e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3921  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  41.04 
 
 
193 aa  150  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.696634 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1887  DNA-3-methyladenine glycosylase I  40.45 
 
 
196 aa  150  1e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2705  DNA-3-methyladenine glycosylase I  42.05 
 
 
208 aa  150  1e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.176992  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4216  DNA-3-methyladenine glycosylase I  44.19 
 
 
186 aa  150  1e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.779924  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0359  DNA-3-methyladenine glycosylase I  43.43 
 
 
212 aa  150  1e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3964  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  40.34 
 
 
193 aa  149  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.58086  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21800  DNA-3-methyladenine glycosylase I  41.24 
 
 
225 aa  149  2e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000054024  normal  0.248361 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0312  DNA-3-methyladenine glycosylase I  42.05 
 
 
201 aa  149  2e-35  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.547447  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3828  DNA-3-methyladenine glycosylase I  43.6 
 
 
198 aa  148  3e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.874293  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3856  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  40.46 
 
 
193 aa  148  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0010  DNA-3-methyladenine glycosylase I  40.57 
 
 
187 aa  149  3e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00154604  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4305  DNA-3-methyladenine glycosylase I  41.48 
 
 
209 aa  149  3e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0810  DNA-3-methyladenine glycosylase I  42.77 
 
 
192 aa  148  4e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0581984  hitchhiker  0.00269095 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0857  DNA-3-methyladenine glycosylase I  41.04 
 
 
198 aa  148  4e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.671236  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0477  3-methyladenine DNA glycosylase  42.46 
 
 
196 aa  148  5e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0571733  normal  0.984687 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0241  DNA-3-methyladenine glycosylase I  40.11 
 
 
195 aa  147  7e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3581  DNA-3-methyladenine glycosylase I  43.93 
 
 
191 aa  147  7e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23730  DNA-3-methyladenine glycosylase I  41.99 
 
 
183 aa  147  8e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00337474  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2291  DNA-3-methyladenine glycosylase I  40.57 
 
 
186 aa  147  9e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0058  DNA-3-methyladenine glycosylase I  39.31 
 
 
212 aa  146  1.0000000000000001e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2095  DNA-3-methyladenine glycosylase I  39.66 
 
 
183 aa  147  1.0000000000000001e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4674  DNA-3-methyladenine glycosylase I  40.91 
 
 
209 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.818815  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4332  DNA-3-methyladenine glycosylase I  40.91 
 
 
208 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.239227 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1178  DNA-3-methyladenine glycosylase I  44.32 
 
 
198 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00524762  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2227  DNA-3-methyladenine glycosylase I  40.7 
 
 
199 aa  146  1.0000000000000001e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.62127  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06360  DNA-3-methyladenine glycosylase I  41.04 
 
 
193 aa  147  1.0000000000000001e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2148  DNA-3-methyladenine glycosylase I  44.94 
 
 
199 aa  146  1.0000000000000001e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00177072  hitchhiker  0.0095029 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4052  DNA-3-methyladenine glycosylase I  44.25 
 
 
217 aa  145  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3701  DNA-3-methyladenine glycosylase I  42.53 
 
 
197 aa  146  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1566  DNA-3-methyladenine glycosylase I  43.27 
 
 
199 aa  146  2.0000000000000003e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.26816 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2374  DNA-3-methyladenine glycosylase I  40.91 
 
 
208 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.218826 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3559  DNA-3-methyladenine glycosylase I  42.11 
 
 
187 aa  146  2.0000000000000003e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.284448 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5808  3-methyladenine-DNA glycosylase  41.01 
 
 
215 aa  145  3e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04190  DNA-3-methyladenine glycosylase I  41.62 
 
 
201 aa  145  3e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.589142  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0687  DNA-3-methyladenine glycosylase I  43.89 
 
 
263 aa  145  3e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.215345 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1473  DNA-3-methyladenine glycosylase I  38.95 
 
 
190 aa  145  3e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.333166  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4680  DNA-3-methyladenine glycosylase I  44.77 
 
 
185 aa  145  3e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.651754  normal  0.992066 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0097  DNA-3-methyladenine glycosylase I  40.68 
 
 
214 aa  145  3e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.235254  normal  0.805383 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2154  DNA-3-methyladenine glycosylase I  42.46 
 
 
241 aa  145  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1237  DNA-3-methyladenine glycosylase I  42.05 
 
 
217 aa  145  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2725  DNA-3-methyladenine glycosylase I  44.19 
 
 
187 aa  145  4.0000000000000006e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0108  DNA-3-methyladenine glycosylase I  43.83 
 
 
197 aa  145  4.0000000000000006e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0040  DNA-3-methyladenine glycosylase I  39.88 
 
 
186 aa  144  5e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0656  hypothetical protein  41.81 
 
 
190 aa  144  5e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0075  3-methyladenine DNA glycosylase  39.62 
 
 
184 aa  144  5e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00000223645  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0014  DNA-3-methyladenine glycosylase I  40.23 
 
 
200 aa  144  6e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0102454 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0794  DNA-3-methyladenine glycosylase I  37.64 
 
 
186 aa  144  6e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0008  DNA-3-methyladenine glycosylase I  40.23 
 
 
198 aa  144  7.0000000000000006e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0016  DNA-3-methyladenine glycosidase I  39.66 
 
 
191 aa  144  7.0000000000000006e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0014  DNA-3-methyladenine glycosylase I  40.23 
 
 
200 aa  144  7.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000164435 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4683  DNA-3-methyladenine glycosylase I  40.22 
 
 
187 aa  144  7.0000000000000006e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0498  DNA-3-methyladenine glycosylase I  40.8 
 
 
218 aa  144  8.000000000000001e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.539356  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0010  DNA-3-methyladenine glycosylase I  40.23 
 
 
191 aa  144  8.000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0579886 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0018  DNA-3-methyladenine glycosylase I  40.23 
 
 
191 aa  144  8.000000000000001e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000168083 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1888  DNA-3-methyladenine glycosylase I  41.38 
 
 
200 aa  144  8.000000000000001e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0011  DNA-3-methyladenine glycosylase I  39.43 
 
 
189 aa  144  8.000000000000001e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00532682 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1686  DNA-3-methyladenine glycosylase  40.12 
 
 
212 aa  144  9e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00244866  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>