More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_2380 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_2380  peptide chain release factor 1  100 
 
 		 365 aa  734    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.254087 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2760  peptide chain release factor 1  100 
 
 		 365 aa  734    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2474  peptide chain release factor 1  60.5 
 
 		 360 aa  456  1e-127  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1051  peptide chain release factor 1  62.36 
 
 		 360 aa  449  1e-125  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0598725  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02573  peptide chain release factor 1  61.13 
 
 		 361 aa  446  1.0000000000000001e-124  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0263327  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0509  peptide chain release factor 1  60.22 
 
 		 360 aa  442  1e-123  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2360  peptide chain release factor 1  58.29 
 
 		 363 aa  444  1e-123  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1424  peptide chain release factor 1  62.29 
 
 		 360 aa  444  1e-123  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.997988  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0278  peptide chain release factor 1  61.73 
 
 		 361 aa  443  1e-123  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.728879  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0733  peptide chain release factor 1  60.11 
 
 		 360 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1060  peptide chain release factor 1  59.56 
 
 		 360 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0761  peptide chain release factor 1  60.11 
 
 		 360 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.169079  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2284  peptide chain release factor 1  56.11 
 
 		 362 aa  440  9.999999999999999e-123  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2257  peptide chain release factor 1  56.11 
 
 		 362 aa  440  9.999999999999999e-123  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0769  peptide chain release factor 1  59.15 
 
 		 363 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.081149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0436  peptide chain release factor 1  58.45 
 
 		 360 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4456  peptide chain release factor 1  59.56 
 
 		 360 aa  434  1e-121  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3833  peptide chain release factor 1  58.87 
 
 		 363 aa  436  1e-121  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0949  peptide chain release factor 1  60.39 
 
 		 360 aa  436  1e-121  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0801  peptide chain release factor 1  58.87 
 
 		 363 aa  436  1e-121  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00710906  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2721  peptide chain release factor 1  57.34 
 
 		 360 aa  435  1e-121  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0119  peptide chain release factor 1  58.22 
 
 		 361 aa  436  1e-121  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000299484  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3522  peptide chain release factor 1  57.34 
 
 		 360 aa  434  1e-121  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.217548  normal  0.148888 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3169  peptide chain release factor 1  58.87 
 
 		 363 aa  436  1e-121  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0178961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0797  peptide chain release factor 1  58.87 
 
 		 363 aa  436  1e-121  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0297796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2064  peptide chain release factor 1  58.22 
 
 		 361 aa  436  1e-121  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.243868  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2566  peptide chain release factor 1  60.56 
 
 		 363 aa  437  1e-121  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0384672  normal  0.342733 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1943  peptide chain release factor 1  57.34 
 
 		 360 aa  432  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.640725  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1109  peptide chain release factor 1  61.06 
 
 		 360 aa  433  1e-120  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0504  peptide chain release factor 1  57.34 
 
 		 360 aa  432  1e-120  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3603  peptide chain release factor 1  57.34 
 
 		 360 aa  431  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3597  peptide chain release factor 1  57.06 
 
 		 360 aa  432  1e-120  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0972  peptide chain release factor 1  57.34 
 
 		 360 aa  432  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0793395  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2930  peptide chain release factor 1  57.34 
 
 		 360 aa  432  1e-120  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0482  peptide chain release factor 1  57.06 
 
 		 360 aa  431  1e-120  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.464905 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3614  peptide chain release factor 1  57.34 
 
 		 360 aa  431  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.528922  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3590  peptide chain release factor 1  57.34 
 
 		 360 aa  431  1e-120  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.637465  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0440  peptide chain release factor 1  57.62 
 
 		 360 aa  434  1e-120  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.518401 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2595  peptide chain release factor 1  57.06 
 
 		 360 aa  431  1e-120  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.324585  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2563  peptide chain release factor 1  57.46 
 
 		 362 aa  434  1e-120  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.273749  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0774  peptide chain release factor 1  59.28 
 
 		 360 aa  434  1e-120  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0414  peptide chain release factor 1  57.62 
 
 		 360 aa  434  1e-120  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.592527  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61700  peptide chain release factor 1  61.9 
 
 		 360 aa  434  1e-120  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0384277 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0676  peptide chain release factor 1  57.34 
 
 		 360 aa  432  1e-120  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0510  peptide chain release factor 1  57.06 
 
 		 360 aa  431  1e-120  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.206813  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0696  peptide chain release factor 1  58.59 
 
 		 363 aa  430  1e-119  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0264279  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3737  peptide chain release factor 1  58.59 
 
 		 363 aa  430  1e-119  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0200456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2493  peptide chain release factor 1  61.36 
 
 		 360 aa  429  1e-119  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3546  peptide chain release factor 1  58.59 
 
 		 363 aa  430  1e-119  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00646422  hitchhiker  0.0000410243 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3126  peptide chain release factor 1  58.47 
 
 		 361 aa  430  1e-119  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000819953  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0994  peptide chain release factor 1  57.73 
 
 		 363 aa  431  1e-119  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3614  peptide chain release factor 1  58.59 
 
 		 363 aa  431  1e-119  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000815596  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2888  peptide chain release factor 1  57.06 
 
 		 360 aa  429  1e-119  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.362694 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0340  peptide chain release factor 1  61.36 
 
 		 361 aa  426  1e-118  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3685  peptide chain release factor 1  58.03 
 
 		 361 aa  425  1e-118  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0369473  normal  0.712251 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0920  peptide chain release factor 1  56.9 
 
 		 361 aa  425  1e-118  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000562935  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0522  peptide chain release factor 1  61.05 
 
 		 361 aa  424  1e-117  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3459  peptide chain release factor 1  56.9 
 
 		 361 aa  422  1e-117  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.439809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2912  peptide chain release factor 1  58.17 
 
 		 361 aa  422  1e-117  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0107492  normal  0.707414 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5314  peptide chain release factor 1  61.9 
 
 		 360 aa  421  1e-117  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3044  peptide chain release factor 1  56.46 
 
 		 360 aa  420  1e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3599  peptide chain release factor 1  56.98 
 
 		 362 aa  418  1e-116  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0389  peptide chain release factor 1  55.03 
 
 		 363 aa  418  1e-116  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.802059  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2337  peptide chain release factor 1  56.79 
 
 		 360 aa  420  1e-116  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1756  peptide chain release factor 1  54.93 
 
 		 362 aa  420  1e-116  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000801734  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1856  peptide chain release factor 1  57.87 
 
 		 361 aa  418  1e-116  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.227654  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3201  peptide chain release factor 1  55.8 
 
 		 360 aa  421  1e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0723  peptide chain release factor 1  56.62 
 
 		 361 aa  418  1e-116  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.905014  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3552  peptide chain release factor 1  54.8 
 
 		 362 aa  415  9.999999999999999e-116  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0245342  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0523  peptide chain release factor 1  60.72 
 
 		 359 aa  415  9.999999999999999e-116  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.19675 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1457  peptide chain release factor 1  52.81 
 
 		 364 aa  415  9.999999999999999e-116  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0262209  normal  0.168501 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0780  peptide chain release factor 1  57.88 
 
 		 367 aa  415  9.999999999999999e-116  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.328101  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0136  peptide chain release factor 1  55.4 
 
 		 359 aa  417  9.999999999999999e-116  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.056338  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4748  peptide chain release factor 1  59 
 
 		 360 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.242955  normal  0.0645708 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0851  peptide chain release factor 1  57.88 
 
 		 367 aa  415  9.999999999999999e-116  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.376649  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2641  peptide chain release factor 1  55.4 
 
 		 358 aa  415  9.999999999999999e-116  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004203  peptide chain release factor 1  54.49 
 
 		 362 aa  417  9.999999999999999e-116  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0254288  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0950  peptide chain release factor 1  55.71 
 
 		 360 aa  417  9.999999999999999e-116  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.568062  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1607  peptide chain release factor 1  56.86 
 
 		 363 aa  416  9.999999999999999e-116  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.317089  normal  0.894834 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2901  peptide chain release factor 1  55.8 
 
 		 360 aa  412  1e-114  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2072  peptide chain release factor 1  59.43 
 
 		 360 aa  412  1e-114  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.132752  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1529  peptide chain release factor 1  58.24 
 
 		 361 aa  414  1e-114  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3146  peptide chain release factor 1  55.25 
 
 		 360 aa  414  1e-114  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0205917 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0148  peptide chain release factor 1  55.8 
 
 		 359 aa  414  1e-114  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.570569  normal  0.18601 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01250  peptide chain release factor 1  53.93 
 
 		 362 aa  413  1e-114  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2798  peptide chain release factor 1  54.7 
 
 		 360 aa  411  1e-113  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41470  peptide chain release factor 1  59.38 
 
 		 360 aa  410  1e-113  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.711816  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5476  peptide chain release factor 1  56.9 
 
 		 360 aa  406  1.0000000000000001e-112  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1053  peptide chain release factor 1  51.69 
 
 		 362 aa  407  1.0000000000000001e-112  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.520226  normal  0.650406 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2692  peptide chain release factor 1  56 
 
 		 356 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000179951  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1913  peptide chain release factor 1  58.15 
 
 		 360 aa  405  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.305061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3251  peptide chain release factor 1  58.17 
 
 		 360 aa  407  1.0000000000000001e-112  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.227833  normal  0.0955024 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1411  peptide chain release factor 1  51.69 
 
 		 362 aa  406  1.0000000000000001e-112  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.768001  normal  0.731774 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0790  peptide chain release factor 1  52.53 
 
 		 362 aa  406  1.0000000000000001e-112  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.224449  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2436  peptide chain release factor 1  57.87 
 
 		 360 aa  404  1e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000671796  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1363  peptide chain release factor 1  57.87 
 
 		 360 aa  404  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000133324  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1931  peptide chain release factor 1  57.87 
 
 		 360 aa  404  1e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000608431  normal  0.0690317 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2415  peptide chain release factor 1  57.87 
 
 		 360 aa  404  1e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00102463  hitchhiker  0.000030401 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1547  peptide chain release factor 1  57.87 
 
 		 360 aa  404  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.891695  normal  0.256018 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0451  peptide chain release factor 1  55.49 
 
 		 357 aa  404  1e-111  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>