More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_1746 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011206  Lferr_1746  peptidase M48 Ste24p  100 
 
 
313 aa  624  1e-178  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0403814 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2090  peptidase, M48 family  100 
 
 
313 aa  624  1e-178  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.750108  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1572  peptidase M48, Ste24p  47.23 
 
 
321 aa  222  4.9999999999999996e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0369731  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1189  M48 family peptidase  40.89 
 
 
316 aa  196  6e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0329085  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1109  peptidase M48 Ste24p  40.58 
 
 
316 aa  192  5e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.319279  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2161  M48 family peptidase  40.13 
 
 
319 aa  191  1e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.117375  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2125  peptidase M48 Ste24p  42.22 
 
 
321 aa  189  5e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.438964  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2025  peptidase M48, Ste24p  39.48 
 
 
331 aa  182  5.0000000000000004e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.112072 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2307  peptidase M48 Ste24p  38.56 
 
 
321 aa  179  4e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.80067  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1159  peptidase M48, Ste24p  38.03 
 
 
330 aa  179  4e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.800852  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1347  peptidase M48, Ste24p  39.11 
 
 
331 aa  177  1e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.414875 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0550  peptidase M48, Ste24p  46.28 
 
 
320 aa  177  2e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000111224  hitchhiker  0.000685089 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3388  peptidase M48, Ste24p  37.38 
 
 
321 aa  176  5e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.580717  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3419  M48 family peptidase  40.65 
 
 
321 aa  176  5e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0615  peptidase M48 Ste24p  38.71 
 
 
321 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.456221 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3406  M48 family peptidase  31.76 
 
 
306 aa  149  6e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.3096  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0312  M48 family peptidase  30.58 
 
 
285 aa  140  3e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.632212  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3393  heat shock protein HtpX  37.9 
 
 
291 aa  139  6e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.892823  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4413  M48 family peptidase  30.24 
 
 
296 aa  139  7e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.631317 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3563  M48 family peptidase  31.21 
 
 
286 aa  139  7e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0908  heat shock protein HtpX  33.69 
 
 
280 aa  136  6.0000000000000005e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.906827 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0285  M48 family peptidase  29.86 
 
 
283 aa  135  7.000000000000001e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.543465  normal  0.0172766 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3384  peptidase M48 Ste24p  32.06 
 
 
283 aa  134  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.414288 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0145  M48 family peptidase  29.55 
 
 
285 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0349  M48 family peptidase  29.55 
 
 
285 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0154  M48 family peptidase  29.55 
 
 
285 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.438309  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2802  M48 family peptidase  29.55 
 
 
285 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0163  M48 family peptidase  29.55 
 
 
285 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3121  M48 family peptidase  29.9 
 
 
285 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.19734 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2278  M48 family peptidase  29.55 
 
 
285 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.564612  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2356  M48 family peptidase  29.55 
 
 
285 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3062  M48 family peptidase  29.55 
 
 
285 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6475  M48 family peptidase  29.55 
 
 
285 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0131  M48 family peptidase  29.55 
 
 
285 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2510  M48 family peptidase  29.9 
 
 
285 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3179  M48 family peptidase  29.55 
 
 
285 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3140  M48 family peptidase  29.9 
 
 
285 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.911826  normal  0.757645 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3124  M48 family peptidase  29.9 
 
 
285 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.840919  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0038  M48 family peptidase  28.87 
 
 
285 aa  129  6e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0185  M48 family peptidase  29.76 
 
 
279 aa  129  7.000000000000001e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000166167 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3675  M48 family peptidase  29.05 
 
 
286 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0074  M48 family peptidase  29.05 
 
 
286 aa  127  3e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.123585  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3352  M48 family peptidase  29.05 
 
 
286 aa  127  3e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1445  peptidase M48  32.2 
 
 
289 aa  126  6e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4360  heat shock protein HtpX  33.64 
 
 
294 aa  125  7e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4120  peptidase M48 Ste24p  31.51 
 
 
296 aa  125  1e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00365351 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1776  M48 family peptidase  27.7 
 
 
288 aa  125  1e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1819  peptidase M48 Ste24p  30.58 
 
 
283 aa  125  1e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.376648  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3358  peptidase M48 Ste24p  31.7 
 
 
297 aa  124  2e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000541499  hitchhiker  0.000159799 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1327  peptidase M48 Ste24p  30.41 
 
 
287 aa  123  4e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.533301  hitchhiker  0.000000000342604 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0023  M48 family peptidase  28.37 
 
 
280 aa  122  8e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.404205 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0694  peptidase M48, Ste24p  32.64 
 
 
292 aa  121  9.999999999999999e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.264807  normal  0.558522 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0071  heat shock protein HtpX  29.52 
 
 
343 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000193104  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0088  heat shock protein HtpX  29.66 
 
 
289 aa  120  3e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.565985  normal  0.068582 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0242  heat shock protein  35.71 
 
 
279 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10573  heat shock protein HtpX  29.39 
 
 
286 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.346873 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0879  M48 family peptidase  30.77 
 
 
288 aa  117  1.9999999999999998e-25  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.631833  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3243  peptidase M48, Ste24p  28.87 
 
 
282 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000873344  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0890  peptidase M48 Ste24p  29.19 
 
 
296 aa  116  3.9999999999999997e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000209809  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0189  heat shock protein HtpX  28.52 
 
 
307 aa  115  7.999999999999999e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.160092  normal  0.264945 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1335  peptidase M48, Ste24p  27.2 
 
 
397 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000442106  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0368  peptidase M48 Ste24p  28.22 
 
 
282 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00001732  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3276  peptidase M48 Ste24p  28.11 
 
 
285 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0502019  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3417  heat shock protein HtpX  29.17 
 
 
313 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2923  heat shock protein HtpX  31.23 
 
 
298 aa  114  2.0000000000000002e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0421  peptidase M48, Ste24p  29.35 
 
 
279 aa  114  3e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000540856  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3563  peptidase M48 Ste24p  28.87 
 
 
285 aa  114  3e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0993  heat shock protein HtpX  28.9 
 
 
296 aa  113  5e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.653344  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0833  peptidase M48 Ste24p  30.27 
 
 
283 aa  112  6e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1928  peptidase M48, Ste24p  32.23 
 
 
296 aa  112  6e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.987117  normal  0.0132867 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5252  heat shock protein HtpX  29.79 
 
 
292 aa  112  6e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1349  heat shock protein htpX  30.13 
 
 
312 aa  112  8.000000000000001e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6075  heat shock protein HtpX  29.59 
 
 
290 aa  112  8.000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.143037 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0144  HtpX-2 peptidase  30.42 
 
 
281 aa  112  9e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.824625 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1579  M48 family peptidase  29.18 
 
 
289 aa  112  9e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.988956  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4243  heat shock protein HtpX  30.21 
 
 
320 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.123521 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0750  peptidase M48, Ste24p  29.45 
 
 
286 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0193162  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0767  heat shock protein HtpX  28.67 
 
 
291 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.818145 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0786  heat shock protein HtpX  28.67 
 
 
291 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.790801  normal  0.91638 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3579  heat shock protein HtpX  30.58 
 
 
293 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.421936  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1103  peptidase M48 Ste24p  29.31 
 
 
292 aa  112  1.0000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.497475  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1982  peptidase M48, Ste24p  30.99 
 
 
294 aa  112  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.333894  normal  0.247951 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0772  heat shock protein HtpX  28.67 
 
 
291 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0554  peptidase M48 Ste24p  29.53 
 
 
285 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000177743  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3260  peptidase M48 Ste24p  30.93 
 
 
294 aa  112  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.741815 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0879  peptidase M48 Ste24p  30.64 
 
 
295 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4296  protease heat shock protein  28.48 
 
 
342 aa  111  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.591258  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1342  M48 family peptidase  30.86 
 
 
286 aa  111  2.0000000000000002e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000392563  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3918  heat shock protein HtpX  30.21 
 
 
320 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.03163  normal  0.594481 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2035  peptidase M48 Ste24p  30.14 
 
 
297 aa  110  3e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.944318  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3569  peptidase M48, Ste24p  32.22 
 
 
285 aa  110  3e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000538861  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0554  heat shock protein HtpX  32.52 
 
 
300 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2206  heat shock protein HtpX  32.52 
 
 
300 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.116706  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0034  heat shock protein HtpX  29.51 
 
 
317 aa  110  4.0000000000000004e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.900094 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6655  peptidase M48 Ste24p  32.17 
 
 
286 aa  110  4.0000000000000004e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.296032  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0093  M48 family peptidase  28.87 
 
 
279 aa  109  5e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.500994  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1269  peptidase M48, Ste24p  28.87 
 
 
282 aa  109  5e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.293917 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4377  peptidase M48 Ste24p  30.77 
 
 
284 aa  109  6e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2697  peptidase M48 Ste24p  28.92 
 
 
289 aa  109  7.000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0675  peptidase M48, Ste24p  28.85 
 
 
283 aa  109  8.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>