112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3620 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_3620  phosphoesterase PA-phosphatase related  100 
 
 		 311 aa  587  1e-167  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000326063 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1042  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  41.71 
 
 		 282 aa  98.2  1e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2515  hypothetical protein  34.86 
 
 		 296 aa  79  0.00000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00069207  normal  0.734956 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0037  phosphoesterase, PA-phosphatase related  32.77 
 
 		 272 aa  76.6  0.0000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3550  phosphoesterase, PA-phosphatase related  37.82 
 
 		 278 aa  74.7  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.62844 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0547  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.01 
 
 		 261 aa  66.6  0.0000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0347407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1770  glycosyltransferase  27.57 
 
 		 812 aa  63.9  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1412  phosphoesterase, PA-phosphatase related  28.5 
 
 		 263 aa  62.8  0.000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.98368  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0036  phosphoesterase, PA-phosphatase related  42.22 
 
 		 273 aa  62.4  0.000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4760  phosphoesterase PA-phosphatase related  30.85 
 
 		 279 aa  59.7  0.00000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000169741 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0148  hypothetical protein  31.74 
 
 		 266 aa  58.9  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1644  phosphoesterase PA-phosphatase related  36.7 
 
 		 201 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.126989  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5285  phosphoesterase PA-phosphatase related  36.7 
 
 		 201 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.965621  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5353  lipoprotein signal peptidase  39.08 
 
 		 357 aa  58.2  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00779044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3046  phosphoesterase, PA-phosphatase related  34.17 
 
 		 299 aa  57.4  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.560501  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5948  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase /lipoprotein signal peptidase involved in Pb(II) resistance PbrB/C  32.97 
 
 		 358 aa  57  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.418988 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1131  phosphoesterase, PA-phosphatase related  36.84 
 
 		 198 aa  57  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4761  phosphoesterase PA-phosphatase related  35.29 
 
 		 280 aa  57  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000159664 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1491  phosphoesterase, PA-phosphatase related  35.45 
 
 		 157 aa  56.6  0.0000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0940557  normal  0.0672657 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4447  phosphoesterase PA-phosphatase related  32.28 
 
 		 274 aa  55.8  0.0000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.626562  hitchhiker  0.00229166 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1280  PAP2 family protein  39.13 
 
 		 185 aa  55.5  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0275929  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1814  lipoprotein signal peptidase  47.19 
 
 		 358 aa  55.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.344803 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1102  phosphatase  37.68 
 
 		 185 aa  54.7  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0240643  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2288  phosphoesterase PA-phosphatase related  29.45 
 
 		 205 aa  54.7  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0637  phosphoesterase PA-phosphatase related  40.34 
 
 		 208 aa  54.7  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1791  phosphoesterase PA-phosphatase related  36.36 
 
 		 225 aa  53.1  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.824897  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1773  PAP2 superfamily protein  43.9 
 
 		 445 aa  52.8  0.000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2555  phosphoesterase PA-phosphatase related  38.94 
 
 		 271 aa  52  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.729938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0983  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  39.47 
 
 		 227 aa  51.6  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2545  phosphoesterase PA-phosphatase related  37.21 
 
 		 242 aa  51.6  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0634  phosphoesterase, PA-phosphatase related  35.64 
 
 		 178 aa  50.8  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000602311  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0891  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  40.74 
 
 		 199 aa  50.1  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.467652  normal  0.655955 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2504  phosphoesterase, PA-phosphatase related  30.5 
 
 		 331 aa  50.4  0.00004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.104215  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3463  lipoprotein signal peptidase  39.2 
 
 		 359 aa  50.4  0.00004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4320  signal peptidase II  39.2 
 
 		 359 aa  50.4  0.00004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1778  phosphoesterase, PA-phosphatase related  22.92 
 
 		 182 aa  50.4  0.00004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1243  signal peptidase II  35.59 
 
 		 364 aa  49.7  0.00006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1037  phosphoesterase PA-phosphatase related  40 
 
 		 200 aa  49.7  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000361007  hitchhiker  0.00000179156 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0918  PAP2 family protein  40 
 
 		 200 aa  49.7  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.791764  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0313  phosphoesterase, PA-phosphatase related  28.87 
 
 		 305 aa  49.3  0.00008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.512715  normal  0.330674 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2147  phosphoesterase PA-phosphatase related  37.35 
 
 		 178 aa  49.3  0.00008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.913624  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3368  phosphoesterase, PA-phosphatase related  35.48 
 
 		 176 aa  49.3  0.00009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2234  phosphoesterase, PA-phosphatase related  34.34 
 
 		 268 aa  49.3  0.00009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4813  PAP2 family protein/DedA family protein  37.5 
 
 		 438 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.609495 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4138  phosphoesterase, PA-phosphatase related  32.58 
 
 		 499 aa  48.1  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4688  phosphoesterase, PA-phosphatase related  37.5 
 
 		 438 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4866  phosphoesterase PA-phosphatase related  37.5 
 
 		 438 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.374239  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2434  phosphoesterase PA-phosphatase related  39.81 
 
 		 240 aa  48.1  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.678112  normal  0.535844 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4605  phosphoesterase PA-phosphatase related  35.96 
 
 		 249 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0570906 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1840  PAP2 family protein  33.93 
 
 		 272 aa  47.4  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07455  hypothetical protein  29.75 
 
 		 187 aa  47.4  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0607  phosphoesterase, PA-phosphatase related  38.54 
 
 		 179 aa  47  0.0004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00776566  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2178  phosphoesterase, PA-phosphatase related  28.96 
 
 		 166 aa  47  0.0004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0931  phosphoesterase PA-phosphatase related  35.79 
 
 		 189 aa  47  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2990  phosphoesterase PA-phosphatase related  37.29 
 
 		 255 aa  47  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3095  phosphoesterase PA-phosphatase related  37.29 
 
 		 255 aa  47  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4469  phosphoesterase, PA-phosphatase related  30.36 
 
 		 251 aa  46.6  0.0006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3600  phosphoesterase PA-phosphatase related  39.71 
 
 		 171 aa  46.2  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000568068  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2216  phosphoesterase, PA-phosphatase related  30.23 
 
 		 245 aa  46.2  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.322102 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6959  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  29.2 
 
 		 244 aa  46.2  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.190723  normal  0.122006 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0608  phosphoesterase PA-phosphatase related  37.65 
 
 		 438 aa  46.2  0.0007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1340  phosphoesterase PA-phosphatase related  36 
 
 		 249 aa  46.2  0.0007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.130328  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0530  phosphoesterase, PA-phosphatase related  43.48 
 
 		 199 aa  45.8  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.126296  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4001  phosphoesterase, PA-phosphatase related  35.92 
 
 		 211 aa  46.2  0.0008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.371815  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0878  phosphoesterase PA-phosphatase related  22.4 
 
 		 182 aa  45.8  0.0009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.749948  hitchhiker  0.002123 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0466  phosphoesterase, PA-phosphatase related  38.38 
 
 		 207 aa  45.4  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2784  phosphoesterase, PA-phosphatase related  30.58 
 
 		 442 aa  45.1  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.952787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3788  phosphoesterase PA-phosphatase related  28.26 
 
 		 169 aa  45.1  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00209  phosphoesterase, PA-phosphatase related  38.16 
 
 		 172 aa  45.1  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1443  PAP2 family protein  27.74 
 
 		 214 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.253975  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3574  phosphoesterase PA-phosphatase related  34.21 
 
 		 267 aa  45.4  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6735  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  38.89 
 
 		 245 aa  45.4  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.418259 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2185  phosphoesterase PA-phosphatase related  25.66 
 
 		 257 aa  45.4  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.303622  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2905  phosphoesterase, PA-phosphatase related  35.78 
 
 		 255 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4071  phosphoesterase, PA-phosphatase related  41.94 
 
 		 169 aa  44.7  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00821  phospholipid phosphatase  36.52 
 
 		 182 aa  44.3  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3250  phosphoesterase PA-phosphatase related  34.21 
 
 		 267 aa  45.1  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00807425 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3446  phosphoesterase PA-phosphatase related  34.68 
 
 		 267 aa  45.1  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1827  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  35.96 
 
 		 282 aa  44.7  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.680362  normal  0.31058 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0562  phosphoesterase PA-phosphatase related  42.39 
 
 		 199 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0152242  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0559  phosphoesterase PA-phosphatase related  42.39 
 
 		 199 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4017  phosphoesterase PA-phosphatase related  41.43 
 
 		 290 aa  44.7  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.193202  normal  0.169945 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1402  PAP2 family protein  25.55 
 
 		 205 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1347  phosphoesterase, PA-phosphatase related  30.7 
 
 		 392 aa  44.3  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.423681  hitchhiker  0.0000000949183 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0786  phosphoesterase, PA-phosphatase related  38.64 
 
 		 179 aa  43.9  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000027355 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1969  phosphoesterase, PA-phosphatase related  37.33 
 
 		 253 aa  43.9  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.175709  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1039  phosphoesterase PA-phosphatase related  25.44 
 
 		 183 aa  43.9  0.003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0828  phosphoesterase PA-phosphatase related  35.09 
 
 		 252 aa  43.9  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00238614 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0154  phosphoesterase PA-phosphatase related  35.09 
 
 		 249 aa  44.3  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6892  phosphoesterase PA-phosphatase related  39.58 
 
 		 251 aa  44.3  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.757531 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0639  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.68 
 
 		 185 aa  44.3  0.003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.198264  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0463  Undecaprenyl-diphosphatase  31.78 
 
 		 219 aa  43.5  0.004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.282936  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4976  phosphoesterase, PA-phosphatase-like  37.72 
 
 		 438 aa  43.9  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.135729  normal  0.744864 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2554  phosphoesterase, PA-phosphatase related  39.53 
 
 		 280 aa  43.9  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.163921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5863  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  37.63 
 
 		 168 aa  43.5  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3219  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  36.84 
 
 		 230 aa  43.5  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0634  membrane-associated phospholipid phosphatase  28.72 
 
 		 217 aa  43.5  0.005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0423  phosphoesterase PA-phosphatase related  33.64 
 
 		 241 aa  43.1  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2785  bacitracin transport permease  31.48 
 
 		 199 aa  43.1  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0349348  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1341  PAP2 family protein  28.47 
 
 		 215 aa  43.1  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>