24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1423 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_1423  immunoglobulin I-set domain-containing protein  100 
 
 		 139 aa  277  3e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0496  Immunoglobulin I-set domain protein  44.71 
 
 		 1550 aa  62.4  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0179971  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0327  Alpha-N-arabinofuranosidase  46.94 
 
 		 1221 aa  57.4  0.00000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.495752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3065  PA14 domain-containing protein  44.05 
 
 		 14944 aa  57  0.00000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2184  immunoglobulin I-set domain-containing protein  40.45 
 
 		 1507 aa  56.2  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2366  Htaa domain protein  36 
 
 		 1127 aa  55.5  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.527032  normal  0.0458127 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0312  hypothetical protein  44.71 
 
 		 3563 aa  54.7  0.0000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.61904 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0854  immunoglobulin I-set domain-containing protein  37.38 
 
 		 1607 aa  54.3  0.0000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0938  hypothetical protein  45.33 
 
 		 1969 aa  51.6  0.000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04803  hypothetical protein  31.67 
 
 		 441 aa  50.8  0.000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.576008  normal  0.151498 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2167  YD repeat-containing protein  35.05 
 
 		 2003 aa  50.4  0.000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154621 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0556  immunoglobulin I-set domain-containing protein  40.96 
 
 		 1130 aa  49.7  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.329662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0939  hypothetical protein  35.94 
 
 		 1976 aa  48.5  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0134792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2434  cell wall/surface repeat protein  41.67 
 
 		 2207 aa  47.8  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3237  glycoside hydrolase family protein  40.74 
 
 		 1195 aa  47  0.00008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414155 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0313  immunoglobulin I-set domain-containing protein  40.96 
 
 		 887 aa  46.2  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.488254  normal  0.343901 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2854  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  32.71 
 
 		 1292 aa  45.8  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0274394  normal  0.093276 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5117  Carbohydrate binding family 6  37.35 
 
 		 1132 aa  45.8  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.17685 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1999  immunoglobulin I-set domain-containing protein  34.78 
 
 		 1362 aa  42.7  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.354516  normal  0.677634 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2870  hypothetical protein  34.21 
 
 		 1243 aa  42.7  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.772535  hitchhiker  0.00123304 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1341  conserved repeat domain protein  30.63 
 
 		 1668 aa  42.4  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.831003 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3324  carbohydrate-binding family 6 protein  32.58 
 
 		 972 aa  41.6  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0852  immunoglobulin I-set domain-containing protein  41.43 
 
 		 1176 aa  41.2  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4612  immunoglobulin I-set domain-containing protein  32.22 
 
 		 714 aa  40  0.01  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.830673  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>