71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0781 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_0781  hypothetical protein  100 
 
 		 295 aa  608  1e-173  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000001098 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1665  putative F plasmid protein  77.7 
 
 		 287 aa  451  1.0000000000000001e-126  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0729576  normal  0.601822 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1782  putative F plasmid gene 32-like protein  59.43 
 
 		 277 aa  348  9e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6929  hypothetical protein  58.01 
 
 		 275 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.247635  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2571  putative F plasmid gene 32-like protein  55.87 
 
 		 277 aa  330  2e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0478  hypothetical protein  55.16 
 
 		 277 aa  329  3e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.724029  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2944  hypothetical protein  57.3 
 
 		 275 aa  327  2.0000000000000001e-88  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.410202  normal  0.63653 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2734  hypothetical protein  56.94 
 
 		 275 aa  325  4.0000000000000003e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3034  hypothetical protein  56.94 
 
 		 275 aa  325  4.0000000000000003e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.195535 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2611  protein of unknown function DUF932  57.86 
 
 		 274 aa  324  9e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.30719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2321  hypothetical protein  56.58 
 
 		 275 aa  323  2e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.555725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1477  hypothetical protein  56.58 
 
 		 276 aa  323  2e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1973  hypothetical protein  56.94 
 
 		 274 aa  322  3e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0468  hypothetical protein  57.14 
 
 		 274 aa  322  4e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0679  hypothetical protein  56.94 
 
 		 274 aa  322  5e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2835  protein of unknown function DUF932  56.94 
 
 		 275 aa  320  1.9999999999999998e-86  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.254935  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1244  hypothetical protein  58.01 
 
 		 274 aa  319  3e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0562318 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1869  protein of unknown function DUF932  57.65 
 
 		 274 aa  318  7.999999999999999e-86  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31200  hypothetical protein  57.65 
 
 		 274 aa  318  9e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000120267  unclonable  1.6824e-22 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2639  hypothetical protein  57.65 
 
 		 274 aa  317  1e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.562022  normal  0.0586282 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3741  hypothetical protein  56.23 
 
 		 276 aa  317  2e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2041  hypothetical protein  55.76 
 
 		 273 aa  317  2e-85  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00582058  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0664  protein of unknown function DUF932  55.52 
 
 		 275 aa  316  3e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.865139 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2618  homologue to gene 32 protein of F plasmid  55.87 
 
 		 276 aa  315  6e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1276  protein of unknown function DUF932  57.65 
 
 		 274 aa  315  7e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4210  hypothetical protein  58.72 
 
 		 274 aa  315  8e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.0000000592317  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3535  protein of unknown function DUF932  55.52 
 
 		 276 aa  314  9.999999999999999e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5400  protein of unknown function DUF932  60.58 
 
 		 275 aa  314  9.999999999999999e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4995  protein of unknown function DUF932  59.85 
 
 		 275 aa  314  9.999999999999999e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0426401  normal  0.148352 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2321  hypothetical protein  55.71 
 
 		 275 aa  313  2.9999999999999996e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000877089  hitchhiker  0.0000215746 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4158  hypothetical protein  57.5 
 
 		 275 aa  311  6.999999999999999e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0629718 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4156  hypothetical protein  56.58 
 
 		 275 aa  305  4.0000000000000004e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.418419  normal  0.860751 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0030  hypothetical protein  54.98 
 
 		 278 aa  300  3e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0366118  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0025  hypothetical protein  54.32 
 
 		 278 aa  296  2e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0000725071  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7557  hypothetical protein  56.79 
 
 		 274 aa  296  3e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0368604 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0045  hypothetical protein  48.4 
 
 		 273 aa  286  2e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0034  hypothetical protein  48.4 
 
 		 273 aa  286  4e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3441  hypothetical protein  50 
 
 		 272 aa  283  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0931  protein of unknown function DUF932  50 
 
 		 273 aa  278  8e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3134  hypothetical protein  49.45 
 
 		 273 aa  276  2e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.112064  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4802  hypothetical protein  50 
 
 		 272 aa  271  1e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.722196 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1042  protein of unknown function DUF932  50 
 
 		 273 aa  268  7e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.995076  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2248  hypothetical protein  49.28 
 
 		 272 aa  266  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1123  hypothetical protein  49.82 
 
 		 315 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4894  hypothetical protein  48.91 
 
 		 272 aa  266  4e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2853  hypothetical protein  49.64 
 
 		 273 aa  266  4e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0666809 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4682  hypothetical protein  49.28 
 
 		 272 aa  266  4e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3348  hypothetical protein  49.28 
 
 		 272 aa  265  5e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1064  hypothetical protein  49.64 
 
 		 273 aa  265  8e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0274991 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3207  hypothetical protein  49.28 
 
 		 272 aa  264  1e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3408  hypothetical protein  49.28 
 
 		 272 aa  263  2e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2883  hypothetical protein  50.36 
 
 		 273 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3354  protein of unknown function DUF932  50.36 
 
 		 273 aa  258  6e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1400  hypothetical protein  48.19 
 
 		 272 aa  258  6e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.188272 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7306  hypothetical protein  46.48 
 
 		 312 aa  258  9e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.481789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3899  hypothetical protein  48.9 
 
 		 287 aa  258  1e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4279  hypothetical protein  45.36 
 
 		 273 aa  257  2e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.219978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3678  hypothetical protein  46.13 
 
 		 281 aa  253  2.0000000000000002e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0754  hypothetical protein  47.31 
 
 		 273 aa  251  7e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4386  hypothetical protein  47.76 
 
 		 316 aa  245  6e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00134743  normal  0.817249 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6201  protein of unknown function DUF932  46.18 
 
 		 295 aa  245  8e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.571939  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0001  hypothetical protein  42.05 
 
 		 266 aa  213  3.9999999999999995e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000235069  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6482  protein of unknown function DUF932  55.23 
 
 		 196 aa  203  3e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.109206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0246  protein of unknown function DUF932  52.91 
 
 		 196 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7328  protein of unknown function DUF932  49.42 
 
 		 197 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.792728  hitchhiker  0.00281621 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0251  protein of unknown function DUF932  52.38 
 
 		 123 aa  140  3e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6477  protein of unknown function DUF932  52.38 
 
 		 123 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7323  protein of unknown function DUF932  53.97 
 
 		 124 aa  137  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000418502  hitchhiker  0.000715809 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4460  hypothetical protein  35.33 
 
 		 288 aa  126  5e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.629717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1214  hypothetical protein  34.08 
 
 		 281 aa  123  3e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.839406 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4368  hypothetical protein  34.6 
 
 		 283 aa  122  6e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>