More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1957 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_1957  ketol-acid reductoisomerase  100 
 
 
347 aa  719    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2093  ketol-acid reductoisomerase  54.6 
 
 
334 aa  393  1e-108  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2130  ketol-acid reductoisomerase  54.6 
 
 
334 aa  393  1e-108  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1668  ketol-acid reductoisomerase  54.6 
 
 
334 aa  390  1e-107  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1558  ketol-acid reductoisomerase  55.69 
 
 
336 aa  386  1e-106  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1519  ketol-acid reductoisomerase  55.38 
 
 
336 aa  384  1e-105  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1310  ketol-acid reductoisomerase  55.08 
 
 
336 aa  382  1e-105  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1283  ketol-acid reductoisomerase  55.08 
 
 
336 aa  384  1e-105  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1284  ketol-acid reductoisomerase  55.21 
 
 
336 aa  384  1e-105  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1419  ketol-acid reductoisomerase  55.08 
 
 
336 aa  382  1e-105  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0541  ketol-acid reductoisomerase  54.24 
 
 
340 aa  383  1e-105  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1581  ketol-acid reductoisomerase  53.64 
 
 
340 aa  381  1e-105  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3892  ketol-acid reductoisomerase  54.6 
 
 
336 aa  381  1e-105  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1848  ketol-acid reductoisomerase  55.72 
 
 
340 aa  381  1e-105  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1490  ketol-acid reductoisomerase  54.6 
 
 
336 aa  381  1e-104  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0544  ketol-acid reductoisomerase  52.6 
 
 
338 aa  380  1e-104  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.105491  hitchhiker  0.00154571 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1321  ketol-acid reductoisomerase  53.99 
 
 
336 aa  379  1e-104  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.925294  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1452  ketol-acid reductoisomerase  54.6 
 
 
336 aa  380  1e-104  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1122  ketol-acid reductoisomerase  54.46 
 
 
336 aa  380  1e-104  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0870487  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0660  ketol-acid reductoisomerase  53.64 
 
 
340 aa  377  1e-103  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.17551  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2227  ketol-acid reductoisomerase  55.69 
 
 
344 aa  378  1e-103  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1367  ketol-acid reductoisomerase  53.33 
 
 
340 aa  375  1e-103  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.845865  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1127  ketol-acid reductoisomerase  53.64 
 
 
340 aa  376  1e-103  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0735  ketol-acid reductoisomerase  53.03 
 
 
340 aa  373  1e-102  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20051  ketol-acid reductoisomerase  53.33 
 
 
331 aa  372  1e-102  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.337535 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0948  ketol-acid reductoisomerase  52.73 
 
 
340 aa  372  1e-102  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.525725  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1900  ketol-acid reductoisomerase  52.29 
 
 
338 aa  374  1e-102  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.119267  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1590  ketol-acid reductoisomerase  53.09 
 
 
330 aa  372  1e-102  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0504  ketol-acid reductoisomerase  55.21 
 
 
333 aa  373  1e-102  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.450267  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0600  ketol-acid reductoisomerase  54.55 
 
 
336 aa  374  1e-102  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.716466 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2555  ketol-acid reductoisomerase  52.76 
 
 
338 aa  372  1e-102  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00688273  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1909  ketol-acid reductoisomerase  52.58 
 
 
338 aa  370  1e-101  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0381319  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0867  ketol-acid reductoisomerase  52.73 
 
 
340 aa  369  1e-101  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1550  ketol-acid reductoisomerase  53.5 
 
 
331 aa  370  1e-101  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.382605  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0839  ketol-acid reductoisomerase  53.64 
 
 
331 aa  370  1e-101  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.528098  hitchhiker  0.00311805 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1262  ketol-acid reductoisomerase  52.45 
 
 
338 aa  370  1e-101  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.085544  hitchhiker  0.0000000293611 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0374  ketol-acid reductoisomerase  51.96 
 
 
340 aa  369  1e-101  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42500  ketol-acid reductoisomerase  52.91 
 
 
338 aa  370  1e-101  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1496  ketol-acid reductoisomerase  52.13 
 
 
339 aa  369  1e-101  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0558834  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1309  ketol-acid reductoisomerase  55.12 
 
 
340 aa  371  1e-101  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5408  ketol-acid reductoisomerase  52.29 
 
 
338 aa  368  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0737176  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0693  ketol-acid reductoisomerase  52.29 
 
 
336 aa  371  1e-101  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0636  ketol-acid reductoisomerase  51.68 
 
 
338 aa  365  1e-100  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2226  ketol-acid reductoisomerase  53.52 
 
 
338 aa  365  1e-100  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.528275 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0116  ketol-acid reductoisomerase  52.98 
 
 
359 aa  368  1e-100  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17361  ketol-acid reductoisomerase  53.07 
 
 
331 aa  365  1e-100  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1468  ketol-acid reductoisomerase  49.56 
 
 
342 aa  365  1e-100  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000508699  normal  0.0138391 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0504  ketol-acid reductoisomerase  50.76 
 
 
338 aa  364  1e-100  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000262639  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15141  ketol-acid reductoisomerase  53.82 
 
 
329 aa  367  1e-100  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.296105  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62130  ketol-acid reductoisomerase  52.29 
 
 
338 aa  367  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0371578 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0900  ketol-acid reductoisomerase  52.45 
 
 
338 aa  367  1e-100  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15011  ketol-acid reductoisomerase  53.82 
 
 
329 aa  366  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0283  ketol-acid reductoisomerase  51.68 
 
 
330 aa  365  1e-100  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3718  ketol-acid reductoisomerase  50.92 
 
 
338 aa  368  1e-100  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.193643  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14761  ketol-acid reductoisomerase  53.82 
 
 
329 aa  364  1e-99  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.620838  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0949  ketol-acid reductoisomerase  53.52 
 
 
338 aa  363  2e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1903  ketol-acid reductoisomerase  52.91 
 
 
338 aa  363  2e-99  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.276758  normal  0.74874 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1245  ketol-acid reductoisomerase  52.31 
 
 
331 aa  363  2e-99  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462717  normal  0.110699 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0848  ketol-acid reductoisomerase  53.82 
 
 
338 aa  363  3e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.385412  hitchhiker  0.00438995 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0881  ketol-acid reductoisomerase  52.76 
 
 
331 aa  363  3e-99  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.785072  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1412  ketol-acid reductoisomerase  53.52 
 
 
329 aa  363  3e-99  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13631  ketol-acid reductoisomerase  52.76 
 
 
331 aa  363  3e-99  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.095723  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1709  ketol-acid reductoisomerase  53.64 
 
 
337 aa  363  3e-99  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1716  ketol-acid reductoisomerase  54.46 
 
 
335 aa  362  4e-99  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1890  ketol-acid reductoisomerase  54.46 
 
 
335 aa  362  4e-99  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1852  ketol-acid reductoisomerase  54.46 
 
 
335 aa  362  4e-99  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1968  ketol-acid reductoisomerase  54.46 
 
 
335 aa  362  4e-99  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3228  ketol-acid reductoisomerase  51.67 
 
 
337 aa  362  4e-99  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1989  ketol-acid reductoisomerase  50.46 
 
 
338 aa  362  5.0000000000000005e-99  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2051  ketol-acid reductoisomerase  52.58 
 
 
331 aa  362  5.0000000000000005e-99  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.850484 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0155  ketol-acid reductoisomerase  53.68 
 
 
330 aa  362  5.0000000000000005e-99  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0166453 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0983  ketol-acid reductoisomerase  53.82 
 
 
338 aa  362  7.0000000000000005e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.900438  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1853  ketol-acid reductoisomerase  54.15 
 
 
335 aa  362  7.0000000000000005e-99  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1962  ketol-acid reductoisomerase  51.38 
 
 
339 aa  361  9e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.971323  normal  0.40215 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1690  ketol-acid reductoisomerase  56.13 
 
 
331 aa  361  1e-98  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.300621  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1693  ketol-acid reductoisomerase  54.15 
 
 
335 aa  361  1e-98  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1781  ketol-acid reductoisomerase  52.6 
 
 
339 aa  361  1e-98  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3489  ketol-acid reductoisomerase  53.85 
 
 
335 aa  360  2e-98  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0593  ketol-acid reductoisomerase  51.38 
 
 
331 aa  360  2e-98  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000142163  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2492  ketol-acid reductoisomerase  50.76 
 
 
339 aa  360  2e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.386915  normal  0.156046 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0913  ketol-acid reductoisomerase  52.6 
 
 
338 aa  360  2e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1660  ketol-acid reductoisomerase  51.23 
 
 
329 aa  360  2e-98  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2594  ketol-acid reductoisomerase  52.87 
 
 
341 aa  360  2e-98  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2749  ketol-acid reductoisomerase  51.38 
 
 
339 aa  360  3e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.834774 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3563  ketol-acid reductoisomerase  51.38 
 
 
330 aa  359  3e-98  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0252536  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1009  ketol-acid reductoisomerase  52.91 
 
 
338 aa  359  3e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0031773  hitchhiker  0.000000327544 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1907  ketol-acid reductoisomerase  53.52 
 
 
339 aa  359  3e-98  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.022886  hitchhiker  0.0000179587 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1936  ketol-acid reductoisomerase  54.24 
 
 
335 aa  359  4e-98  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0188  ketol-acid reductoisomerase  52 
 
 
335 aa  359  4e-98  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5327  ketol-acid reductoisomerase  50.46 
 
 
339 aa  359  4e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.145027  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4786  ketol-acid reductoisomerase  52.76 
 
 
338 aa  358  5e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.145947  hitchhiker  0.00823723 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1719  ketol-acid reductoisomerase  52.91 
 
 
338 aa  358  5e-98  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00792328  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2371  ketol-acid reductoisomerase  52.45 
 
 
338 aa  359  5e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0013  ketol-acid reductoisomerase  55.05 
 
 
331 aa  358  7e-98  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.86609  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2272  ketol-acid reductoisomerase  52.15 
 
 
338 aa  358  9e-98  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2075  ketol-acid reductoisomerase  52.6 
 
 
338 aa  357  9.999999999999999e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0472  ketol-acid reductoisomerase  52 
 
 
338 aa  358  9.999999999999999e-98  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6019  ketol-acid reductoisomerase  50.46 
 
 
337 aa  357  1.9999999999999998e-97  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.390752  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0611  ketol-acid reductoisomerase  51.52 
 
 
339 aa  357  1.9999999999999998e-97  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.194417  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3480  ketol-acid reductoisomerase  50.75 
 
 
341 aa  357  1.9999999999999998e-97  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.161207  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>