208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_2513 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_2513  glutamine synthetase repressor  100 
 
 		 122 aa  253  6e-67  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.218965  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1752  glutamine synthetase transcriptional regulator  60.34 
 
 		 124 aa  135  2e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000396501  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1764  transcriptional regulator GlnR  58.26 
 
 		 123 aa  134  3.0000000000000003e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.105299  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0716  glutamine synthetase repressor  52.68 
 
 		 112 aa  113  8.999999999999998e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2116  transcriptional regulator, MerR family  52.17 
 
 		 133 aa  112  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1234  transcriptional regulator, MerR family  50.43 
 
 		 134 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000829315  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3470  MerR family transcriptional regulator  46.49 
 
 		 129 aa  102  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.003509  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2382  MerR family transcriptional regulator  44.74 
 
 		 129 aa  98.6  2e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.492315  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3732  transcriptional repressor GlnR  44.74 
 
 		 129 aa  97.4  6e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1501  transcriptional repressor GlnR  44.74 
 
 		 129 aa  97.4  6e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0247107 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3550  transcriptional repressor GlnR  44.74 
 
 		 129 aa  97.4  6e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3450  MerR family transcriptional regulator  44.74 
 
 		 129 aa  97.4  6e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3463  MerR family transcriptional regulator  44.74 
 
 		 129 aa  97.4  6e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3834  transcriptional repressor GlnR  44.74 
 
 		 129 aa  97.4  6e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3714  transcriptional repressor GlnR  44.74 
 
 		 129 aa  97.4  6e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.57009e-18 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3804  transcriptional repressor GlnR  44.74 
 
 		 129 aa  97.4  6e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3755  transcriptional repressor GlnR  44.74 
 
 		 129 aa  97.4  6e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0446973  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0875  glutamine synthetase repressor  55.56 
 
 		 121 aa  90.1  8e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1367  MerR family transcriptional regulator  52.56 
 
 		 122 aa  87.8  4e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0398915  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1393  glutamine synthetase repressor  52.56 
 
 		 122 aa  87.8  4e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.155382  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1572  transcriptional regulator, MerR family  43.75 
 
 		 128 aa  87.4  6e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0951  glutamine synthetase repressor  40.37 
 
 		 110 aa  83.6  9e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.394766  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21300  putative transcriptional regulator, MerR family  53.12 
 
 		 126 aa  68.9  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.282314  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2671  transcriptional regulator, MerR family  49.23 
 
 		 101 aa  67  0.00000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1499  transcriptional regulator, MerR family  50.77 
 
 		 99 aa  66.2  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000339204  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01190  predicted transcriptional regulator  44.44 
 
 		 126 aa  53.9  0.0000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2078  transcriptional regulator, MerR family  40.54 
 
 		 242 aa  52.4  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.696711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0382  transcriptional regulator, MerR family  38.57 
 
 		 96 aa  52.8  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4234  regulatory protein, MerR  37.14 
 
 		 96 aa  51.2  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.231152  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0980  MerR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 243 aa  50.8  0.000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2118  MerR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 205 aa  50.4  0.000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0893281  normal  0.0821233 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4888  transcriptional regulator, MerR family  38.1 
 
 		 92 aa  50.4  0.000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.715098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1548  MerR family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 289 aa  49.7  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.556606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0097  transcriptional regulator, MerR family  34.94 
 
 		 157 aa  50.1  0.00001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.377226 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1319  MerR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 174 aa  48.9  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2126  MerR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 282 aa  48.5  0.00003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0360  MerR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 145 aa  48.5  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000341554  normal  0.726839 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1215  transcriptional regulator, MerR family  39.68 
 
 		 101 aa  48.5  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4630  MerR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 303 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00680  predicted transcriptional regulator  39.68 
 
 		 130 aa  48.1  0.00004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0024  transcriptional regulator, MerR family  38.89 
 
 		 131 aa  47.8  0.00005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0637  MerR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 124 aa  47.8  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.122325  normal  0.18825 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0489  transcriptional regulator, MerR family  40.3 
 
 		 132 aa  46.6  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0583228  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1279  transcriptional regulator, MerR family  42.03 
 
 		 198 aa  46.2  0.0001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3069  transcriptional regulator, MerR family  38.1 
 
 		 130 aa  47  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3449  MerR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 98 aa  46.2  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0230  MerR family transcriptional regulator  29 
 
 		 154 aa  46.2  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1973  MerR family transcriptional regulator  29 
 
 		 154 aa  46.2  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0250  transcriptional regulator, MerR family  35.82 
 
 		 154 aa  45.4  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5280  transcriptional regulator CadR  33.75 
 
 		 148 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3169  MerR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 315 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0340158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0954  MerR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 146 aa  46.2  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0450773  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4615  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 311 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0257  MerR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 120 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0114749  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0539  transcriptional regulator, MerR family  36.92 
 
 		 111 aa  45.4  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5372  MerR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 149 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1798  regulatory protein, MerR  37.14 
 
 		 118 aa  45.4  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0455207  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0084  transcriptional regulator, MerR family  37.5 
 
 		 156 aa  45.1  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18780  predicted transcriptional regulator  28.18 
 
 		 183 aa  45.1  0.0003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.010382  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1534  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 182 aa  45.1  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4267  regulatory protein MerR  36.62 
 
 		 143 aa  45.1  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10358  heat shock protein transcriptional repressor HspR  37.5 
 
 		 126 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0164673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4838  regulatory protein, MerR  32.5 
 
 		 148 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1436  transcriptional regulator, MerR family  36.11 
 
 		 140 aa  45.1  0.0004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23560  transcriptional regulator, MerR family  38.89 
 
 		 138 aa  45.1  0.0004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.346447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3286  MerR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 321 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0951  transcriptional regulator, MerR family  31.87 
 
 		 159 aa  44.3  0.0006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0159877  hitchhiker  0.00000555136 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0465  MerR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 129 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0455  MerR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 116 aa  44.3  0.0006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0476  MerR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 129 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.952964 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0452  MerR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 129 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.336664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4491  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 311 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.51698  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1889  transcriptional regulator, MerR family  28.74 
 
 		 116 aa  43.9  0.0007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000504717  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0810  MerR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 310 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.826651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4360  regulatory protein, MerR  34.33 
 
 		 144 aa  43.9  0.0007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0721888  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1407  MerR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 133 aa  43.9  0.0007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2312  putative transcriptional regulator, MerR family  31.03 
 
 		 198 aa  43.9  0.0007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2141  MerR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 181 aa  43.9  0.0007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0481912  normal  0.077667 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2773  MerR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 132 aa  43.9  0.0007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1425  transcriptional regulator  34.18 
 
 		 116 aa  43.9  0.0008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000104332  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2847  transcriptional regulator, MerR family  35.38 
 
 		 169 aa  43.9  0.0008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.444422  hitchhiker  0.0000160217 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2725  MerR family transcriptional regulator  28 
 
 		 243 aa  43.5  0.0009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1687  MerR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 129 aa  43.1  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12190  predicted transcriptional regulator  33.71 
 
 		 146 aa  43.1  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.745153  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2509  transcriptional regulator, MerR family  31.51 
 
 		 160 aa  43.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1805  transcriptional regulator, MerR family  40.62 
 
 		 142 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.665763 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0894  MerR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 319 aa  43.5  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1026  MerR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 140 aa  43.5  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.120689  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2278  MerR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 273 aa  43.1  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.408305  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1095  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 138 aa  42.7  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4158  MerR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 135 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.144769 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0325  MerR family transcriptional regulator  30 
 
 		 147 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.634832 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0064  MerR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 242 aa  43.1  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000328  HTH-type transcriptional regulator CueR  41.27 
 
 		 128 aa  43.1  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000000737909  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2140  transcriptional regulator, MerR family  31.51 
 
 		 160 aa  43.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0134441 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1498  MerR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 163 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1256  transcriptional regulator, MerR family  47.17 
 
 		 142 aa  43.1  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1963  transcriptional regulator, MerR family  33.82 
 
 		 138 aa  43.1  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.101792  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0975  putative heat shock protein HspR  29.79 
 
 		 125 aa  43.1  0.001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.933748  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1066  cation-efflux system membrane protein  29.67 
 
 		 124 aa  43.5  0.001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000356416  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>