More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1180 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_1180  50S ribosomal protein L21  100 
 
 		 104 aa  203  5e-52  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00135426  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1370  50S ribosomal protein L21  79.81 
 
 		 104 aa  164  2.9999999999999998e-40  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000286753  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0455  50S ribosomal protein L21  76.92 
 
 		 104 aa  159  9e-39  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000169225  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4577  50S ribosomal protein L21  67.33 
 
 		 102 aa  148  3e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000026821  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4536  50S ribosomal protein L21  67.33 
 
 		 102 aa  148  3e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000024347  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3159  50S ribosomal protein L21  67.33 
 
 		 102 aa  148  3e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000000681834  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4342  50S ribosomal protein L21  66.34 
 
 		 102 aa  147  7e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000792007  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4178  50S ribosomal protein L21  66.34 
 
 		 102 aa  147  7e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000215855  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4189  50S ribosomal protein L21  66.34 
 
 		 102 aa  147  7e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000221763  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4562  50S ribosomal protein L21  66.34 
 
 		 102 aa  147  7e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000104874  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4290  50S ribosomal protein L21  66.34 
 
 		 102 aa  147  7e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000204563  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4524  50S ribosomal protein L21  66.34 
 
 		 102 aa  147  7e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.227549 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4676  50S ribosomal protein L21  66.34 
 
 		 102 aa  147  7e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000541425  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1192  50S ribosomal protein L21  70.3 
 
 		 102 aa  146  7e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000108547  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0672  50S ribosomal protein L21  66.34 
 
 		 102 aa  147  7e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000058928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0908  50S ribosomal protein L21  68.32 
 
 		 102 aa  145  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2542  50S ribosomal protein L21  67.33 
 
 		 102 aa  145  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107252  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0745  ribosomal protein L21  67.65 
 
 		 156 aa  135  1e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000031212  hitchhiker  0.00014666 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1326  50S ribosomal protein L21P  64.65 
 
 		 99 aa  127  5.0000000000000004e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.0000107304  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1704  50S ribosomal protein L21  62.38 
 
 		 102 aa  119  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00000276664  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1737  50S ribosomal protein L21  62.38 
 
 		 102 aa  119  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000015429  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1211  50S ribosomal protein L21  61.39 
 
 		 102 aa  118  3e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000816286  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0957  50S ribosomal protein L21P  59.22 
 
 		 100 aa  118  3e-26  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000239901  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0926  ribosomal protein L21  57 
 
 		 102 aa  116  9.999999999999999e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000000598947  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0160  50S ribosomal protein L21  54.9 
 
 		 103 aa  112  1.0000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00136073  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1452  ribosomal protein L21  55.45 
 
 		 103 aa  111  4.0000000000000004e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000000564167  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2385  50S ribosomal protein L21  56.86 
 
 		 103 aa  110  6e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.26832  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2097  50S ribosomal protein L21  56.86 
 
 		 103 aa  110  6e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000000174433  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1613  ribosomal protein L21  53.4 
 
 		 104 aa  109  1.0000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000143983  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4338  50S ribosomal protein L21  52.94 
 
 		 103 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  2.9959e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2692  50S ribosomal protein L21P  51.49 
 
 		 149 aa  107  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00184818  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2535  ribosomal protein L21  52.43 
 
 		 114 aa  107  4.0000000000000004e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00752962  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2005  ribosomal protein L21  53 
 
 		 103 aa  105  1e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2058  50S ribosomal protein L21  53.47 
 
 		 102 aa  106  1e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.550778  normal  0.848803 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2551  50S ribosomal protein L21  55.45 
 
 		 102 aa  105  2e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000316052  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001673  LSU ribosomal protein L21p  50.98 
 
 		 103 aa  104  3e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000280256  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0528  LSU ribosomal protein L21P  55 
 
 		 105 aa  105  3e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000314721  normal  0.0648097 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00800  50S ribosomal protein L21  51.96 
 
 		 103 aa  105  3e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2853  50S ribosomal protein L21  51.96 
 
 		 103 aa  105  3e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000634591  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1817  ribosomal protein L21  49.5 
 
 		 104 aa  104  4e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14120  ribosomal protein L21  52.94 
 
 		 132 aa  104  4e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000020004  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2228  50S ribosomal protein L21  54.46 
 
 		 101 aa  104  5e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0036789  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1380  50S ribosomal protein L21  50.5 
 
 		 102 aa  104  5e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0497  ribosomal protein L21  59.6 
 
 		 98 aa  103  6e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0557  50S ribosomal protein L21  53 
 
 		 104 aa  103  8e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0205  50S ribosomal protein L21  52 
 
 		 100 aa  103  9e-22  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3189  50S ribosomal protein L21  49.02 
 
 		 104 aa  102  2e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.136344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1004  50S ribosomal protein L21  50 
 
 		 103 aa  102  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000156676  decreased coverage  0.00000356458 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2250  50S ribosomal protein L21  49 
 
 		 102 aa  101  3e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00445864  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4238  ribosomal protein L21  50.5 
 
 		 102 aa  102  3e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000144419  hitchhiker  0.000000201625 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1320  50S ribosomal protein L21  54.9 
 
 		 103 aa  101  3e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0375246  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0852  50S ribosomal protein L21  49.02 
 
 		 103 aa  101  4e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000265275  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0749  ribosomal protein L21  53.47 
 
 		 101 aa  101  4e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.0000000486349  hitchhiker  0.00474582 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0869  50S ribosomal protein L21  49.02 
 
 		 103 aa  100  6e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000245664  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0474  50S ribosomal protein L21P  48.04 
 
 		 103 aa  100  8e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.030685  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0646  50S ribosomal protein L21  46.53 
 
 		 130 aa  99  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.362263  normal  0.661162 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl441  50S ribosomal protein L21  53.47 
 
 		 99 aa  99  2e-20  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000304369  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0412  50S ribosomal protein L21  48.51 
 
 		 100 aa  99  2e-20  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.178853  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0954  50S ribosomal protein L21  49.02 
 
 		 103 aa  99.4  2e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.361102  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3236  50S ribosomal protein L21  48.51 
 
 		 102 aa  98.6  3e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000156169  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1036  50S ribosomal protein L21  47.06 
 
 		 103 aa  98.2  3e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000168941  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3323  50S ribosomal protein L21  47.06 
 
 		 103 aa  98.2  3e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000033092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0898  ribosomal protein L21  48.51 
 
 		 103 aa  98.2  3e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000121247  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1069  50S ribosomal protein L21  47.06 
 
 		 103 aa  98.2  3e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000000190707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0967  50S ribosomal protein L21  47.06 
 
 		 103 aa  98.2  3e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000186548  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0979  50S ribosomal protein L21  48.04 
 
 		 103 aa  98.2  4e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000128697  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3315  ribosomal protein L21  50.49 
 
 		 103 aa  97.8  4e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000262091  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3206  ribosomal protein L21  47.06 
 
 		 103 aa  97.8  5e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.78407  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3590  50S ribosomal protein L21  48.51 
 
 		 102 aa  97.8  5e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000239742  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0145  50S ribosomal protein L21  46.53 
 
 		 102 aa  97.4  5e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3682  50S ribosomal protein L21  46.08 
 
 		 103 aa  97.4  5e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.885821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2927  50S ribosomal protein L21  48.04 
 
 		 103 aa  97.4  6e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000789228  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0361  50S ribosomal protein L21  47.06 
 
 		 103 aa  97.1  7e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000287252  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2117  50S ribosomal protein L21  49.5 
 
 		 104 aa  97.1  7e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000135569  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3089  50S ribosomal protein L21  47.06 
 
 		 103 aa  96.3  1e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60460  50S ribosomal protein L21  47.06 
 
 		 103 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0123186 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1573  50S ribosomal protein L21  48.04 
 
 		 103 aa  95.5  2e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.337451  normal  0.754011 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2583  50S ribosomal protein L21  46.53 
 
 		 102 aa  95.9  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.5903200000000002e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0341  ribosomal protein L21  49.51 
 
 		 104 aa  95.5  2e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000133447  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1755  50S ribosomal protein L21  48.04 
 
 		 103 aa  95.5  2e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.092624  normal  0.0601991 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0162  50S ribosomal protein L21  46.53 
 
 		 102 aa  95.5  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000233925  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0845  50S ribosomal protein L21  50.98 
 
 		 104 aa  95.5  2e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0797  ribosomal protein L21  46.08 
 
 		 103 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0701  50S ribosomal protein L21  46.08 
 
 		 103 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.60997 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40790  50S ribosomal protein L21  48.04 
 
 		 103 aa  95.1  3e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.200722  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1008  50S ribosomal protein L21P  48 
 
 		 103 aa  95.1  3e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000012148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0304  50S ribosomal protein L21  46.53 
 
 		 102 aa  94.7  3e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000140365  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5208  50S ribosomal protein L21  45.1 
 
 		 103 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.123983  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3470  50S ribosomal protein L21  45.1 
 
 		 103 aa  94  6e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00235402  normal  0.37333 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0855  50S ribosomal protein L21  47.06 
 
 		 103 aa  94  6e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2829  50S ribosomal protein L21  46.08 
 
 		 103 aa  93.6  7e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000650093  normal  0.344337 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0688  50S ribosomal protein L21  45.63 
 
 		 104 aa  93.6  8e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.468756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0720  50S ribosomal protein L21  45.63 
 
 		 104 aa  93.6  8e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.456821  normal  0.0127169 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0720  50S ribosomal protein L21  45.63 
 
 		 104 aa  93.6  8e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.7553  normal  0.901329 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4497  50S ribosomal protein L21  44.66 
 
 		 104 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.200456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2219  50S ribosomal protein L21P  45.1 
 
 		 104 aa  93.2  1e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000152954  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0770  50S ribosomal protein L21  48.04 
 
 		 103 aa  92.8  1e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0895  50S ribosomal protein L21  46.08 
 
 		 103 aa  93.2  1e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000281262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3125  50S ribosomal protein L21  46.08 
 
 		 103 aa  93.2  1e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000193081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0841  50S ribosomal protein L21  48.04 
 
 		 103 aa  92.8  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.498603 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>