More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_25730 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_25730  integrase family protein  100 
 
 		 333 aa  669    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3601  Integrase catalytic region  67.17 
 
 		 407 aa  404  1.0000000000000001e-112  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000351603  normal  0.0699896 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3701  Integrase catalytic region  67.17 
 
 		 407 aa  404  1.0000000000000001e-112  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.25457  normal  0.162574 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0482  integrase catalytic subunit  50.58 
 
 		 419 aa  313  3.9999999999999997e-84  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.239573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1024  integrase catalytic region  50.9 
 
 		 408 aa  309  5e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0461677 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1968  integrase catalytic region  50.9 
 
 		 408 aa  309  5e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1591  integrase catalytic region  50.9 
 
 		 408 aa  309  5e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00379475 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2854  integrase catalytic region  50.9 
 
 		 408 aa  309  5e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.429143 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4926  integrase catalytic region  50.9 
 
 		 408 aa  309  5e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.409648  normal  0.357662 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3160  integrase catalytic region  50.9 
 
 		 408 aa  309  5e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00012152 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1024  Integrase catalytic region  50.3 
 
 		 430 aa  306  2.0000000000000002e-82  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.669349  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2580  integrase catalytic region  50.6 
 
 		 408 aa  306  3e-82  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0415627  normal  0.0862482 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12957  transposase  49.55 
 
 		 413 aa  306  4.0000000000000004e-82  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2579  Integrase catalytic region  48.4 
 
 		 428 aa  305  1.0000000000000001e-81  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.655181  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3900  integrase catalytic subunit  47.75 
 
 		 405 aa  283  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3040  Integrase catalytic region  51.51 
 
 		 421 aa  277  2e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000772165  hitchhiker  0.00538259 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2245  IS1533 transposase  47.54 
 
 		 264 aa  159  9e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0270795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13668  transposase  50.31 
 
 		 166 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0360997 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0578  integrase, catalytic region  53.33 
 
 		 145 aa  124  3e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1063  Integrase catalytic region  31.51 
 
 		 502 aa  99.4  8e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.877216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4855  Integrase catalytic region  31.51 
 
 		 502 aa  99.4  8e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000769666 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4858  Integrase catalytic region  31.51 
 
 		 502 aa  99.4  8e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0252827  normal  0.0109178 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2874  Integrase catalytic region  31.51 
 
 		 502 aa  99.4  8e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1072  Integrase catalytic region  31.51 
 
 		 502 aa  99  9e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0943  Integrase catalytic region  31.16 
 
 		 502 aa  98.6  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.346378  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2939  Integrase catalytic region  31.16 
 
 		 502 aa  98.6  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.620801  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6478  Integrase catalytic region  31.16 
 
 		 507 aa  98.2  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1052  Integrase catalytic region  31.16 
 
 		 502 aa  98.2  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.437105  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1589  Integrase catalytic region  31.51 
 
 		 502 aa  97.4  3e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0119  Integrase catalytic region  30.41 
 
 		 449 aa  92.8  8e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1081  Integrase catalytic region  30.41 
 
 		 449 aa  92.8  8e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.333924  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1363  Integrase catalytic region  27.05 
 
 		 507 aa  88.2  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0134  Integrase catalytic region  27.05 
 
 		 507 aa  88.2  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.53025 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0624  transposase  28.66 
 
 		 610 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.337489  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0317  transposase, IS21 family  29.67 
 
 		 496 aa  85.1  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0223423  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2511  integrase catalytic region  27.85 
 
 		 510 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4737  integrase catalytic region  27.85 
 
 		 510 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5653  integrase catalytic region  27.85 
 
 		 510 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0199  Integrase catalytic region  27.86 
 
 		 512 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0240231 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6529  Integrase catalytic region  27.86 
 
 		 512 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.277485  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2295  integrase catalytic region  27.85 
 
 		 510 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.218611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6239  integrase catalytic region  27.85 
 
 		 510 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0018  integrase catalytic region  27.85 
 
 		 510 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2090  transposase, IS21 family  29.33 
 
 		 496 aa  83.6  0.000000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3159  transposase, IS21 family  29.33 
 
 		 496 aa  83.6  0.000000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4040  hypothetical protein  29.33 
 
 		 496 aa  83.6  0.000000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1457  integrase  27.84 
 
 		 410 aa  80.1  0.00000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3280  transposase  29.22 
 
 		 363 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.32687 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1192  Integrase catalytic region  28.08 
 
 		 508 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6440  Integrase catalytic region  28.08 
 
 		 508 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000175464 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3857  Integrase catalytic region  28.08 
 
 		 508 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0136  integrase catalytic subunit  26.67 
 
 		 434 aa  77.4  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0324788  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2833  integrase catalytic subunit  26.67 
 
 		 434 aa  77.4  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0010  transposase, IS21 family  28.33 
 
 		 496 aa  77  0.0000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2548  integrase catalytic subunit  27.99 
 
 		 518 aa  76.3  0.0000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1791  putative transposase catalytic subunit  27.37 
 
 		 507 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2087  Integrase catalytic region  24.08 
 
 		 400 aa  74.3  0.000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.347453  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2293  Integrase catalytic region  24.08 
 
 		 400 aa  74.3  0.000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0258  Integrase catalytic region  24.08 
 
 		 400 aa  74.3  0.000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0130  Integrase catalytic region  24.08 
 
 		 400 aa  74.3  0.000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4700  integrase catalytic region  26.99 
 
 		 427 aa  72.4  0.000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.670986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6916  integrase catalytic region  26.99 
 
 		 427 aa  72.4  0.000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.803027  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1464  integrase catalytic region  26.99 
 
 		 427 aa  72.4  0.000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7013  hypothetical protein  26.99 
 
 		 427 aa  72.4  0.000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1510  integrase catalytic region  26.99 
 
 		 427 aa  72.4  0.000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2798  integrase catalytic region  26.99 
 
 		 427 aa  72.4  0.000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3888  integrase catalytic region  26.99 
 
 		 427 aa  72.4  0.000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5534  integrase catalytic region  26.99 
 
 		 427 aa  72.4  0.000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2452  integrase catalytic region  26.99 
 
 		 427 aa  72.4  0.000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.227029 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0099  putative transposase  27.21 
 
 		 435 aa  72  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.431039 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0012  putative transposase  27.21 
 
 		 416 aa  72  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.116272 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5106  integrase catalytic subunit  27.49 
 
 		 431 aa  71.6  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.214322  normal  0.182706 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13460  transposase  29.52 
 
 		 694 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000225344  hitchhiker  0.00142582 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0786  Integrase catalytic region  26.85 
 
 		 410 aa  71.2  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5624  integrase catalytic region  27.52 
 
 		 429 aa  70.9  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.205652  normal  0.723097 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1847  integrase catalytic region  27.52 
 
 		 429 aa  70.9  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.154194 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1706  integrase catalytic region  27.52 
 
 		 429 aa  70.9  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3716  Integrase catalytic region  27.78 
 
 		 523 aa  70.5  0.00000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  0.124306 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3058  Integrase catalytic region  26.33 
 
 		 425 aa  70.1  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1512  Integrase catalytic region  26.33 
 
 		 425 aa  70.1  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3693  Integrase catalytic region  26.33 
 
 		 425 aa  70.1  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1326  Integrase catalytic region  26.33 
 
 		 425 aa  69.7  0.00000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2982  integrase catalytic subunit  28.38 
 
 		 514 aa  68.6  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00424027  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0997  integrase catalytic subunit  27.95 
 
 		 514 aa  68.2  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1139  Integrase catalytic region  27.4 
 
 		 474 aa  67.4  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.650058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0193  integrase catalytic subunit  27.95 
 
 		 514 aa  67  0.0000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1628  integrase catalytic subunit  27.95 
 
 		 514 aa  67  0.0000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3873  Integrase catalytic region  29.22 
 
 		 531 aa  67  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0464732  normal  0.0452112 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1554  Integrase catalytic region  29.11 
 
 		 413 aa  66.2  0.0000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4229  integrase catalytic subunit  28.38 
 
 		 514 aa  66.2  0.0000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2468  integrase catalytic subunit  26.25 
 
 		 514 aa  66.2  0.0000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1097  Integrase catalytic region  27.4 
 
 		 474 aa  65.9  0.0000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.81424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4913  integrase catalytic subunit  27.52 
 
 		 428 aa  65.9  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.279769 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0995  transposase  26.71 
 
 		 500 aa  65.5  0.000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5654  Integrase catalytic region  29.14 
 
 		 512 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3717  integrase catalytic subunit  24.26 
 
 		 412 aa  64.7  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1799  transposase  26.71 
 
 		 507 aa  64.7  0.000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.161181  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1412  transposase  26.71 
 
 		 507 aa  65.1  0.000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06964  hypothetical protein  24.56 
 
 		 510 aa  64.3  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2396  integrase catalytic subunit  28.38 
 
 		 514 aa  65.1  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.483197  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>