More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_21630 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_21630  signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 505 aa  1001    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0359788  normal  0.0598473 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0716  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.78 
 
 		 515 aa  339  5.9999999999999996e-92  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.880509  hitchhiker  0.00000493136 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0898  histidine kinase  42.95 
 
 		 477 aa  319  7e-86  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.468744 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3621  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.56 
 
 		 528 aa  313  3.9999999999999997e-84  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0211991  normal  0.941286 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0783  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  42.47 
 
 		 479 aa  311  2e-83  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2052  histidine kinase  41.85 
 
 		 520 aa  310  5e-83  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.390802  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31490  signal transduction histidine kinase  40.78 
 
 		 545 aa  294  2e-78  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.168456  normal  0.695383 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4658  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.11 
 
 		 522 aa  292  1e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.702932  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07900  signal transduction histidine kinase  40.48 
 
 		 529 aa  289  8e-77  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04120  signal transduction histidine kinase  40.12 
 
 		 601 aa  288  2e-76  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.427723  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5174  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.77 
 
 		 503 aa  273  8.000000000000001e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1448  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  43.61 
 
 		 524 aa  270  7e-71  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1582  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.38 
 
 		 535 aa  266  7e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0839  histidine kinase  42.83 
 
 		 467 aa  266  8e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.969537  normal  0.20827 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10773  two component system response sensor kinase membrane associated phoR  39.48 
 
 		 485 aa  260  4e-68  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.680907 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4589  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.97 
 
 		 473 aa  259  7e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4677  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.97 
 
 		 473 aa  259  7e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0338673  normal  0.745683 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2938  histidine kinase  41.97 
 
 		 540 aa  259  1e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.330217  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4972  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.77 
 
 		 473 aa  259  1e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0309  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.83 
 
 		 474 aa  253  7e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0823  ATP-binding region ATPase domain protein  40.36 
 
 		 488 aa  250  5e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.121658  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5143  histidine kinase  40.45 
 
 		 496 aa  244  3e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0703366  normal  0.553184 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1822  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.07 
 
 		 488 aa  239  6.999999999999999e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0006  signal transduction histidine kinase  31.88 
 
 		 635 aa  238  2e-61  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8878  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  46.84 
 
 		 460 aa  235  2.0000000000000002e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.575508  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3275  histidine kinase  44.5 
 
 		 487 aa  234  4.0000000000000004e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.27524  normal  0.179403 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0721  sensor histidine kinase/response regulator  31.15 
 
 		 648 aa  227  3e-58  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.213488 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6508  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.8 
 
 		 490 aa  220  3.9999999999999997e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.438349  normal  0.229787 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3940  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.34 
 
 		 532 aa  220  5e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.115086 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1383  histidine kinase  36.77 
 
 		 471 aa  219  1e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.141813  normal  0.0864721 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3630  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.18 
 
 		 468 aa  218  2e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3925  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.15 
 
 		 532 aa  218  2e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.665584  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3999  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.81 
 
 		 517 aa  218  2e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1417  ATPase domain-containing protein  37.32 
 
 		 470 aa  216  9.999999999999999e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.110308 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2094  histidine kinase  41.57 
 
 		 477 aa  213  7.999999999999999e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.854924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2131  ATPase domain-containing protein  42.74 
 
 		 483 aa  211  2e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0675603  decreased coverage  0.00126356 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0803  histidine kinase  34.96 
 
 		 497 aa  210  4e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13796  two component sensor kinase  34.98 
 
 		 506 aa  209  1e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0887286 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6587  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.69 
 
 		 502 aa  207  2e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.537793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0579  histidine kinase  40.94 
 
 		 505 aa  206  9e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0220  histidine kinase  37.35 
 
 		 550 aa  204  3e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.122039  hitchhiker  0.00447833 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2278  histidine kinase  40.67 
 
 		 477 aa  203  6e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.208594  normal  0.0146611 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0235  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  42.05 
 
 		 500 aa  202  9.999999999999999e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4507  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.29 
 
 		 501 aa  201  1.9999999999999998e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4407  histidine kinase  41.85 
 
 		 492 aa  201  3e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4917  Signal transduction histidine kinase-like protein  38.11 
 
 		 486 aa  197  5.000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3341  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.71 
 
 		 365 aa  194  3e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.049327 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0654  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.09 
 
 		 510 aa  194  3e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2267  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.48 
 
 		 546 aa  192  1e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0359214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3037  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.32 
 
 		 509 aa  192  1e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4063  histidine kinase  38.1 
 
 		 525 aa  189  8e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.243672 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6497  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.26 
 
 		 612 aa  189  1e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0417702  normal  0.376991 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3685  ATPase domain-containing protein  36.67 
 
 		 519 aa  189  1e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4428  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.19 
 
 		 534 aa  188  2e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.222647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0324  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.38 
 
 		 480 aa  188  2e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6148  histidine kinase  36.65 
 
 		 494 aa  185  1.0000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.172776 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1723  histidine kinase  36.12 
 
 		 494 aa  184  3e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0320  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  43.61 
 
 		 552 aa  184  3e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1097  histidine kinase  36.13 
 
 		 477 aa  183  7e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4689  histidine kinase  35.22 
 
 		 473 aa  179  1e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1807  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.21 
 
 		 490 aa  177  4e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0131538  normal  0.162192 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0378  histidine kinase  34.45 
 
 		 469 aa  176  8e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1006  histidine kinase  37.04 
 
 		 503 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.553516  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1130  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.33 
 
 		 469 aa  173  7.999999999999999e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0256  signal transduction histidine kinase  41.67 
 
 		 474 aa  171  3e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.793429  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32710  signal transduction histidine kinase  40.17 
 
 		 526 aa  171  4e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.714085  normal  0.582506 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3501  histidine kinase  35.77 
 
 		 469 aa  167  2.9999999999999998e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02380  two-component sensor histidine kinase transcription regulator protein  37.28 
 
 		 466 aa  166  1.0000000000000001e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.197859 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2331  sensor histidine kinase  36.23 
 
 		 466 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2598  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.17 
 
 		 469 aa  164  4.0000000000000004e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.833045  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0557  histidine kinase  31.43 
 
 		 559 aa  163  9e-39  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3696  ATPase domain-containing protein  34.87 
 
 		 469 aa  161  2e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2295  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.68 
 
 		 502 aa  161  3e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.202085 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1376  histidine kinase  32.85 
 
 		 481 aa  161  3e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.331507  decreased coverage  0.00000000423782 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0445  histidine kinase  30.56 
 
 		 490 aa  160  4e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000298579  normal  0.0488612 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0032  histidine kinase  37.39 
 
 		 423 aa  159  8e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0452  sensor histidine kinase  32.84 
 
 		 469 aa  159  9e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3082  two component sensor histidine kinase  33.33 
 
 		 477 aa  157  3e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4709  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.49 
 
 		 504 aa  157  3e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2980  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.59 
 
 		 487 aa  157  3e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000876727  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2332  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.55 
 
 		 600 aa  157  4e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2867  sensor histidine kinase  31.06 
 
 		 463 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0147797  normal  0.0868919 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1891  histidine kinase  30.24 
 
 		 508 aa  156  7e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00129948  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2057  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.66 
 
 		 504 aa  155  2e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.799805  normal  0.0394761 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3084  histidine kinase  33.22 
 
 		 496 aa  155  2e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000309277  hitchhiker  0.00206907 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1806  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  27.57 
 
 		 455 aa  155  2e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1623  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.13 
 
 		 352 aa  155  2e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.238567  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1889  histidine kinase  32.13 
 
 		 476 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.984041  normal  0.410021 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0792  histidine kinase  34.82 
 
 		 505 aa  153  5.9999999999999996e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3032  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.47 
 
 		 509 aa  153  5.9999999999999996e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.446581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0760  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.33 
 
 		 474 aa  153  5.9999999999999996e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00113675  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4899  histidine kinase  34.47 
 
 		 583 aa  152  1e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.597043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1371  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.22 
 
 		 639 aa  151  3e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1477  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.56 
 
 		 459 aa  150  4e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000762888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1446  histidine kinase  31.89 
 
 		 486 aa  150  6e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5332  histidine kinase sensor  37.5 
 
 		 471 aa  149  8e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0668535  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3422  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.97 
 
 		 464 aa  149  9e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.12932 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0548  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.4 
 
 		 639 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.271418  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1067  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.15 
 
 		 425 aa  147  5e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.312987  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1923  histidine kinase  30.03 
 
 		 468 aa  147  6e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>