More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2093 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_2093  ABC transporter related  100 
 
 		 380 aa  758    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2597  ABC transporter related  63.64 
 
 		 373 aa  449  1e-125  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.236865  normal  0.853595 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2558  ABC transporter related  63.64 
 
 		 371 aa  446  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2603  ABC transporter related  63.64 
 
 		 371 aa  446  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.758316  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4075  ABC transporter related protein  51.46 
 
 		 370 aa  320  3e-86  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.848295  normal  0.738798 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03320  ABC transporter related  41.11 
 
 		 368 aa  279  5e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1537  ABC transporter related  39.34 
 
 		 355 aa  267  2e-70  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0442847  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1586  ABC transporter related  38.8 
 
 		 355 aa  264  2e-69  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2491  ABC transporter related protein  47.98 
 
 		 379 aa  264  2e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.765027  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0142  ABC transporter related  38.23 
 
 		 363 aa  263  4e-69  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3398  ABC transporter related  41.51 
 
 		 357 aa  262  6e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.129757 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6262  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  40.77 
 
 		 344 aa  261  2e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.543134 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4763  ABC transporter related  39.37 
 
 		 352 aa  258  1e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.373169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2096  ABC transporter ATP-binding protein  40.77 
 
 		 373 aa  254  1.0000000000000001e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.425612 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3126  ABC transporter related  40.72 
 
 		 359 aa  253  3e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4498  ABC transporter related protein  38.19 
 
 		 381 aa  253  3e-66  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0512744  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5360  ABC transporter related  39.95 
 
 		 356 aa  253  5.000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.220389  normal  0.603091 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1098  ABC transporter related  38.31 
 
 		 421 aa  253  5.000000000000001e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.894921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0235  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  40.97 
 
 		 397 aa  252  7e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1821  ABC transporter related  38.68 
 
 		 382 aa  252  7e-66  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1654  putative sugar ABC transporter, ATP-binding protein  40.97 
 
 		 397 aa  252  7e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.217926  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3707  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  44.59 
 
 		 349 aa  251  1e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.151489  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1077  putative sugar ABC transporter, ATP-binding protein  40.97 
 
 		 397 aa  251  1e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.678355  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0069  putative sugar ABC transporter, ATP-binding protein  40.97 
 
 		 397 aa  251  1e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.284527  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0350  putative sugar ABC transporter, ATP-binding protein  40.97 
 
 		 397 aa  251  1e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1236  putative sugar ABC transporter, ATP-binding protein  40.97 
 
 		 397 aa  251  1e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.250734  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3618  ABC transporter related  44.69 
 
 		 361 aa  250  2e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1094  ABC transporter related  43.17 
 
 		 356 aa  251  2e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.910142  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4268  ABC transporter-related protein  42.59 
 
 		 360 aa  250  2e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0892  ABC transporter-related protein  40.85 
 
 		 357 aa  251  2e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3906  ABC transporter related  45.02 
 
 		 361 aa  251  2e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.294989 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3693  ABC transporter related  43.63 
 
 		 357 aa  251  2e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.402658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1743  ABC-type sugar transport systems, ATPase components  40.7 
 
 		 397 aa  251  2e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0993542  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3143  ABC transporter related protein  39.73 
 
 		 379 aa  250  3e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.27093  normal  0.0973127 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06399  hypothetical protein  40.17 
 
 		 385 aa  250  3e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4290  ABC transporter related  42.33 
 
 		 360 aa  249  5e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.439892  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0364  ABC transporter related  40.59 
 
 		 365 aa  249  6e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.915388 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0198  ABC transporter related  38.71 
 
 		 365 aa  249  7e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0274814  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0204  ABC transporter related  38.71 
 
 		 365 aa  249  7e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1495  ABC transporter related  38.92 
 
 		 367 aa  248  9e-65  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.407646  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1543  ABC transporter related  38.92 
 
 		 367 aa  248  9e-65  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0789  ABC transporter  41.21 
 
 		 362 aa  248  1e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2583  ABC transporter related  38.77 
 
 		 353 aa  248  1e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0115601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4137  ABC transporter, ATPase subunit  42.86 
 
 		 362 aa  248  2e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0329  ABC transporter related  37.94 
 
 		 379 aa  247  2e-64  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.939732 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2694  ABC transporter related  40.06 
 
 		 354 aa  248  2e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2052  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  41.29 
 
 		 367 aa  247  2e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.117618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2302  ABC transporter related  42.34 
 
 		 357 aa  247  2e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.996895  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1150  ABC transporter related protein  39.47 
 
 		 379 aa  247  2e-64  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.883021  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0237  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  40.32 
 
 		 357 aa  247  2e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.35763 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2913  ABC transporter for sugar/spermidine/putrescine/iron/thiamine ATP-binding protein  38.44 
 
 		 366 aa  247  2e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.129164 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03330  ABC transporter related  38.98 
 
 		 378 aa  247  3e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0777  ABC transporter related  38.75 
 
 		 367 aa  246  4e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.540961  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1188  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  41.6 
 
 		 365 aa  246  4.9999999999999997e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.27267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5438  ABC transporter related protein  40.6 
 
 		 369 aa  246  6e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3706  ABC transporter related  38.69 
 
 		 364 aa  246  6e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3572  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  38.69 
 
 		 364 aa  245  6.999999999999999e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0973  ABC transporter related protein  39.73 
 
 		 364 aa  245  8e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1878  ABC transporter related  41.21 
 
 		 371 aa  245  8e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.229415  normal  0.103205 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3287  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  44.41 
 
 		 349 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.241244  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0894  ABC transporter related  38.42 
 
 		 370 aa  244  9.999999999999999e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1688  ABC transporter related  39.89 
 
 		 357 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.350685  normal  0.966803 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1158  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  39.34 
 
 		 372 aa  245  9.999999999999999e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1869  ABC transporter related  40.77 
 
 		 357 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.443333 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3931  ABC transporter related protein  37.71 
 
 		 425 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.423842  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3948  ABC sugar transporter, ATPase subunit  41.22 
 
 		 373 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.32305  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4975  ABC transporter related  39.67 
 
 		 359 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.485856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4019  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  38.42 
 
 		 364 aa  244  1.9999999999999999e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0621  ABC transporter related  36.9 
 
 		 370 aa  243  3e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0838339  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1161  ABC transporter related  37.97 
 
 		 367 aa  243  3e-63  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0854  ABC transporter related  44.41 
 
 		 340 aa  243  3e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.627153 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1095  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  41.33 
 
 		 365 aa  243  3e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.107412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0231  ABC transporter related  43.22 
 
 		 363 aa  243  3e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.280397  normal  0.470705 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0947  ABC transporter related  40.31 
 
 		 384 aa  244  3e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.528712  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4019  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  44.41 
 
 		 349 aa  243  3e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1641  ABC transporter related  41.44 
 
 		 353 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0717047  normal  0.0310282 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0218  ABC-type sugar transport system, ATPase component  37.87 
 
 		 367 aa  243  3.9999999999999997e-63  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0122274  hitchhiker  0.000000441743 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1262  ABC transporter related  40.8 
 
 		 357 aa  243  5e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2049  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  41.16 
 
 		 369 aa  243  5e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0114  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  41.53 
 
 		 359 aa  242  6e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.624413 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2417  ABC transporter related  39.73 
 
 		 350 aa  243  6e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.830263  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2462  ABC transporter related  39.73 
 
 		 350 aa  243  6e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1240  ABC transporter related  39.68 
 
 		 360 aa  243  6e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2456  ABC transporter related  39.73 
 
 		 350 aa  243  6e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.913422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3282  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  39.51 
 
 		 349 aa  242  7e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.434692  normal  0.636051 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0296  ABC transporter related  42.19 
 
 		 362 aa  242  7.999999999999999e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.459609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2621  ABC transporter-related protein  41.69 
 
 		 353 aa  242  7.999999999999999e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.295311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3653  ABC transporter-related protein  38.86 
 
 		 338 aa  242  9e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0855337  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1267  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  41.69 
 
 		 365 aa  242  1e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2909  ABC transporter related  36.97 
 
 		 372 aa  241  1e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06937  sugar ABC transportor ATP-binding protein  37.16 
 
 		 364 aa  241  1e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2549  ABC transporter related  38.73 
 
 		 366 aa  241  1e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.071435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0207  ABC transporter related  38.9 
 
 		 375 aa  242  1e-62  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.91298  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2907  ABC transporter related  38.83 
 
 		 366 aa  241  1e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.147416  normal  0.101064 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3225  ABC transporter related  42.01 
 
 		 373 aa  241  1e-62  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.711739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3851  ABC transporter related  39.73 
 
 		 375 aa  241  1e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2858  ABC transporter related  37.19 
 
 		 362 aa  241  1e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0244  ABC transporter related protein  39.78 
 
 		 368 aa  242  1e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.414588 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1284  ABC transporter related  44.73 
 
 		 345 aa  241  2e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3611  ABC transporter related  36.77 
 
 		 370 aa  241  2e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>