More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0291 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_0291  SNARE associated Golgi protein  100 
 
 
239 aa  458  9.999999999999999e-129  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.702057  normal  0.0958134 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2381  SNARE associated Golgi protein  66.67 
 
 
224 aa  281  8.000000000000001e-75  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.273471 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0606  SNARE associated Golgi protein-related protein  63.26 
 
 
231 aa  249  3e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0130  hypothetical protein  43.07 
 
 
215 aa  167  1e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00380  uncharacterized membrane-associated protein  47.57 
 
 
225 aa  166  2e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.157749 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4049  alkaline phosphatase  44.17 
 
 
213 aa  166  2.9999999999999998e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.257312  hitchhiker  0.00220744 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03490  uncharacterized membrane-associated protein  43.52 
 
 
216 aa  162  6e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25760  uncharacterized membrane-associated protein  45.27 
 
 
228 aa  161  8.000000000000001e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4919  SNARE associated Golgi protein-related protein  49.7 
 
 
224 aa  160  2e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.19679  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2233  SNARE associated Golgi protein  45.02 
 
 
266 aa  159  4e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.300911  normal  0.0707133 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18740  uncharacterized membrane-associated protein  46.43 
 
 
248 aa  158  9e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.829246  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1027  SNARE associated Golgi protein  49.38 
 
 
325 aa  155  7e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.649143  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2342  SNARE associated Golgi protein-like protein  44.56 
 
 
228 aa  150  1e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.43138  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2092  hypothetical protein  43.54 
 
 
266 aa  150  1e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.613654  normal  0.0908171 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0079  membrane protein  50.64 
 
 
217 aa  149  3e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1349  SNARE associated Golgi protein-like protein  46.24 
 
 
241 aa  147  1.0000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9346  alkaline phosphatase  41.79 
 
 
205 aa  141  9e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.965489  normal  0.785405 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1970  hypothetical protein  41.85 
 
 
232 aa  134  9.999999999999999e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06150  uncharacterized membrane-associated protein  41.54 
 
 
205 aa  134  1.9999999999999998e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.430266  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2975  SNARE associated Golgi protein  38.69 
 
 
216 aa  129  3e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0123855  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0282  DedA family protein  36.46 
 
 
202 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0636  SNARE associated Golgi protein  41.5 
 
 
217 aa  125  4.0000000000000003e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1525  SNARE associated Golgi protein  45.89 
 
 
228 aa  123  3e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.365911  hitchhiker  0.00841691 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36950  uncharacterized membrane-associated protein  40.87 
 
 
241 aa  122  4e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0707  hypothetical protein  35.12 
 
 
210 aa  122  5e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0652069  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0502  hypothetical protein  36.81 
 
 
207 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.773661  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0514  alkaline phosphatase  46.95 
 
 
206 aa  121  9.999999999999999e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3867  DedA family protein  41.72 
 
 
198 aa  120  1.9999999999999998e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.537439 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2976  DedA family protein  36.51 
 
 
198 aa  119  3e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.819904  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3743  SNARE associated Golgi protein  38.19 
 
 
215 aa  119  4.9999999999999996e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.362202  normal  0.890971 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1046  SNARE associated Golgi protein-related protein  37.19 
 
 
202 aa  119  6e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2737  SNARE associated Golgi protein  35.29 
 
 
206 aa  118  7e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.388255  normal  0.958337 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0625  SNARE associated Golgi protein  37.04 
 
 
203 aa  116  3e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  2.21493e-35 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0611  SNARE associated Golgi protein  36.32 
 
 
208 aa  116  3e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0454  hypothetical protein  34.52 
 
 
213 aa  116  3e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.62301 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2080  hypothetical protein  36.17 
 
 
199 aa  114  1.0000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0320169  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0095  DedA family protein  37.81 
 
 
205 aa  114  1.0000000000000001e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1977  SNARE associated Golgi protein  31.66 
 
 
201 aa  113  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.669435 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1806  hypothetical protein  32.2 
 
 
203 aa  113  3e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.87635  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2081  putative integral membrane protein dedA-like protein  37.43 
 
 
202 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.253435  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0819  DedA family protein  30.69 
 
 
202 aa  112  5e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0339  SNARE associated Golgi protein  36.71 
 
 
206 aa  112  7.000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000282866  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0191  alkaline phosphatase  35.03 
 
 
209 aa  111  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0996912 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1836  SNARE associated Golgi protein  34.15 
 
 
208 aa  109  5e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1693  SNARE associated Golgi protein  30.65 
 
 
203 aa  108  9.000000000000001e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1772  SNARE associated Golgi protein  30.39 
 
 
208 aa  108  9.000000000000001e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2291  SNARE associated Golgi protein  38.38 
 
 
202 aa  107  1e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1749  hypothetical protein  32.14 
 
 
212 aa  108  1e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.17424 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2364  hypothetical protein  37.65 
 
 
205 aa  107  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000112613  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5727  SNARE associated Golgi protein-related protein  39.89 
 
 
206 aa  107  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.196886  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1314  SNARE associated Golgi protein-related protein  34.52 
 
 
201 aa  106  3e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.38918  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1084  DedA-like protein  32.62 
 
 
201 aa  105  7e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.672419  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0665  SNARE associated Golgi protein  29.9 
 
 
212 aa  105  8e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.267065  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1078  DedA family protein  30.85 
 
 
195 aa  105  9e-22  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2135  DedA family protein  37.3 
 
 
202 aa  105  9e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0747  alkaline phosphatase  30.54 
 
 
214 aa  104  1e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0119068  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1959  hypothetical protein  32.8 
 
 
211 aa  103  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.822135 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3002  SNARE associated Golgi protein  32.66 
 
 
205 aa  103  3e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1303  SNARE associated Golgi protein  34.39 
 
 
218 aa  102  4e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0280885  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1404  SNARE associated Golgi protein  34.39 
 
 
218 aa  102  4e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0601  SNARE associated Golgi protein-related protein  37.24 
 
 
205 aa  102  5e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4718  SNARE associated Golgi protein-like protein  32.68 
 
 
207 aa  102  7e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.517829  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1081  putative alkaline phosphatase  32.63 
 
 
198 aa  102  7e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.524919 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2546  hypothetical protein  34.92 
 
 
218 aa  101  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0869  hypothetical protein  34.57 
 
 
203 aa  100  2e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1070  ribosomal protein L22  30.54 
 
 
199 aa  100  3e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2561  hypothetical protein  37.66 
 
 
209 aa  99.4  4e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0234  SNARE associated Golgi protein  37.06 
 
 
178 aa  99  6e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1030  SNARE associated Golgi protein-like protein  39.61 
 
 
203 aa  98.6  8e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0574  SNARE associated Golgi protein  35.98 
 
 
199 aa  98.6  8e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.24948  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17501  DedA family alkaline phosphatase-like protein  30.77 
 
 
220 aa  98.6  8e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0147  putative alkaline phosphatase-like protein  34.38 
 
 
219 aa  97.8  1e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.629007  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0619  hypothetical protein  35.81 
 
 
211 aa  97.4  2e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.512378  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0260  alkaline phosphatase-like protein  34.97 
 
 
202 aa  97.4  2e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.894036  normal  0.360147 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46140  DedA family membrane-associated protein  32.06 
 
 
202 aa  97.4  2e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0874332  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1401  hypothetical protein  41.01 
 
 
200 aa  97.1  2e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2075  DedA family protein  33.57 
 
 
204 aa  96.7  3e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.190236  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0722  SNARE associated Golgi protein  30.58 
 
 
201 aa  95.9  5e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000026283  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0719  hypothetical protein  30.41 
 
 
208 aa  95.9  5e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000531966  normal  0.139707 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0975  dedA family protein  30.05 
 
 
201 aa  95.1  9e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000365515  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2588  SNARE associated Golgi protein  30.5 
 
 
203 aa  94.7  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0902  dedA family protein  31.03 
 
 
201 aa  94.7  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.209208  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4471  dedA family protein  31.03 
 
 
201 aa  94.7  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.238489 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2536  SNARE associated Golgi protein  30.5 
 
 
203 aa  94.7  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0773  DedA family protein  35.44 
 
 
201 aa  94.4  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000448539  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0721  dedA family protein; alkaline phosphatase-like protein  35.44 
 
 
201 aa  94  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.223536  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0708  dedA family protein; alkaline phosphatase-like protein  35.44 
 
 
201 aa  94  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0751539  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0105  SNARE associated Golgi protein  36.42 
 
 
208 aa  93.6  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0810  DedA family protein  35.44 
 
 
201 aa  94.4  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.621407  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0865  dedA family protein  35.44 
 
 
201 aa  94  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0906  dedA family protein  35.44 
 
 
201 aa  94  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.29745e-42 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1898  SNARE associated Golgi protein  33.51 
 
 
200 aa  93.2  3e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0195021  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20761  DedA family alkaline phosphatase-like protein  28.29 
 
 
218 aa  93.2  3e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.167528  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1952  DedA family protein  32.56 
 
 
215 aa  92.8  4e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1601  hypothetical protein  31.22 
 
 
202 aa  92.4  6e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.851852  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2080  dedA family protein  33.51 
 
 
200 aa  91.7  9e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1864  DedA family integral membrane protein  33.51 
 
 
200 aa  91.7  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0968517  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1854  DedA family integral membrane protein  33.51 
 
 
200 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.359684  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2048  DedA family protein  33.51 
 
 
200 aa  91.7  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3271  dedA family protein  32.98 
 
 
200 aa  91.3  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>