271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_R0006 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_R0006  tRNA-Trp  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0090  tRNA-Trp  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0098  tRNA-Trp  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0104922 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0099  tRNA-Trp  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0501832  normal  0.522797 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0035  tRNA-Trp  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.349144  normal  0.230187 
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00066  tRNA-Trp  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.533976  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0108  tRNA-Trp  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4130  tRNA-Trp  88.16 
 
 		 78 bp  79.8  0.00000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0268004  normal  0.308865 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4198  tRNA-Trp  88.16 
 
 		 78 bp  79.8  0.00000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000399283  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0041  tRNA-Trp  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.840083  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4709  tRNA-Trp  88.16 
 
 		 78 bp  79.8  0.00000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.9349  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4323  tRNA-Trp  88.16 
 
 		 78 bp  79.8  0.00000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.654962  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4122  tRNA-Trp  88.16 
 
 		 78 bp  79.8  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5198  tRNA-Trp  88.16 
 
 		 78 bp  79.8  0.00000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0861093  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4179  tRNA-Trp  88.16 
 
 		 78 bp  79.8  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0092  tRNA-Trp  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0125  tRNA-Trp  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0562008  normal  0.0871629 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4228  tRNA-Trp  88.16 
 
 		 78 bp  79.8  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.287141  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4107  tRNA-Trp  88.16 
 
 		 78 bp  79.8  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4287  tRNA-Trp  88.16 
 
 		 78 bp  79.8  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5086  tRNA-Trp  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.446853  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6002  tRNA-Trp  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0474  tRNA-Trp  88.16 
 
 		 78 bp  79.8  0.00000000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000513688  normal  0.0378852 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0032  tRNA-Trp  88.41 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0013  tRNA-Trp  86.84 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000156686  normal  0.0425769 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0089  tRNA-Trp  86.84 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0007  tRNA-Trp  86.84 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0014  tRNA-Thr  89.66 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tTrp01  tRNA-Trp  85.53 
 
 		 79 bp  63.9  0.000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0011  tRNA-Trp  87.5 
 
 		 73 bp  63.9  0.000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.998721  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA38  tRNA-Trp  85.71 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.997102 
 
 
-
 
NC_004310  BR_t14  tRNA-Thr  87.93 
 
 		 73 bp  60  0.00000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0034  tRNA-Trp  85.71 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0220727 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0931  tRNA-Thr  87.93 
 
 		 78 bp  60  0.00000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0042  tRNA-Thr  87.93 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0011  tRNA-Trp  85.71 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0058  tRNA-Thr  87.93 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0760  tRNA-Thr  87.93 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1116  tRNA-Trp  86.89 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.493252  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4779  tRNA-Trp  86.89 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.159164  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna037  tRNA-Trp  86.89 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4298  tRNA-Trp  85.51 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.566506  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2454  tRNA-Trp  86.89 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0012  tRNA-Trp  85.51 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.714029  normal  0.66542 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0011  tRNA-Trp  85.51 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0431964  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0008  tRNA-Trp  85.51 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna152  tRNA-Trp  86.89 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.696171  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0992  tRNA-Thr  87.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2989  tRNA-Thr  87.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.920581  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Thr-3  tRNA-Thr  87.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.732279  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0013  tRNA-Trp  86.67 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.799114  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0155  tRNA-Thr  87.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3032  tRNA-Thr  87.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1602  tRNA-Thr  87.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.57437  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0040  tRNA-Trp  86.67 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0487601  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2927  tRNA-Thr  87.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0046  tRNA-Trp  84.21 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2621  tRNA-Thr  87.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0778487  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t44  tRNA-His  96.77 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0633005  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0040  tRNA-His  96.77 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.239728  normal  0.262855 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA32  tRNA-His  96.77 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.922886  normal  0.953507 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0050  tRNA-Trp  87.27 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.391043  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0033    87.3 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.465257  normal  0.162996 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA24  tRNA-Arg  87.3 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0111791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R52  tRNA-His  96.77 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.953657 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R54  tRNA-His  96.77 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.927738 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0683  tRNA-His  96.77 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.684611  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0043  tRNA-His  96.77 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.130453 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0004  tRNA-Trp  100 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000305052  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0041  tRNA-His  96.77 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.137953 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0036  tRNA-Arg  87.3 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.219616  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0159  tRNA-Trp  86.44 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0069  tRNA-His  96.77 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000556793  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3503  tRNA-His  96.77 
 
 		 78 bp  54  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3505  tRNA-His  96.77 
 
 		 78 bp  54  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0024  tRNA-His  96.77 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000441767  unclonable  9.7747e-19 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41330  tRNA-His  96.77 
 
 		 73 bp  54  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.908879  normal  0.386622 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60220  tRNA-His  96.77 
 
 		 73 bp  54  0.000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1323  tRNA-Trp  86.44 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000340383  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0788  tRNA-His  96.77 
 
 		 78 bp  54  0.000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.611877  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PGt08  tRNA-Trp  86.21 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0016  tRNA-Trp  89.13 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000000083767  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0040  tRNA-Lys  86.21 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0031  tRNA-Trp  87.04 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0013  tRNA-Trp  87.04 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.635468  normal  0.0154478 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00245  tRNA-Trp  86.21 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01015  tRNA-Trp  86.21 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0442  tRNA-Trp  90.24 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00029121  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Trp-1  tRNA-Trp  90.24 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.208589  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3214t  tRNA-Trp  86.79 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1463  tRNA-Trp  90.24 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000838857  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1670  tRNA-Trp  90.24 
 
 		 78 bp  50.1  0.00007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00343188  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3141t  tRNA-Trp  86.79 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.57879  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1720  tRNA-Trp  90.24 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000880409  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0018  tRNA-Trp  84.06 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00848824 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0031  tRNA-Trp  84.06 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.214568  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1114t  tRNA-Trp  86.79 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.143178  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RS02241  tRNA-Phe  91.67 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0000057797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0010  tRNA-Phe  91.67 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0018  tRNA-Phe  91.67 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.290325  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>