More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_2916 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_2916  glutamine amidotransferase class-I  100 
 
 
244 aa  503  9.999999999999999e-143  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.186988 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3722  glutamine amidotransferase class-I  53.48 
 
 
239 aa  234  9e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.777464  normal  0.508189 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2175  hypothetical protein  31.47 
 
 
232 aa  138  1e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2104  glutamine amidotransferase class-I  30.3 
 
 
232 aa  137  2e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.503763 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2203  hypothetical protein  30.6 
 
 
232 aa  134  1.9999999999999998e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1420  amidotransferase  33.85 
 
 
243 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.388788  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1842  amidotransferase  32.39 
 
 
244 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2529  GMP synthase glutamine amidotransferase subunit  30.37 
 
 
232 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.777754 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1451  amidotransferase  34.03 
 
 
244 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.410018  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3868  amidotransferase  32.39 
 
 
244 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.160036 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1741  amidotransferase  31.73 
 
 
240 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0299  glutamine amidotransferase class-I  37.64 
 
 
240 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4674  amidotransferase, putative  29.58 
 
 
234 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.623837 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0888  glutamine amidotransferase class-I  35.53 
 
 
251 aa  117  1.9999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1182  glutamine amidotransferase class-I  31 
 
 
243 aa  116  3e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2694  amidotransferase  31.33 
 
 
233 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2063  hypothetical protein  29.57 
 
 
242 aa  115  5e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0215338  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1873  amidotransferase  29.57 
 
 
242 aa  113  3e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1837  glutamine amidotransferase, class I  35.35 
 
 
226 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0599314  normal  0.354168 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0692  glutamine amidotransferase class-I  37.87 
 
 
230 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.767227  normal  0.956702 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42010  amidotransferase  29.13 
 
 
240 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0770  glutamine amidotransferase class I  36.26 
 
 
231 aa  110  2.0000000000000002e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2745  glutamine amidotransferase  34.27 
 
 
240 aa  107  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.562281  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3566  amidotransferase  32.45 
 
 
240 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3519  glutamine amidotransferase class-I  32.52 
 
 
236 aa  106  3e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.307649 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1126  glutamine amidotransferase, class I  34.18 
 
 
237 aa  106  4e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.527906  normal  0.244414 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1523  glutamine amidotransferase  33.33 
 
 
240 aa  105  6e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0721  glutamine amidotransferase class-I  35.15 
 
 
230 aa  105  7e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.31334 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2587  amidotransferase  33.51 
 
 
241 aa  105  7e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0493752 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3985  glutamine amidotransferase  35.05 
 
 
248 aa  104  1e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.759173 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0696  glutamine amidotransferase class-I  36.1 
 
 
231 aa  104  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.156781  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03836  glutamine amidotransferase  37.5 
 
 
250 aa  103  2e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.172302  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2155  glutamine amidotransferase  35.16 
 
 
243 aa  103  3e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1396  glutamine amidotransferase class-I  35.76 
 
 
238 aa  102  4e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.187754 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0734  glutamine amidotransferase class-I  35.54 
 
 
233 aa  102  7e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1670  glutamine amidotransferase  37.27 
 
 
240 aa  100  3e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0376  glutamine amidotransferase class-I  31.84 
 
 
225 aa  96.7  3e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2020  glutamine amidotransferase class-I  31.84 
 
 
225 aa  96.7  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0213  glutamine amidotransferase  36.16 
 
 
238 aa  96.3  4e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.486178 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0865  glutamine amidotransferase class-I  32 
 
 
225 aa  95.5  7e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4317  glutamine amidotransferase class-I  40.54 
 
 
243 aa  95.1  8e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1742  glutamine amidotransferase  36.65 
 
 
240 aa  95.1  9e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0557  glutamine amidotransferase class-I  29.9 
 
 
236 aa  94.4  1e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2917  glutamine amidotransferase class-I domain protein  35.57 
 
 
237 aa  94  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2532  glutamine amidotransferase class-I  35.57 
 
 
237 aa  94  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1359  glutamine amidotransferase class-I  39.39 
 
 
247 aa  92.8  4e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1121  glutamine amidotransferase class-I  33.73 
 
 
239 aa  91.7  9e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.997537 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2584  glutamine amidotransferase class-I  34.09 
 
 
241 aa  91.3  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2225  putative glutamine amidotransferase class-I  31.72 
 
 
236 aa  90.1  3e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.987752  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1424  glutamine amidotransferase  37.68 
 
 
241 aa  89  7e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42180  hypothetical protein  36.43 
 
 
228 aa  88.6  9e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0876  hypothetical protein  32.49 
 
 
236 aa  87.4  2e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3633  glutamine amidotransferase class-I  32.4 
 
 
293 aa  87  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.125092  normal  0.0172183 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0325  glutamine amidotransferase class-I  36.31 
 
 
250 aa  87  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.193734 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00200  conserved hypothetical protein  30.19 
 
 
252 aa  86.7  3e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.45844 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1607  glutamine amidotransferase class-I  35.26 
 
 
258 aa  87  3e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.471476  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1887  glutamine amidotransferase class-I  28.57 
 
 
237 aa  87  3e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3437  glutamine amidotransferase class-I  32.04 
 
 
305 aa  86.3  5e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.136492 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1762  glutamine amidotransferase  32.93 
 
 
250 aa  85.1  9e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4097  glutamine amidotransferase class-I  27.88 
 
 
282 aa  85.1  9e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.593636  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3263  glutamine amidotransferase  32.7 
 
 
247 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3746  glutamine amidotransferase class-I  31.49 
 
 
286 aa  84.3  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.47135  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2875  glutamine amidotransferase class-I  28.85 
 
 
235 aa  84  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.511003  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0948  glutamine amidotransferase  33.33 
 
 
233 aa  83.2  0.000000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5032  glutamine amidotransferase class-I  32.97 
 
 
282 aa  82.8  0.000000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1856  glutamine amidotransferase  30.1 
 
 
243 aa  82  0.000000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.991157  decreased coverage  0.0021836 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1504  glutamine amidotransferase class-I  34.75 
 
 
228 aa  81.6  0.000000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1805  glutamine amidotransferase class-I  29.69 
 
 
247 aa  81.6  0.00000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.595238 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0721  glutamine amidotransferase class-I  30.9 
 
 
238 aa  81.6  0.00000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.706458  normal  0.650481 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3672  glutamine amidotransferase class-I  32.89 
 
 
236 aa  80.9  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2563  glutamine amidotransferase  31.82 
 
 
237 aa  79.3  0.00000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.703088  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2712  glutamine amidotransferase class-I  35.46 
 
 
228 aa  79.3  0.00000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0635027 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1509  glutamine amidotransferase class-I  29.06 
 
 
241 aa  79  0.00000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3577  glutamine amidotransferase class I  30.34 
 
 
232 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.180567  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3619  glutamine amidotransferase-like protein  33.15 
 
 
229 aa  78.2  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.681505 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3619  glutamine amidotransferase class-I  33.92 
 
 
235 aa  77.8  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4515  glutamine amidotransferase class-I  32.52 
 
 
245 aa  77  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.201421  normal  0.0267832 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1289  glutamine amidotransferase  31.68 
 
 
246 aa  76.6  0.0000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0579596  normal  0.253406 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2859  hypothetical protein  29.05 
 
 
230 aa  75.5  0.0000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2521  glutamine amidotransferase  33.33 
 
 
246 aa  75.5  0.0000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00189035  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1637  glutamine amidotransferase class-I  32.75 
 
 
245 aa  74.7  0.000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.419704  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5138  GMP synthase - Glutamine amidotransferase domain- like protein  30.5 
 
 
238 aa  74.7  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.127338  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2980  glutamine amidotransferase  31.01 
 
 
260 aa  74.7  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0885879  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1753  glutamine amidotransferase class-I  29.61 
 
 
249 aa  73.9  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2153  glutamine amidotransferase class-I  29.65 
 
 
231 aa  73.6  0.000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.885332 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1045  glutamine amidotransferase class-I  26.98 
 
 
236 aa  73.2  0.000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7211  putative glutamine amidotransferase, class-I  28.92 
 
 
276 aa  73.6  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.724633  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3785  glutamine amidotransferase class-I  30 
 
 
258 aa  73.6  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134927  normal  0.284097 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1011  glutamine amidotransferase  33.33 
 
 
260 aa  73.6  0.000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.352701  normal  0.0294382 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0839  glutamine amidotransferase  30.51 
 
 
243 aa  73.2  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2029  glutamine amidotransferase  30.32 
 
 
288 aa  73.2  0.000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1270  glutamine amidotransferase  31.9 
 
 
243 aa  72.8  0.000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.17353  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0879  glutamine amidotransferase class-I  30.12 
 
 
245 aa  72.8  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5145  glutamine amidotransferase class-I  30.39 
 
 
240 aa  72.4  0.000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.240157 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0065  glutamine amidotransferase  28.65 
 
 
255 aa  72  0.000000000009  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1432  GMP synthase  31.34 
 
 
511 aa  71.2  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0118817  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4250  glutamine amidotransferase class-I  33.54 
 
 
245 aa  71.6  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0438  hypothetical protein  27.78 
 
 
241 aa  71.2  0.00000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.696957 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4275  glutamine amidotransferase class-I  26.78 
 
 
308 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2237  glutamine amidotransferase class-I  29.49 
 
 
233 aa  70.9  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>