More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_1950 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_1950  ABC transporter related  100 
 
 
377 aa  763    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.303388  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1648  maltose/maltodextrin import ATP-binding protein  76.5 
 
 
373 aa  546  1e-154  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.43035  hitchhiker  0.00000048484 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3303  ABC transporter related  69.95 
 
 
365 aa  517  1.0000000000000001e-145  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.700812  normal  0.735765 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1516  ABC transporter related  68.75 
 
 
369 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00369229  normal  0.0599486 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2870  ABC alpha-glucoside transporter, ATPase subunit AglK  67.65 
 
 
369 aa  491  1e-137  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0548699  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1150  ABC transporter related  67.57 
 
 
372 aa  486  1e-136  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.292125  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0391  ABC transporter related  61.92 
 
 
362 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.53752  normal  0.432808 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0359  ABC transporter related  61.64 
 
 
362 aa  448  1e-125  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.348394 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0296  ABC transporter related  61.24 
 
 
362 aa  437  1e-121  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.459609  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0789  ABC transporter  61.34 
 
 
362 aa  431  1e-119  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4342  ABC transporter related  61.56 
 
 
366 aa  422  1e-117  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.949394 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2858  ABC transporter related  59.24 
 
 
362 aa  417  9.999999999999999e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2913  ABC transporter for sugar/spermidine/putrescine/iron/thiamine ATP-binding protein  57.46 
 
 
366 aa  405  1.0000000000000001e-112  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.129164 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3645  hypothetical protein  57.49 
 
 
374 aa  392  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.563408  normal  0.0436872 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3948  ABC sugar transporter, ATPase subunit  56.7 
 
 
373 aa  385  1e-106  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.32305  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0494  ABC transporter related  52.19 
 
 
369 aa  360  2e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0952416  decreased coverage  0.000489409 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1648  ABC transporter related  51.97 
 
 
371 aa  358  9.999999999999999e-98  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.783351 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0724  ABC sugar transporter, ATPase subunit  52.79 
 
 
369 aa  354  1e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0847542  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2507  ABC transporter related  52.51 
 
 
369 aa  353  2e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0382888  normal  0.462927 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3809  ABC transporter related  52.09 
 
 
342 aa  354  2e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2639  ABC transporter related  52.51 
 
 
369 aa  353  2e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.716845  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2615  ABC transporter related  52.05 
 
 
369 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5155  ABC transporter related protein  53.31 
 
 
395 aa  352  5.9999999999999994e-96  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.766387 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5922  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  52.51 
 
 
369 aa  351  1e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3242  ABC transporter related  53.07 
 
 
369 aa  351  1e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.260305  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0975  ABC transporter related protein  52.78 
 
 
361 aa  350  2e-95  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1981  ABC transporter related  51.78 
 
 
368 aa  350  2e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.114074  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2591  ABC transporter related  51.78 
 
 
368 aa  350  2e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0994309  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3244  ABC transporter-related protein  50.26 
 
 
390 aa  349  4e-95  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2943  ABC transporter related  51.68 
 
 
333 aa  349  4e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.141837  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0337  maltose/mannitol ABC transporter, ATP-binding protein, putative  52.25 
 
 
370 aa  347  2e-94  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.111228  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0636  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  52.25 
 
 
370 aa  347  2e-94  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.275932  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2470  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  52.25 
 
 
370 aa  347  2e-94  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0243761  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0877  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  52.25 
 
 
370 aa  347  2e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0880  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  52.25 
 
 
388 aa  347  2e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0084  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  52.25 
 
 
370 aa  347  2e-94  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.145989  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03907  fused maltose transport subunit, ATP-binding component of ABC superfamily/regulatory protein  49.73 
 
 
371 aa  346  3e-94  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3960  ABC transporter related protein  49.73 
 
 
371 aa  346  3e-94  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5516  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  49.73 
 
 
371 aa  346  3e-94  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.301255  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1040  ABC sugar transporter, ATP-binding protein  52.25 
 
 
370 aa  346  3e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0739  ABC transporter related  52.5 
 
 
361 aa  347  3e-94  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6938  ABC sugar transporter, ATPase subunit  55.49 
 
 
359 aa  346  3e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0063026  normal  0.624171 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0699  maltose/mannitol ABC transporter, ATP-binding protein, putative  52.25 
 
 
370 aa  347  3e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4587  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  49.73 
 
 
371 aa  346  3e-94  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4497  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  49.73 
 
 
371 aa  346  3e-94  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03867  hypothetical protein  49.73 
 
 
371 aa  346  3e-94  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3994  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  49.73 
 
 
371 aa  346  3e-94  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.153747  normal  0.57528 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4275  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  49.73 
 
 
371 aa  346  3e-94  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0706  ABC transporter related  52.37 
 
 
369 aa  346  4e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.860798  normal  0.259574 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0183  ABC transporter related  55.8 
 
 
359 aa  346  5e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0307  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  51.4 
 
 
333 aa  345  7e-94  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.216758  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4572  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  50 
 
 
369 aa  345  8e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.535764  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4422  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  50 
 
 
369 aa  345  8e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00031053 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4573  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  50 
 
 
369 aa  345  8e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.01143 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4487  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  50 
 
 
369 aa  345  8e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4624  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  50 
 
 
369 aa  345  8e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.102994 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2522  ABC transporter-related protein  55.62 
 
 
391 aa  345  1e-93  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3324  ABC transporter-related protein  50.68 
 
 
378 aa  343  2e-93  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0240  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  50.14 
 
 
369 aa  343  2.9999999999999997e-93  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0282  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  51.12 
 
 
333 aa  343  4e-93  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.911621  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4881  ABC transporter related  50 
 
 
384 aa  343  4e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3284  ABC transporter related  50 
 
 
384 aa  343  4e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.875863 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3912  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  49.86 
 
 
369 aa  342  5e-93  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.31471  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3127  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  54.72 
 
 
371 aa  342  5e-93  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.507344  normal  0.0367052 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0380  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  49.86 
 
 
369 aa  342  5e-93  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0308  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  49.86 
 
 
369 aa  342  5e-93  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0575052  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3324  ABC transporter related  53.07 
 
 
359 aa  342  8e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2140  sugar ATP-binding ABC transporter protein  52.1 
 
 
369 aa  341  1e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.112283  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4579  ABC transporter related  50.27 
 
 
385 aa  341  1e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000381614 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2007  ABC transporter related  55.97 
 
 
367 aa  340  2e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5494  ABC transporter related  51.69 
 
 
341 aa  340  2e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0266048 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0636  ABC transporter related  50.68 
 
 
380 aa  340  2e-92  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5203  ABC transporter related  50 
 
 
385 aa  340  2e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.300266  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5656  ABC transporter related  50 
 
 
385 aa  340  2e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.115239  normal  0.353379 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4348  ABC transporter related  52.84 
 
 
358 aa  340  2e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00012327 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4132  ABC transporter related  57.55 
 
 
357 aa  340  2.9999999999999998e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.751697  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4439  ABC transporter related  52.25 
 
 
333 aa  338  5.9999999999999996e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0195171  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0022  ABC transporter related  51.12 
 
 
342 aa  338  7e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.51164  normal  0.326326 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4470  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  50 
 
 
369 aa  338  7e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.258149  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4019  ABC transporter related  52.84 
 
 
358 aa  338  7e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3851  ABC transporter related  51.24 
 
 
375 aa  338  7e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2614  ABC transporter related  50.41 
 
 
376 aa  338  9e-92  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4930  ABC transporter related  49.87 
 
 
382 aa  338  9e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.110099 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0231  ABC transporter related  50.42 
 
 
363 aa  338  9e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.280397  normal  0.470705 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3198  ABC transporter related  50 
 
 
382 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.141771 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6323  ABC transporter related  50.53 
 
 
384 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3906  ABC transporter related  57.14 
 
 
361 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.294989 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5485  ABC transporter related  49.87 
 
 
382 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0011502 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0462  ABC transporter related  53.1 
 
 
365 aa  337  2.9999999999999997e-91  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6023  ABC transporter related  50 
 
 
384 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.963161 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2011  ABC transporter ATP-binding protein  51.12 
 
 
361 aa  337  2.9999999999999997e-91  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0583753  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0259  ABC transporter related protein  52.58 
 
 
366 aa  335  1e-90  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0120  ABC transporter related protein  52.58 
 
 
366 aa  335  1e-90  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2353  ABC transporter related  48.27 
 
 
383 aa  334  1e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.175243  normal  0.108483 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3143  ABC transporter related protein  49.34 
 
 
379 aa  334  2e-90  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.27093  normal  0.0973127 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0967  ABC transporter related  53.31 
 
 
368 aa  334  2e-90  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.855115  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3427  ABC transporter related  52.37 
 
 
349 aa  333  2e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0913  maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  53.31 
 
 
368 aa  334  2e-90  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.872871  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0228  ABC transporter related  49.73 
 
 
353 aa  333  3e-90  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3882  sugar transport ATP-binding protein  53.58 
 
 
366 aa  333  3e-90  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.151408 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>