More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_1126 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_1126  glutamine amidotransferase, class I  100 
 
 
237 aa  484  1e-136  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.527906  normal  0.244414 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1837  glutamine amidotransferase, class I  59.01 
 
 
226 aa  260  1e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0599314  normal  0.354168 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0376  glutamine amidotransferase class-I  49.11 
 
 
225 aa  216  2e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2020  glutamine amidotransferase class-I  49.11 
 
 
225 aa  215  5e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0865  glutamine amidotransferase class-I  48.21 
 
 
225 aa  207  1e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1396  glutamine amidotransferase class-I  48.62 
 
 
238 aa  205  4e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.187754 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0888  glutamine amidotransferase class-I  46.85 
 
 
251 aa  196  4.0000000000000005e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2225  putative glutamine amidotransferase class-I  47.64 
 
 
236 aa  183  2.0000000000000003e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.987752  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0770  glutamine amidotransferase class I  37.99 
 
 
231 aa  158  9e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1182  glutamine amidotransferase class-I  38.82 
 
 
243 aa  155  5.0000000000000005e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3519  glutamine amidotransferase class-I  38.89 
 
 
236 aa  150  1e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.307649 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2175  hypothetical protein  34.6 
 
 
232 aa  145  4.0000000000000006e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2203  hypothetical protein  34.18 
 
 
232 aa  141  7e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2694  amidotransferase  35.5 
 
 
233 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2104  glutamine amidotransferase class-I  32.62 
 
 
232 aa  136  2e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.503763 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1842  amidotransferase  32.76 
 
 
244 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0299  glutamine amidotransferase class-I  39.24 
 
 
240 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3868  amidotransferase  32.76 
 
 
244 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.160036 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1420  amidotransferase  32.76 
 
 
243 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.388788  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1451  amidotransferase  32.76 
 
 
244 aa  132  3e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.410018  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0692  glutamine amidotransferase class-I  36.48 
 
 
230 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.767227  normal  0.956702 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0696  glutamine amidotransferase class-I  35.22 
 
 
231 aa  127  1.0000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.156781  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0721  glutamine amidotransferase class-I  35.06 
 
 
230 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.31334 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2529  GMP synthase glutamine amidotransferase subunit  30.47 
 
 
232 aa  125  7e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.777754 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42010  amidotransferase  33.04 
 
 
240 aa  124  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1741  amidotransferase  31.72 
 
 
240 aa  123  3e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3566  amidotransferase  33.04 
 
 
240 aa  122  4e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4674  amidotransferase, putative  29.87 
 
 
234 aa  122  4e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.623837 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0734  glutamine amidotransferase class-I  34.19 
 
 
233 aa  122  5e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1873  amidotransferase  33.48 
 
 
242 aa  122  6e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2063  hypothetical protein  33.04 
 
 
242 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0215338  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2587  amidotransferase  31.09 
 
 
241 aa  118  7.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0493752 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2916  glutamine amidotransferase class-I  34.18 
 
 
244 aa  106  4e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.186988 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00200  conserved hypothetical protein  30.81 
 
 
252 aa  96.7  3e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.45844 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3722  glutamine amidotransferase class-I  32.34 
 
 
239 aa  96.3  4e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.777464  normal  0.508189 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3672  glutamine amidotransferase class-I  33.96 
 
 
236 aa  86.7  3e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006682  CNM00680  cytoplasm protein, putative  32.94 
 
 
357 aa  80.5  0.00000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.822893  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1121  glutamine amidotransferase class-I  27.68 
 
 
239 aa  80.1  0.00000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.997537 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3149  glutamine amidotransferase class-I  30.06 
 
 
278 aa  79.7  0.00000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2047  glutamine amidotransferase class-I  35.1 
 
 
240 aa  78.6  0.00000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0380148  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4317  glutamine amidotransferase class-I  29.5 
 
 
243 aa  77.8  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0041  glutamine amidotransferase class-I  27.78 
 
 
246 aa  78.2  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1837  glutamine amidotransferase (class I)  26.43 
 
 
243 aa  75.9  0.0000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2563  glutamine amidotransferase  28.57 
 
 
237 aa  75.5  0.0000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.703088  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1753  glutamine amidotransferase class-I  28.66 
 
 
249 aa  74.3  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2614  glutamine amidotransferase class-I  26.07 
 
 
238 aa  74.3  0.000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.223861  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0721  glutamine amidotransferase class-I  30.57 
 
 
238 aa  74.3  0.000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.706458  normal  0.650481 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1607  glutamine amidotransferase class-I  33.57 
 
 
258 aa  72  0.000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.471476  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2745  glutamine amidotransferase  29.44 
 
 
240 aa  70.9  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.562281  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2521  glutamine amidotransferase  28.12 
 
 
246 aa  70.9  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00189035  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1523  glutamine amidotransferase  30.46 
 
 
240 aa  69.7  0.00000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0213  glutamine amidotransferase  28.84 
 
 
238 aa  68.2  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.486178 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3848  glutamine amidotransferase class-I  36.5 
 
 
213 aa  67  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.114524  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3785  glutamine amidotransferase class-I  29 
 
 
258 aa  67.4  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134927  normal  0.284097 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4250  glutamine amidotransferase class-I  32.68 
 
 
245 aa  67.4  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1424  glutamine amidotransferase  29.31 
 
 
241 aa  66.6  0.0000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2917  glutamine amidotransferase class-I domain protein  33.33 
 
 
237 aa  65.9  0.0000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2532  glutamine amidotransferase class-I  33.33 
 
 
237 aa  65.9  0.0000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2798  glutamine amidotransferase class-I  30.18 
 
 
236 aa  65.9  0.0000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33160  Glutamine amidotransferase class-I protein  32.61 
 
 
235 aa  65.1  0.0000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0923229  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3619  glutamine amidotransferase class-I  28.87 
 
 
235 aa  64.7  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2617  glutamine amidotransferase class-I  26.26 
 
 
233 aa  64.7  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5145  glutamine amidotransferase class-I  30.49 
 
 
240 aa  64.3  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.240157 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42180  hypothetical protein  27.78 
 
 
228 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2011  glutamine amidotransferase  33.33 
 
 
234 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0569772  normal  0.0333945 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4515  glutamine amidotransferase class-I  32.89 
 
 
245 aa  63.9  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.201421  normal  0.0267832 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2584  glutamine amidotransferase class-I  27.83 
 
 
241 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10270  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  31.22 
 
 
530 aa  63.9  0.000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.38684 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2155  glutamine amidotransferase  26.76 
 
 
243 aa  63.2  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1840  glutamine amidotransferase  32.74 
 
 
239 aa  62  0.000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3577  glutamine amidotransferase class I  29.48 
 
 
232 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.180567  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0800  glutamine amidotransferase class-I  30.32 
 
 
251 aa  61.6  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.172582 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2063  GMP synthase, large subunit  32.41 
 
 
532 aa  60.8  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0340406 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0004  glutamine amidotransferase  29.47 
 
 
237 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.829136  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0557  glutamine amidotransferase class-I  29.14 
 
 
236 aa  60.5  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2986  glutamine amidotransferase class-I  28.37 
 
 
239 aa  60.5  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000292655  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7211  putative glutamine amidotransferase, class-I  30.86 
 
 
276 aa  60.1  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.724633  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0983  glutamine amidotransferase  29.8 
 
 
239 aa  59.7  0.00000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1308  GMP synthase  32.41 
 
 
539 aa  59.3  0.00000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00743911  normal  0.913177 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2764  GMP synthase  34.67 
 
 
539 aa  58.9  0.00000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.727544  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_12401  hypothetical protein  27.47 
 
 
243 aa  58.9  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3252  glutamine amidotransferase  30.98 
 
 
236 aa  58.9  0.00000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.27837 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0511  glutamine amidotransferase class-I  27.47 
 
 
243 aa  58.9  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0538206  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1536  amidotransferase  30 
 
 
226 aa  58.5  0.00000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.03315  normal  0.0447378 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1245  GMP synthase  33.81 
 
 
539 aa  58.5  0.00000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1413  glutamine amidotransferase class-I  32.34 
 
 
237 aa  58.5  0.00000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.937907 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0062  glutamine amidotransferase  29.89 
 
 
236 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3290  GMP synthase  31.43 
 
 
539 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0624455  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1891  GMP synthase  31.72 
 
 
539 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.888833  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3000  glutamine amidotransferase class-I  29.67 
 
 
243 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.372191  normal  0.238787 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1522  GMP synthase  31.43 
 
 
539 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.403543  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08781  glutamine amidotransferase class-I  24.63 
 
 
243 aa  58.2  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1045  glutamine amidotransferase class-I  30.6 
 
 
236 aa  57.8  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1292  GMP synthase  31.43 
 
 
539 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1287  GMP synthase  31.72 
 
 
539 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0197854  normal  0.456639 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2021  GMP synthase  31.43 
 
 
539 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.637137  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2454  GMP synthase  31.43 
 
 
539 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.476735  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6088  GMP synthase  31.72 
 
 
539 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2022  GMP synthase  31.72 
 
 
539 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1989  GMP synthase  31.72 
 
 
539 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.314253  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>