39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_0990 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_0990  tetratricopeptide TPR_2  100 
 
 		 281 aa  564  1e-160  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0598764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1122  tetratricopeptide region  61.82 
 
 		 283 aa  348  7e-95  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.124887  normal  0.974298 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1901  TPR repeat-containing protein  59.26 
 
 		 282 aa  334  7.999999999999999e-91  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.856329  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0550  hypothetical protein  58.89 
 
 		 302 aa  334  7.999999999999999e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0298  hypothetical protein  59.25 
 
 		 281 aa  327  1.0000000000000001e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2353  tetratricopeptide region  57.56 
 
 		 283 aa  325  7e-88  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.211152 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  26.63 
 
 		 878 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  26.09 
 
 		 810 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2910  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.34 
 
 		 257 aa  52.4  0.000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0603977  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2594  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 617 aa  52  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.390942 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2363  hypothetical protein  28.26 
 
 		 344 aa  50.8  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000181348  normal  0.018049 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2822  TPR repeat-containing protein  26.62 
 
 		 257 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0612  tetratricopeptide TPR_2  31.69 
 
 		 171 aa  47.4  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3217  tetratricopeptide TPR_2  23 
 
 		 593 aa  47.4  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.7268  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3786  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.49 
 
 		 181 aa  47  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.849163  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.12 
 
 		 1022 aa  46.6  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  23.62 
 
 		 827 aa  46.2  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1273  TPR repeat-containing protein  24.27 
 
 		 879 aa  46.2  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2526  hypothetical protein  21.65 
 
 		 732 aa  46.2  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0463083 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2985  sulfotransferase  25.62 
 
 		 1077 aa  45.1  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2659  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.34 
 
 		 565 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.144865 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4357  tetratricopeptide TPR_2  22.79 
 
 		 593 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0312227  normal  0.0147446 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3954  tetratricopeptide TPR_2  27.93 
 
 		 260 aa  44.3  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0424  TPR repeat-containing protein  29.66 
 
 		 313 aa  44.3  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.446862  normal  0.0100173 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1085  TPR repeat-containing protein  24.21 
 
 		 592 aa  43.5  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1306  tetratricopeptide repeat protein  25.37 
 
 		 403 aa  43.9  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.250179  hitchhiker  0.00000292633 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4107  TPR repeat-containing protein  28.8 
 
 		 552 aa  43.5  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  19.79 
 
 		 3145 aa  43.5  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1755  Flp pilus assembly protein TadD  21.71 
 
 		 321 aa  43.1  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2697  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.46 
 
 		 173 aa  43.1  0.005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_863  predicted protein  27.59 
 
 		 708 aa  43.1  0.006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.622244  normal  0.0203568 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0901  tfp pilus assembly protein PilF  23.86 
 
 		 246 aa  42.7  0.006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  25.66 
 
 		 1421 aa  42.7  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0611  TPR repeat-containing protein  28.38 
 
 		 237 aa  42.7  0.007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2413  TPR repeat-containing protein  34.43 
 
 		 593 aa  42.7  0.007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3269  TPR repeat-containing protein  26.55 
 
 		 693 aa  42.4  0.008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.306934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3443  methyltransferase type 12  31.68 
 
 		 436 aa  42.7  0.008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0605302 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4391  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.53 
 
 		 172 aa  42.4  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0729  TPR repeat-containing protein  25.57 
 
 		 268 aa  42  0.01  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>