28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2353 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_2353  tetratricopeptide region  100 
 
 		 283 aa  580  1.0000000000000001e-165  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.211152 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1122  tetratricopeptide region  64.08 
 
 		 283 aa  373  1e-102  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.124887  normal  0.974298 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0298  hypothetical protein  61.97 
 
 		 281 aa  363  1e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0550  hypothetical protein  60.78 
 
 		 302 aa  358  6e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1901  TPR repeat-containing protein  60.42 
 
 		 282 aa  357  9.999999999999999e-98  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.856329  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0990  tetratricopeptide TPR_2  60.15 
 
 		 281 aa  328  5.0000000000000004e-89  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0598764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2022  TPR repeat-containing protein  22.37 
 
 		 351 aa  51.6  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.372668  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0689  TPR repeat-containing protein  22.94 
 
 		 632 aa  47.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000734837  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2659  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.89 
 
 		 565 aa  47.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.144865 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  28.45 
 
 		 1421 aa  46.6  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  22.65 
 
 		 810 aa  46.2  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3305  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.73 
 
 		 633 aa  45.8  0.0007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.68435  normal  0.412793 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3216  TPR repeat-containing protein  22.91 
 
 		 643 aa  45.8  0.0009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000674385  hitchhiker  0.00000466075 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3430  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.73 
 
 		 633 aa  45.8  0.0009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.345499 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3111  TPR repeat-containing protein  25.73 
 
 		 631 aa  45.4  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.651134 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2363  hypothetical protein  21.17 
 
 		 344 aa  44.7  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000181348  normal  0.018049 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0478  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.61 
 
 		 343 aa  44.7  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46242  predicted protein  25.9 
 
 		 564 aa  44.3  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  22.65 
 
 		 878 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3786  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.14 
 
 		 181 aa  43.5  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.849163  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5752  OmpA/MotB domain protein  29.03 
 
 		 677 aa  43.9  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.219859  normal  0.716064 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2419  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 792 aa  43.9  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0484292  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2415  TPR repeat-containing protein  23.56 
 
 		 686 aa  43.9  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2266  tetratricopeptide TPR_2  21.57 
 
 		 1213 aa  43.9  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  21.29 
 
 		 3145 aa  43.5  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.15 
 
 		 689 aa  43.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  20.37 
 
 		 887 aa  42.4  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0858  TPR repeat-containing protein  24.24 
 
 		 589 aa  42.4  0.008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>