20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1122 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_1122  tetratricopeptide region  100 
 
 		 283 aa  574  1.0000000000000001e-163  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.124887  normal  0.974298 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2353  tetratricopeptide region  64.47 
 
 		 283 aa  363  2e-99  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.211152 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1901  TPR repeat-containing protein  60.42 
 
 		 282 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.856329  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0550  hypothetical protein  60.07 
 
 		 302 aa  342  2.9999999999999997e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0298  hypothetical protein  60.07 
 
 		 281 aa  341  8e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0990  tetratricopeptide TPR_2  61.82 
 
 		 281 aa  340  2e-92  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0598764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2415  TPR repeat-containing protein  27.32 
 
 		 686 aa  51.6  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2022  TPR repeat-containing protein  28.04 
 
 		 351 aa  50.8  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.372668  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  22.22 
 
 		 733 aa  49.7  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2363  hypothetical protein  28.99 
 
 		 344 aa  47.8  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000181348  normal  0.018049 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.86 
 
 		 689 aa  46.2  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3786  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  39.19 
 
 		 181 aa  46.2  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.849163  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  29.37 
 
 		 1421 aa  45.1  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  23.27 
 
 		 1138 aa  44.7  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3747  TPR repeat-containing protein  27.53 
 
 		 1005 aa  44.7  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28721  hypothetical protein  22.77 
 
 		 706 aa  43.9  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3831  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.06 
 
 		 1034 aa  43.9  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0133068 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2499  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  26.04 
 
 		 935 aa  43.1  0.005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00842249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4437  glycosyl transferase family protein  28.05 
 
 		 1061 aa  42.4  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  22.09 
 
 		 827 aa  42.4  0.008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>