53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_1989 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_1989  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  100 
 
 
222 aa  443  1.0000000000000001e-124  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1789  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.22 
 
 
222 aa  77.8  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.160371  normal  0.0157208 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0839  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  32.35 
 
 
216 aa  78.2  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1478  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.87 
 
 
224 aa  71.2  0.00000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1626  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.79 
 
 
227 aa  65.9  0.0000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.695636 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2802  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  28.85 
 
 
227 aa  60.1  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.978362  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2371  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.34 
 
 
236 aa  58.5  0.00000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1973  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.57 
 
 
224 aa  57  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1973  phosphoglycolate phosphatase  29.38 
 
 
213 aa  56.6  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.662433 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1165  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.76 
 
 
220 aa  56.6  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.103662  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3026  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.09 
 
 
219 aa  54.7  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0887478  normal  0.0112565 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2431  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.59 
 
 
224 aa  53.9  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.233429  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2663  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.09 
 
 
218 aa  53.5  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3516  phosphoglycolate phosphatase  30.21 
 
 
229 aa  53.1  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0774  conserved hypothetical protein, putative HAD superfamily hydrolase  26.02 
 
 
208 aa  53.1  0.000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0815  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.71 
 
 
218 aa  50.1  0.00003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.49888 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2097  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.79 
 
 
221 aa  49.7  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.284323  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0492  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1 family protein  22.49 
 
 
206 aa  46.6  0.0003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0923435  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0571  phosphoglycolate phosphatase  25.87 
 
 
242 aa  45.8  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0937  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.79 
 
 
219 aa  45.4  0.0006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.171636 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2787  phosphoglycolate phosphatase  29.05 
 
 
230 aa  45.1  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.485008  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3361  phosphoglycolate phosphatase  26.73 
 
 
227 aa  44.7  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1514  phosphoglycolate phosphatase  29.84 
 
 
243 aa  44.7  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00414525  decreased coverage  0.0000736152 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0363  phosphoglycolate phosphatase  27.05 
 
 
261 aa  44.7  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0352  phosphoglycolate phosphatase  27.05 
 
 
241 aa  44.7  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0570615  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2363  phosphoglycolate phosphatase  31.68 
 
 
227 aa  45.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.496506  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2324  phosphoglycolate phosphatase  29.5 
 
 
223 aa  44.7  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.289687  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3898  phosphoglycolate phosphatase  27.96 
 
 
221 aa  43.5  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.67393 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0915  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1 family protein  29.11 
 
 
205 aa  44.3  0.002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00720904  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0643  phosphoglycolate phosphatase  27.1 
 
 
242 aa  43.9  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1247  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1 family protein  21.53 
 
 
206 aa  44.3  0.002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0333154  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0535  phosphoglycolate phosphatase  25.55 
 
 
254 aa  43.5  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0507  phosphoglycolate phosphatase  25.55 
 
 
254 aa  43.5  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.263743  normal  0.890695 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3574  phosphoglycolate phosphatase  27.1 
 
 
242 aa  43.9  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.952116  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0534  phosphoglycolate phosphatase  27.1 
 
 
242 aa  43.9  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0250125  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1909  phosphoglycolate phosphatase  27.1 
 
 
242 aa  43.9  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3582  phosphoglycolate phosphatase  27.1 
 
 
245 aa  43.9  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3555  phosphoglycolate phosphatase  27.1 
 
 
245 aa  43.9  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.221388  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0939  phosphoglycolate phosphatase  27.1 
 
 
242 aa  43.9  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2570  phosphoglycolate phosphatase  25.55 
 
 
254 aa  43.5  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3611  phosphoglycolate phosphatase  28.47 
 
 
262 aa  43.5  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1368  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1 family protein  21.53 
 
 
206 aa  43.5  0.003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.668908  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2083  phosphoglycolate phosphatase  29.35 
 
 
226 aa  43.5  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.609164  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1483  phosphoglycolate phosphatase  30.37 
 
 
231 aa  43.5  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.539513 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2878  phosphoglycolate phosphatase  30.54 
 
 
226 aa  42.7  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0893  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1 family protein  26.42 
 
 
209 aa  42.7  0.004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.041002  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0581  putative phosphoglycolate phosphatase protein  28.1 
 
 
233 aa  42.7  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0414  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.88 
 
 
217 aa  42.4  0.006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1998  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25 
 
 
222 aa  42.4  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2908  phosphoglycolate phosphatase  27.78 
 
 
242 aa  42.4  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0464  phosphoglycolate phosphatase  25.55 
 
 
251 aa  42  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.992467  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3998  phosphoglycolate phosphatase  29.38 
 
 
226 aa  42  0.007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.739792  normal  0.543367 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0440  phosphoglycolate phosphatase  27.69 
 
 
235 aa  41.6  0.01  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.433387 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>