50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_2411 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_2411  protein of unknown function DUF482  100 
 
 
372 aa  760    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2728  protein of unknown function DUF482  53.15 
 
 
360 aa  397  1e-109  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.482238  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2501  hypothetical protein  39.94 
 
 
353 aa  256  3e-67  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2169  hypothetical protein  25.64 
 
 
360 aa  78.2  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.764152  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0970  hypothetical protein  25.74 
 
 
346 aa  68.2  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.534214  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1516  hypothetical protein  22.4 
 
 
343 aa  62.8  0.00000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.069659  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2216  FemAB-related protein, PEP-CTERM system- associated  26.27 
 
 
342 aa  61.6  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2969  hypothetical protein  24.6 
 
 
346 aa  59.7  0.00000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.852464  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0832  hypothetical protein  21.54 
 
 
349 aa  59.7  0.00000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00050056  normal  0.312706 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5112  hypothetical protein  25.97 
 
 
336 aa  58.5  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0964659  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2853  hypothetical protein  21.18 
 
 
348 aa  58.5  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.957178  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3017  hypothetical protein  23.78 
 
 
384 aa  58.2  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1980  hypothetical protein  22.67 
 
 
352 aa  57.8  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01211  hypothetical protein  22.73 
 
 
384 aa  57.4  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2344  hypothetical protein  23.61 
 
 
344 aa  57  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3442  hypothetical protein  25 
 
 
338 aa  55.5  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.768278  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3275  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  23.99 
 
 
353 aa  55.5  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.299337  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0108  hypothetical protein  22.42 
 
 
384 aa  55.1  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.139955  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01201  hypothetical protein  22.42 
 
 
384 aa  54.7  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0683  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  23.55 
 
 
348 aa  54.3  0.000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2404  hypothetical protein  22.11 
 
 
344 aa  52.4  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4037  hypothetical protein  38.55 
 
 
349 aa  50.8  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.493535  normal  0.627077 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1775  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  22.98 
 
 
344 aa  50.4  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0719  hypothetical protein  23 
 
 
333 aa  49.7  0.00009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00617075  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2342  hypothetical protein  22.85 
 
 
352 aa  49.7  0.00009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5671  hypothetical protein  23.73 
 
 
293 aa  49.3  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.597001  normal  0.0100919 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2093  Methicillin resistance protein  23.77 
 
 
346 aa  48.9  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.801885  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0138  hypothetical protein  19.33 
 
 
471 aa  48.9  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0233537  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1528  hypothetical protein  27.06 
 
 
354 aa  48.1  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2865  hypothetical protein  20.89 
 
 
370 aa  48.5  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1138  hypothetical protein  31.53 
 
 
324 aa  47  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3065  hypothetical protein  22.39 
 
 
348 aa  45.8  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0204721  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2523  hypothetical protein  20.72 
 
 
361 aa  45.8  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.193947  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3113  hypothetical protein  32.2 
 
 
345 aa  45.8  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1195  hypothetical protein  20.54 
 
 
355 aa  45.4  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2873  hypothetical protein  23.83 
 
 
380 aa  45.8  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4593  hypothetical protein  23.67 
 
 
405 aa  45.8  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.218764 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3045  methicillin resistance protein  24.84 
 
 
335 aa  45.8  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2469  hypothetical protein  20.82 
 
 
344 aa  45.4  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2472  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  22.4 
 
 
344 aa  45.1  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4843  Methicillin resistance protein  22.81 
 
 
360 aa  45.1  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000953777  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2734  hypothetical protein  23.6 
 
 
385 aa  45.4  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2408  methicillin resistance protein  22.19 
 
 
363 aa  45.1  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0166  protein of unknown function DUF482  25 
 
 
405 aa  44.7  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0717665  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2500  hypothetical protein  35.8 
 
 
350 aa  43.9  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3956  hypothetical protein  23.08 
 
 
369 aa  43.9  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000641904 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1922  hypothetical protein  23.08 
 
 
355 aa  43.5  0.005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.26263  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2511  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  20.8 
 
 
356 aa  43.9  0.005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.723604 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0487  hypothetical protein  20.64 
 
 
362 aa  43.5  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0288  hypothetical protein  20.25 
 
 
354 aa  43.1  0.009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>