More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_1357 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_1357  Nucleotidyl transferase  100 
 
 
324 aa  655    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2798  Nucleotidyl transferase  89.41 
 
 
322 aa  593  1e-168  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.272765  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2886  Nucleotidyl transferase  74.84 
 
 
322 aa  501  1e-141  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.619319  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3830  Nucleotidyl transferase  70.5 
 
 
327 aa  478  1e-134  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.108201  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1775  Nucleotidyl transferase  69.16 
 
 
324 aa  466  9.999999999999999e-131  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0199542 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2710  Nucleotidyl transferase  68.73 
 
 
322 aa  467  9.999999999999999e-131  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.37707  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1048  Nucleotidyl transferase  63.98 
 
 
335 aa  417  9.999999999999999e-116  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1161  Nucleotidyl transferase  39.24 
 
 
238 aa  186  6e-46  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0561  nucleotidyl transferase  27.02 
 
 
364 aa  101  1e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.00537127 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1293  Nucleotidyl transferase  25.14 
 
 
361 aa  99.4  8e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.327446  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1973  mannose-1-phosphate guanyltransferase  27.6 
 
 
389 aa  95.1  1e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.878472 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1800  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  26.02 
 
 
357 aa  94  3e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0340  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  26.44 
 
 
355 aa  93.6  4e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.830656  normal  0.0393179 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4613  Nucleotidyl transferase  31.23 
 
 
366 aa  92.8  8e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1450  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  24.64 
 
 
376 aa  92.4  9e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1852  nucleotidyl transferase  29.41 
 
 
370 aa  92  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0258  nucleotidyl transferase  26.3 
 
 
425 aa  92  1e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.402702  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4734  nucleotidyl transferase  28.61 
 
 
359 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.261092  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3282  nucleotidyl transferase  29.41 
 
 
370 aa  91.3  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.404178 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13293  D-alpha-D-mannose-1-phosphate guanylyltransferase manB  29.86 
 
 
359 aa  90.5  3e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.580301 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1584  nucleotidyl transferase  30.21 
 
 
238 aa  90.9  3e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1890  nucleotidyl transferase  25 
 
 
357 aa  90.9  3e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.661089 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1223  Nucleotidyl transferase  28.65 
 
 
392 aa  89.7  6e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1787  nucleotidyl transferase  27.88 
 
 
348 aa  89  1e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2020  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  26.8 
 
 
397 aa  88.6  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01681  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  30.47 
 
 
392 aa  89  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3113  nucleotidyl transferase  27.74 
 
 
349 aa  87.8  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.409116  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0065  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  25 
 
 
355 aa  87.4  3e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3557  nucleotidyl transferase  29.69 
 
 
238 aa  87.4  3e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.567903  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0737  nucleotidyl transferase  28.74 
 
 
357 aa  87  3e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.879816 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0065  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  25 
 
 
355 aa  87.4  3e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1620  nucleotidyl transferase  28.57 
 
 
360 aa  86.7  5e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.131189  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1630  Nucleotidyl transferase  29.01 
 
 
397 aa  86.3  6e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1511  Nucleotidyl transferase  28.63 
 
 
388 aa  85.9  8e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00125436 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3048  Nucleotidyl transferase  28.08 
 
 
393 aa  85.9  8e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.916197  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0940  Nucleotidyl transferase  25.56 
 
 
370 aa  85.9  9e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1518  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  29.3 
 
 
392 aa  85.9  9e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4077  nucleotidyl transferase  30.29 
 
 
238 aa  85.9  9e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.957763  normal  0.557199 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02241  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  29.3 
 
 
392 aa  85.9  9e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2958  mannose-1-phosphate guanyltransferase  25.64 
 
 
842 aa  85.5  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2808  nucleotidyl transferase  25.78 
 
 
346 aa  85.9  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1971  nucleotidyl transferase  27.73 
 
 
358 aa  85.5  0.000000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1083  Nucleotidyl transferase  26.83 
 
 
402 aa  84.3  0.000000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.39401 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1202  Nucleotidyl transferase  25.63 
 
 
393 aa  84  0.000000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5876  nucleotidyl transferase  27.06 
 
 
357 aa  84.3  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.624445  normal  0.732322 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0233  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  27.97 
 
 
240 aa  84  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00581179  normal  0.550087 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1214  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  22.91 
 
 
355 aa  83.6  0.000000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.383113  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4128  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  25.85 
 
 
355 aa  83.6  0.000000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0631243  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2033  Nucleotidyl transferase  23.91 
 
 
328 aa  82.8  0.000000000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0738  Nucleotidyl transferase  30.98 
 
 
346 aa  82.8  0.000000000000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0293389  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1847  nucleotidyl transferase  29.02 
 
 
389 aa  82.8  0.000000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.315582  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1267  putative glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  27.69 
 
 
245 aa  82.4  0.000000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2229  nucleotidyl transferase  23.62 
 
 
399 aa  82.4  0.000000000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4165  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  25.14 
 
 
355 aa  82  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.387622  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1469  Nucleotidyl transferase  30.49 
 
 
833 aa  82  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1624  nucleotidyl transferase  30.54 
 
 
367 aa  82  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.344481  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0642  nucleotidyl transferase  23.23 
 
 
411 aa  82  0.00000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.163683  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1729  nucleotidyl transferase  28.53 
 
 
359 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.442987  normal  0.868818 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4074  putative glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  27.69 
 
 
245 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.859637  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0740  nucleotidyl transferase  27.51 
 
 
832 aa  81.6  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.2195  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0747  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  25.45 
 
 
359 aa  81.3  0.00000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1143  nucleotidyl transferase  27.6 
 
 
388 aa  81.3  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00149781 
 
 
-
 
NC_002936  DET1208  nucleotidyltransferase family protein  23.67 
 
 
361 aa  80.5  0.00000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00478172  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1335  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase, putative  26.81 
 
 
245 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.161343  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0204  nucleotidyl transferase  26.84 
 
 
311 aa  80.5  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1122  nucleotidyl transferase  26.86 
 
 
245 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.236297  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3178  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  27.1 
 
 
836 aa  80.5  0.00000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.335265 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3932  Nucleotidyl transferase  27.56 
 
 
381 aa  80.1  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.541197 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1968  nucleotidyltransferase family protein  27.62 
 
 
476 aa  80.1  0.00000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.142573  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1018  nucleotidyl transferase  23.89 
 
 
361 aa  80.1  0.00000000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000995532  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4397  nucleotidyl transferase  28.61 
 
 
832 aa  80.1  0.00000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3774  Nucleotidyl transferase  25.71 
 
 
830 aa  79.7  0.00000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_991  nucleotidyltransferase  23.89 
 
 
361 aa  79.7  0.00000000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00100816  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0782  Nucleotidyl transferase  24.1 
 
 
417 aa  79.7  0.00000000000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2874  Nucleotidyl transferase  27.13 
 
 
402 aa  79.7  0.00000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1135  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  26.81 
 
 
245 aa  79.7  0.00000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1228  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  26.81 
 
 
245 aa  79.7  0.00000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1001  Nucleotidyl transferase  26.49 
 
 
828 aa  79.3  0.00000000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1115  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  26.81 
 
 
245 aa  79.3  0.00000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1419  nucleotidyl transferase  25.67 
 
 
414 aa  79.3  0.00000000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0198372  hitchhiker  0.00414302 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0289  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  27.95 
 
 
392 aa  79.3  0.00000000000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1692  nucleotidyl transferase  29.92 
 
 
834 aa  79.3  0.00000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.230386  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0890  nucleotidyl transferase  25.93 
 
 
359 aa  78.6  0.0000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0854  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  26.2 
 
 
379 aa  79  0.0000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0620001  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1109  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  26.38 
 
 
245 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0868  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  27.67 
 
 
377 aa  79  0.0000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00134562  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1296  putative glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  26.81 
 
 
245 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00103191 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2404  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  27.95 
 
 
392 aa  78.6  0.0000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.271478  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0407  Nucleotidyl transferase  25.22 
 
 
835 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1373  putative glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  26.38 
 
 
245 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3188  nucleotidyl transferase  25.63 
 
 
843 aa  78.6  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00738142 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0724  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  24.17 
 
 
380 aa  78.6  0.0000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0413  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  27.58 
 
 
355 aa  79  0.0000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0183855  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1394  mannose-1-phosphate guanylyltransferase / phosphomannomutase  25.57 
 
 
832 aa  78.2  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2341  nucleotidyl transferase  24.79 
 
 
396 aa  78.2  0.0000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00221584  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1080  Nucleotidyl transferase  28.41 
 
 
391 aa  78.2  0.0000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.380619 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0399  nucleotidyl transferase  23.81 
 
 
414 aa  78.2  0.0000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0329  nucleotidyl transferase  24.58 
 
 
411 aa  77.4  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.175272  hitchhiker  0.000673657 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0855  nucleotidyl transferase  26.49 
 
 
835 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0909  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  26.11 
 
 
418 aa  77.4  0.0000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.751771  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>