138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_04990 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_04990  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  100 
 
 
466 aa  966    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0663  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type II  48.07 
 
 
464 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2139  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  48.14 
 
 
456 aa  433  1e-120  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0725  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  46.71 
 
 
455 aa  430  1e-119  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3221  deoxyribodipyrimidine photolyase  46.32 
 
 
448 aa  426  1e-118  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.147791  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3129  DNA photolyase, FAD-binding  47.08 
 
 
468 aa  421  1e-116  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3500  DNA photolyase FAD-binding protein  45.41 
 
 
453 aa  404  1e-111  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3762  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  42.42 
 
 
462 aa  374  1e-102  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.12101  normal  0.44256 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1961  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type II  43.14 
 
 
468 aa  369  1e-101  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.351083  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2754  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  42.52 
 
 
467 aa  365  1e-100  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.853539 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0155  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  44.44 
 
 
476 aa  365  1e-100  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_45715  predicted protein  39.57 
 
 
467 aa  358  8e-98  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.380145  normal  0.059566 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6363  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  42.55 
 
 
465 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.111638 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0767  deoxyribodipyrimidine photolyase  43.01 
 
 
451 aa  355  7.999999999999999e-97  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.268516 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2531  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  42.18 
 
 
467 aa  355  1e-96  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.695435  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0527  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type II  42.63 
 
 
462 aa  350  2e-95  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2459  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  42.55 
 
 
467 aa  347  2e-94  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.343521 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0876  DNA photolyase, class 2  39.91 
 
 
459 aa  338  9.999999999999999e-92  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0179  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type II  39.19 
 
 
487 aa  336  5.999999999999999e-91  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2012  deoxyribodipyrimidine photolyase  39.51 
 
 
450 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1775  deoxyribodipyrimidine photolyase  39.61 
 
 
447 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00154316  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1321  deoxyribodipyrimidine photolyase  39.69 
 
 
469 aa  327  3e-88  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.533615  normal  0.0703748 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2829  deoxyribodipyrimidine photolyase, putative  37.12 
 
 
461 aa  313  3.9999999999999997e-84  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.242896  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0522  DNA photolyase, class 2  36.55 
 
 
495 aa  310  2.9999999999999997e-83  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.372488 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2851  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  36.44 
 
 
473 aa  304  3.0000000000000004e-81  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4497  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type II  36.43 
 
 
446 aa  299  7e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.112755  normal  0.578419 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1936  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  38.08 
 
 
494 aa  298  1e-79  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30886  predicted protein  38.6 
 
 
506 aa  298  2e-79  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.25268 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0415  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  36.48 
 
 
452 aa  284  2.0000000000000002e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2693  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  35.01 
 
 
449 aa  276  6e-73  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41733  predicted protein  37.17 
 
 
477 aa  276  6e-73  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.908244  normal  0.188048 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_36787  predicted protein  37.17 
 
 
477 aa  276  6e-73  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00684152  hitchhiker  0.00249943 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_51952  class II CPD photolyase  36.27 
 
 
511 aa  273  3e-72  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3125  DNA photolyase FAD-binding  33.26 
 
 
486 aa  271  2.9999999999999997e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.848481  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3226  DNA photolyase FAD-binding  32.85 
 
 
486 aa  268  2e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.575372  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2716  deoxyribodipyrimidine photolyase  33.61 
 
 
490 aa  262  8.999999999999999e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1430  DNA photolyase FAD-binding protein  33.54 
 
 
493 aa  261  2e-68  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3028  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type II  32.02 
 
 
490 aa  255  1.0000000000000001e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3007  DNA photolyase FAD-binding  33.12 
 
 
493 aa  250  3e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.742505 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4973  DNA photolyase FAD-binding protein  33.2 
 
 
496 aa  243  3.9999999999999997e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.179925 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0288  DNA photolyase FAD-binding protein  32.15 
 
 
843 aa  238  2e-61  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4932  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  22.61 
 
 
481 aa  68.6  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1394  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  27.11 
 
 
483 aa  66.6  0.0000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1907  DNA photolyase, class 2  39.22 
 
 
104 aa  65.1  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1441  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  20.5 
 
 
474 aa  61.2  0.00000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.511514  normal  0.115222 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2919  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  25.62 
 
 
478 aa  60.8  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.219923 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49165  predicted protein  26.11 
 
 
495 aa  60.8  0.00000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.69324  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0080  deoxyribodipyrimidine photolyase, cyclobutane pyrimidine dimer-specific  27.78 
 
 
469 aa  60.5  0.00000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000198558  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2469  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  28.85 
 
 
475 aa  60.1  0.00000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000205711 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3211  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  22.51 
 
 
499 aa  55.8  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.941968 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2903  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  20.6 
 
 
478 aa  55.5  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.599485  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1309  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  21.63 
 
 
499 aa  55.1  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0820  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  22.7 
 
 
469 aa  55.8  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.627339 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1364  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  26.94 
 
 
473 aa  55.8  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0870  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  21.62 
 
 
479 aa  55.1  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.040956 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0377  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  28.39 
 
 
486 aa  55.1  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.215425 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001252  deoxyribodipyrimidine photolyase  23.47 
 
 
471 aa  55.1  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.553687  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4676  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  20.8 
 
 
500 aa  53.9  0.000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.499221 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1215  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  27 
 
 
477 aa  54.3  0.000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.300983  hitchhiker  0.000693547 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2935  deoxyribodipyrimidine photolyase  23.01 
 
 
476 aa  53.9  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3068  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  21.37 
 
 
500 aa  53.9  0.000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3187  deoxyribodipyrimidine photolyase family protein  23.01 
 
 
476 aa  53.5  0.000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3112  deoxyribodipyrimidine photolyase  22.55 
 
 
492 aa  53.9  0.000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.671492  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0866  deoxyribodipyrimidine photo-lyase (photoreactivating enzyme)  26.82 
 
 
479 aa  53.9  0.000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0339  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  23.43 
 
 
484 aa  53.5  0.000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2956  deoxyribodipyrimidine photolyase family protein  23.01 
 
 
476 aa  53.1  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.13805  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3180  deoxyribodipyrimidine photolyase family protein  23.01 
 
 
469 aa  52.8  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.478094  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0591  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  23.43 
 
 
481 aa  52.8  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.2693 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2256  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  20.69 
 
 
479 aa  52.8  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.786952  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02016  DNA photolyase  25.63 
 
 
474 aa  53.1  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0782959  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2143  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  19.94 
 
 
471 aa  52  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3356  deoxyribodipyrimidine photolyase  21.07 
 
 
483 aa  52.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.617341  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41430  Deoxyribodipyrimidine photolyase  26.19 
 
 
468 aa  52.4  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2747  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  24.5 
 
 
474 aa  52  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00995843  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3054  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  20.91 
 
 
505 aa  52.4  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.746759  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0575  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  20.66 
 
 
468 aa  52  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0739  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  28.14 
 
 
480 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1613  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  23.42 
 
 
425 aa  51.6  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5899  deoxyribodipyrimidine photolyase  26.67 
 
 
519 aa  50.4  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0769953  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2178  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  26.67 
 
 
519 aa  50.4  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.240707  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1224  deoxyribodipyrimidine photolyase  22.13 
 
 
497 aa  50.8  0.00006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04795  photolyase  22.22 
 
 
472 aa  50.1  0.00008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.722935  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5309  deoxyribodipyrimidine photolyase  26.42 
 
 
477 aa  50.1  0.00009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0998  deoxyribodipyrimidine photolyase  28 
 
 
457 aa  49.7  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.50142  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0271  hypothetical protein  27.67 
 
 
471 aa  48.9  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0266  hypothetical protein  27.67 
 
 
471 aa  48.9  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1759  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  22.35 
 
 
454 aa  48.9  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0257219  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1491  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  25.95 
 
 
499 aa  48.9  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.675954 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2924  deoxyribodipyrimidine photolyase  26.62 
 
 
476 aa  48.9  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4411  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  21.56 
 
 
487 aa  49.3  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00088119  normal  0.0752784 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1252  deoxyribodipyrimidine photolyase  26.45 
 
 
476 aa  48.5  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0460072  normal  0.903658 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0767  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  26.22 
 
 
475 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4450  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  25.6 
 
 
480 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1262  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  25.16 
 
 
463 aa  48.1  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.103305  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1166  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  20 
 
 
493 aa  47.8  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0815  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  24.46 
 
 
470 aa  47.8  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.752894  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1615  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  24 
 
 
471 aa  47.8  0.0004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1268a  deoxyribodipyrimidine photolyase  18.31 
 
 
452 aa  47.8  0.0004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.432586  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2125  deoxyribodipyrimidine photolyase  22.62 
 
 
479 aa  47.4  0.0005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0817  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  24.48 
 
 
471 aa  47.4  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>