More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3986 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_3986  ribosomal protein L15  100 
 
 		 176 aa  349  8.999999999999999e-96  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0120912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0720  ribosomal protein L15  55.48 
 
 		 147 aa  152  2e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0885  50S ribosomal protein L15  54.11 
 
 		 147 aa  152  2e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.487854  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0130  50S ribosomal protein L15  54.11 
 
 		 146 aa  146  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.86911  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0305  50S ribosomal protein L15  54.11 
 
 		 146 aa  144  5e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00213706  normal  0.150657 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0126  50S ribosomal protein L15  53.42 
 
 		 146 aa  142  2e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1365  ribosomal protein L15  56.25 
 
 		 149 aa  141  4e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0025126  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0272  50S ribosomal protein L15  49.01 
 
 		 152 aa  141  5e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.292241  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0645  50S ribosomal protein L15  52.03 
 
 		 148 aa  140  9.999999999999999e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000111424  hitchhiker  0.000000339891 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0699  50S ribosomal protein L15  53.47 
 
 		 147 aa  140  9.999999999999999e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.82238  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1505  ribosomal protein L15  55.17 
 
 		 149 aa  138  3.9999999999999997e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.628014  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0124  50S ribosomal protein L15  52.05 
 
 		 146 aa  137  7e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000767925  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1085  50S ribosomal protein L15  50.69 
 
 		 146 aa  137  7e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.165048  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0234  50S ribosomal protein L15  52.38 
 
 		 146 aa  137  7e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000856605  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2888  ribosomal protein L15  51.61 
 
 		 163 aa  137  7.999999999999999e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.467905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2136  50S ribosomal protein L15P  52.29 
 
 		 152 aa  137  8.999999999999999e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0474039  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0123  50S ribosomal protein L15  52.74 
 
 		 146 aa  136  1e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00031572  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0129  50S ribosomal protein L15  51.37 
 
 		 146 aa  135  2e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.100575  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0129  50S ribosomal protein L15  51.37 
 
 		 146 aa  135  2e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000173867  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0125  50S ribosomal protein L15  51.37 
 
 		 146 aa  135  2e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000308575  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1375  50S ribosomal protein L15  49.32 
 
 		 147 aa  135  2e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0238101  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0123  50S ribosomal protein L15  51.37 
 
 		 146 aa  135  2e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00954178  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0150  50S ribosomal protein L15  52.05 
 
 		 146 aa  136  2e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0036731  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0129  50S ribosomal protein L15  51.37 
 
 		 146 aa  135  2e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0450407  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1311  50S ribosomal protein L15  49.32 
 
 		 147 aa  135  2e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000196543  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5176  50S ribosomal protein L15  51.37 
 
 		 146 aa  136  2e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000327341  unclonable  1.24723e-25 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0141  50S ribosomal protein L15  51.37 
 
 		 146 aa  135  2e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.02363e-62 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0727  50S ribosomal protein L15  51.37 
 
 		 147 aa  136  2e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0174765  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0160  50S ribosomal protein L15  51.37 
 
 		 146 aa  135  2e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000150646  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2046  50S ribosomal protein L15  48 
 
 		 148 aa  135  4e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00109939  hitchhiker  0.00499701 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2838  50S ribosomal protein L15  52.7 
 
 		 148 aa  134  5e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.190663  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4933  ribosomal protein L15  50 
 
 		 150 aa  134  5e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0104537  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1165  ribosomal protein L15  52.38 
 
 		 148 aa  134  5e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0536923  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2755  50S ribosomal protein L15  51.39 
 
 		 148 aa  134  8e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.203669  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2922  50S ribosomal protein L15  51.37 
 
 		 146 aa  133  9.999999999999999e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000292378  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0213  LSU ribosomal protein L15P  49.32 
 
 		 146 aa  133  9.999999999999999e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261833  normal  0.302282 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2258  50S ribosomal protein L15  50 
 
 		 146 aa  133  9.999999999999999e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0168117  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2299  50S ribosomal protein L15  50 
 
 		 146 aa  133  9.999999999999999e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0779  50S ribosomal protein L15  50.67 
 
 		 161 aa  132  1.9999999999999998e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.616455  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3309  50S ribosomal protein L15  50.69 
 
 		 146 aa  132  3e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000932499 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0952  50S ribosomal protein L15  50.69 
 
 		 146 aa  132  3e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0376093  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1633  50S ribosomal protein L15  48.68 
 
 		 161 aa  132  3e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0185879  normal  0.0637021 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0077  50S ribosomal protein L15  50.68 
 
 		 146 aa  131  3.9999999999999996e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0309  50S ribosomal protein L15  52.05 
 
 		 146 aa  131  5e-30  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  2.36933e-28 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1888  50S ribosomal protein L15  51.37 
 
 		 146 aa  130  7.999999999999999e-30  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0441  50S ribosomal protein L15  48.28 
 
 		 147 aa  130  7.999999999999999e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1373  50S ribosomal protein L15  47.68 
 
 		 160 aa  130  9e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.381602  normal  0.131365 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16980  LSU ribosomal protein L15P  51.7 
 
 		 150 aa  130  1.0000000000000001e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.000603735  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0707  50S ribosomal protein L15  52.74 
 
 		 152 aa  129  2.0000000000000002e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.226729 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2306  ribosomal protein L15  53.47 
 
 		 144 aa  129  2.0000000000000002e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000818267  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1119  ribosomal protein L15  46.26 
 
 		 148 aa  129  2.0000000000000002e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.658156  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0493  50S ribosomal protein L15  51.35 
 
 		 153 aa  128  3e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.600314  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2199  50S ribosomal protein L15  48.34 
 
 		 167 aa  128  3e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0650553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1927  50S ribosomal protein L15  48.15 
 
 		 162 aa  128  3e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0786  50S ribosomal protein L15  51.49 
 
 		 150 aa  128  4.0000000000000003e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000129799  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0470  50S ribosomal protein L15  50 
 
 		 153 aa  128  5.0000000000000004e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000419135  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1245  50S ribosomal protein L15  51.82 
 
 		 144 aa  128  5.0000000000000004e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0277502  hitchhiker  0.00267047 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1008  50S ribosomal protein L15  51.39 
 
 		 144 aa  128  5.0000000000000004e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00101008  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0334  50S ribosomal protein L15  48.15 
 
 		 162 aa  127  8.000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.379704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0098  50S ribosomal protein L15  51.35 
 
 		 149 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0741055 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0611  50S ribosomal protein L15  52.05 
 
 		 157 aa  127  1.0000000000000001e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0777  50S ribosomal protein L15  51.02 
 
 		 147 aa  126  1.0000000000000001e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000140275  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0679  50S ribosomal protein L15  48.95 
 
 		 153 aa  126  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0972  50S ribosomal protein L15  47.95 
 
 		 147 aa  126  2.0000000000000002e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1746  50S ribosomal protein L15  48.61 
 
 		 148 aa  126  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.718432  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0244  ribosomal protein L15  50 
 
 		 146 aa  125  3e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0776465  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0298  50S ribosomal protein L15P  51.05 
 
 		 144 aa  125  3e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000000286334  hitchhiker  0.00000213592 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3005  50S ribosomal protein L15  49.65 
 
 		 170 aa  125  3e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.336107  hitchhiker  0.00861224 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2305  ribosomal protein L15  51.39 
 
 		 143 aa  125  3e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.356329  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2314  ribosomal protein L15  48.63 
 
 		 146 aa  125  3e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0114491  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1574  ribosomal protein L15  55.48 
 
 		 172 aa  125  3e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0317141  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_435  ribosomal protein L15  50 
 
 		 153 aa  125  4.0000000000000003e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0090931  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2695  50S ribosomal protein L15  50.34 
 
 		 146 aa  125  4.0000000000000003e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2380  50S ribosomal protein L15  50.34 
 
 		 146 aa  125  4.0000000000000003e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4779  50S ribosomal protein L15  48.03 
 
 		 160 aa  124  5e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000514125 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1952  50S ribosomal protein L15  50.68 
 
 		 165 aa  124  6e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2037  50S ribosomal protein L15  50.68 
 
 		 165 aa  124  6e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23610  LSU ribosomal protein L15P  51.41 
 
 		 152 aa  124  7e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.947498  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1927  50S ribosomal protein L15  50.34 
 
 		 165 aa  124  7e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0284  ribosomal protein L15  43.84 
 
 		 152 aa  124  7e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000266342  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2515  50S ribosomal protein L15  52.74 
 
 		 160 aa  124  7e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5051  50S ribosomal protein L15  48.34 
 
 		 161 aa  123  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0786  ribosomal protein L15  50.35 
 
 		 143 aa  124  1e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00496718  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2441  50S ribosomal protein L15P  48.28 
 
 		 146 aa  123  1e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0561  50S ribosomal protein L15  47.02 
 
 		 164 aa  123  1e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0347  ribosomal protein L15  45.21 
 
 		 143 aa  123  1e-27  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0265978  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0214  50S ribosomal protein L15  46.94 
 
 		 144 aa  123  1e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000818631  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0516  50S ribosomal protein L15  48.25 
 
 		 145 aa  122  2e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.061752  unclonable  0.0000000000147617 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0346  50S ribosomal protein L15  48.25 
 
 		 145 aa  122  2e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3429  50S ribosomal protein L15  43.45 
 
 		 162 aa  122  3e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.278917  normal  0.334623 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001723  LSU ribosomal protein L15p (L27Ae)  47.92 
 
 		 144 aa  121  4e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000210638  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0931  ribosomal protein L15  48.65 
 
 		 152 aa  122  4e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00144684  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2145  50S ribosomal protein L15  48.63 
 
 		 169 aa  122  4e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4299  50S ribosomal protein L15  46.85 
 
 		 144 aa  121  6e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000187384  unclonable  0.0000000000528735 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1734  50S ribosomal protein L15  50.68 
 
 		 161 aa  121  6e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.425604  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0380  50S ribosomal protein L15  50.68 
 
 		 161 aa  121  6e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0177  50S ribosomal protein L15  47.55 
 
 		 144 aa  121  6e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000150023  hitchhiker  0.000371203 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0304  50S ribosomal protein L15  49.33 
 
 		 157 aa  120  7e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.548938 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6595  ribosomal protein L15  50 
 
 		 147 aa  120  7e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01350  ribosomal protein L15  51.02 
 
 		 147 aa  120  7e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.053024  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>