More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_0665 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_1670  tryptophanyl-tRNA synthetase  78.76 
 
 		 537 aa  807    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1694  Tryptophan--tRNA ligase  71.91 
 
 		 570 aa  766    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0665  tryptophanyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 540 aa  1093    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.383548  normal  0.528912 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3620  tryptophanyl-tRNA synthetase  73.35 
 
 		 542 aa  776    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1863  tryptophanyl-tRNA synthetase  73.18 
 
 		 534 aa  746    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.397905  normal  0.0397289 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1426  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.24 
 
 		 432 aa  429  1e-119  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1374  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.69 
 
 		 473 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0368  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.51 
 
 		 432 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1369  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.16 
 
 		 418 aa  326  8.000000000000001e-88  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.916392  hitchhiker  0.0000028509 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1732  tryptophan--tRNA ligase  35.36 
 
 		 422 aa  291  2e-77  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0656  tryptophanyl-tRNA synthetase  35.5 
 
 		 418 aa  283  8.000000000000001e-75  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.52588  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0571  Tryptophan--tRNA ligase  36.06 
 
 		 417 aa  280  3e-74  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0806588  normal  0.210937 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0642  tryptophan--tRNA ligase  47.08 
 
 		 418 aa  249  1e-64  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1485  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.7 
 
 		 361 aa  233  7.000000000000001e-60  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0904  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.78 
 
 		 358 aa  226  1e-57  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1817  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.15 
 
 		 358 aa  217  5e-55  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1425  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.2 
 
 		 435 aa  216  9e-55  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.790608  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1078  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.7 
 
 		 358 aa  216  9.999999999999999e-55  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0839  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.15 
 
 		 357 aa  213  5.999999999999999e-54  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.138022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1490  tryptophanyl-tRNA synthetase  32.05 
 
 		 370 aa  119  9.999999999999999e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.624592 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0587  tryptophanyl-tRNA synthetase  33.19 
 
 		 386 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2178  tryptophanyl-tRNA synthetase  30.4 
 
 		 381 aa  112  2.0000000000000002e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.774939  hitchhiker  0.000339901 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2089  tryptophanyl-tRNA synthetase  32.75 
 
 		 407 aa  111  3e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1431  tryptophanyl-tRNA synthetase  28.46 
 
 		 386 aa  110  5e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.494991  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1666  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.1 
 
 		 377 aa  108  2e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1822  tryptophanyl-tRNA synthetase  40 
 
 		 374 aa  107  5e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0454  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.61 
 
 		 379 aa  107  5e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3651  tryptophanyl-tRNA synthetase  32.3 
 
 		 412 aa  107  8e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1942  tryptophanyl-tRNA synthetase  28.98 
 
 		 383 aa  105  2e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1612  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.18 
 
 		 374 aa  103  8e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10475  tryptophanyl-tRNA synthetase (AFU_orthologue; AFUA_2G01640)  27.1 
 
 		 424 aa  88.6  2e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32113  predicted protein  28.15 
 
 		 484 aa  87.8  4e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0250041 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53719  Cytoplasmic tryptophanyl-tRNA synthetase  24.81 
 
 		 424 aa  76.3  0.000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0443  tryptophanyl-tRNA synthetase  28.82 
 
 		 328 aa  72.8  0.00000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0428  tryptophanyl-tRNA synthetase  28.82 
 
 		 328 aa  72.8  0.00000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00430  tryptophan-tRNA ligase, putative  23.03 
 
 		 641 aa  70.5  0.00000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0320  tryptophanyl-tRNA synthetase  29.41 
 
 		 331 aa  68.2  0.0000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0887  tryptophanyl-tRNA synthetase  30 
 
 		 327 aa  67.8  0.0000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.512903  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1133  tryptophanyl-tRNA synthetase  29.17 
 
 		 330 aa  67.4  0.0000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.698787  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0072  tryptophanyl-tRNA synthetase  28.74 
 
 		 354 aa  65.1  0.000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2550  tryptophanyl-tRNA synthetase  24.11 
 
 		 400 aa  64.7  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00499882  normal  0.111326 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1867  tryptophanyl-tRNA synthetase  29.07 
 
 		 370 aa  65.1  0.000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.705084  normal  0.228313 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1429  tryptophanyl-tRNA synthetase  22.7 
 
 		 400 aa  64.7  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0845  tryptophanyl-tRNA synthetase  23.77 
 
 		 400 aa  63.9  0.000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0020  tryptophan--tRNA ligase  28.99 
 
 		 363 aa  63.2  0.00000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.15256 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0741  tryptophanyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 		 341 aa  63.5  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0159074  hitchhiker  0.00650672 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1393  tryptophanyl-tRNA synthetase  29.21 
 
 		 363 aa  62.4  0.00000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1583  tryptophanyl-tRNA synthetase  24.35 
 
 		 400 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.527529  normal  0.529268 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0993  tryptophanyl-tRNA synthetase  23.67 
 
 		 400 aa  62.4  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000498703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_40901  predicted protein  35.57 
 
 		 405 aa  62.4  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0070  tryptophanyl-tRNA synthetase  27.98 
 
 		 321 aa  62.4  0.00000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.229775  normal  0.611279 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2877  tryptophanyl-tRNA synthetase  32.18 
 
 		 348 aa  62  0.00000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1263  Tryptophan--tRNA ligase  33.14 
 
 		 334 aa  61.6  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0012  tryptophanyl-tRNA synthetase  29.38 
 
 		 344 aa  61.6  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00178071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1300  tryptophanyl-tRNA synthetase  27.33 
 
 		 324 aa  61.6  0.00000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1317  tryptophanyl-tRNA synthetase  29.24 
 
 		 348 aa  60.8  0.00000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0172213  normal  0.0239999 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3827  tryptophanyl-tRNA synthetase  28.24 
 
 		 331 aa  60.5  0.00000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0534777 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2236  tryptophanyl-tRNA synthetase  29.31 
 
 		 340 aa  60.5  0.00000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.139935  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2580  tryptophanyl-tRNA synthetase  27.27 
 
 		 332 aa  60.1  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.804405 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_19560  predicted protein  28.41 
 
 		 342 aa  60.1  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.387855  normal  0.373209 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14880  tryptophanyl-tRNA synthetase  29.59 
 
 		 349 aa  59.7  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00197202  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4636  tryptophanyl-tRNA synthetase  29.6 
 
 		 354 aa  59.7  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.188276  normal  0.0639753 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2109  tryptophanyl-tRNA synthetase  30.91 
 
 		 321 aa  59.7  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606388 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0915  tryptophanyl-tRNA synthetase  34.27 
 
 		 323 aa  59.7  0.0000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.229161  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0032  tryptophanyl-tRNA synthetase  28.07 
 
 		 329 aa  60.1  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0110  tryptophanyl-tRNA synthetase  25.42 
 
 		 333 aa  59.3  0.0000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2298  tryptophanyl-tRNA synthetase  25.44 
 
 		 327 aa  58.9  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1919  tryptophanyl-tRNA synthetase  27.98 
 
 		 337 aa  59.3  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00690514  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2482  tryptophanyl-tRNA synthetase  28.57 
 
 		 340 aa  58.9  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0874  tryptophanyl-tRNA synthetase  27.22 
 
 		 346 aa  58.5  0.0000003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1466  tryptophanyl-tRNA synthetase  28.92 
 
 		 403 aa  58.5  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1789  tryptophanyl-tRNA synthetase  28.92 
 
 		 403 aa  58.5  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1145  tryptophanyl-tRNA synthetase  28.9 
 
 		 352 aa  58.5  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000761726 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2090  tryptophanyl-tRNA synthetase  29.89 
 
 		 342 aa  57.8  0.0000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.679306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1247  tryptophanyl-tRNA synthetase  28.92 
 
 		 360 aa  58.2  0.0000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.258523  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2013  tryptophanyl-tRNA synthetase  28.57 
 
 		 332 aa  58.2  0.0000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0126369 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0579  tryptophanyl-tRNA synthetase  27.59 
 
 		 355 aa  58.2  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2085  tryptophanyl-tRNA synthetase  26.06 
 
 		 327 aa  57.8  0.0000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0459  tryptophanyl-tRNA synthetase  27.06 
 
 		 350 aa  57.8  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.860654  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0653  tryptophanyl-tRNA synthetase  28.99 
 
 		 349 aa  57.8  0.0000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00257706  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1882  tryptophanyl-tRNA synthetase  29.34 
 
 		 328 aa  57.8  0.0000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0014344  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1768  tryptophanyl-tRNA synthetase  30.56 
 
 		 347 aa  57.8  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.76091  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0670  tryptophanyl-tRNA synthetase  30.36 
 
 		 337 aa  57.4  0.0000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.167937 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0005  tryptophanyl-tRNA synthetase  26.44 
 
 		 351 aa  57.4  0.0000007  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0389  tryptophanyl-tRNA synthetase  25.93 
 
 		 319 aa  57.4  0.0000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1201  tryptophanyl-tRNA synthetase  28.07 
 
 		 327 aa  57.4  0.0000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1469  tryptophanyl-tRNA synthetase  29.59 
 
 		 329 aa  57  0.0000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4407  tryptophanyl-tRNA synthetase  31.25 
 
 		 340 aa  57  0.0000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0588  tryptophanyl-tRNA synthetase  27.98 
 
 		 339 aa  57  0.0000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.115132  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0352  tryptophanyl-tRNA synthetase  25.29 
 
 		 325 aa  57  0.0000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0201  tryptophanyl-tRNA synthetase II  29.7 
 
 		 346 aa  57  0.0000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.231145 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2459  tryptophanyl-tRNA synthetase  24.45 
 
 		 400 aa  57  0.0000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.915849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2157  tryptophanyl-tRNA synthetase  27.75 
 
 		 335 aa  57  0.0000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00108936 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0427  tryptophanyl-tRNA synthetase  27.75 
 
 		 354 aa  57  0.0000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.522536  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2825  tryptophanyl-tRNA synthetase  26.47 
 
 		 329 aa  57  0.0000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3963  tryptophanyl-tRNA synthetase  23.37 
 
 		 341 aa  56.6  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0213  tryptophanyl-tRNA synthetase  32.16 
 
 		 330 aa  57  0.000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.354615  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08970  Tryptophanyl-tRNA synthetase  25.57 
 
 		 333 aa  56.6  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1687  tryptophanyl-tRNA synthetase  28.4 
 
 		 326 aa  56.6  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0957395  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1560  tryptophanyl-tRNA synthetase  28.99 
 
 		 341 aa  56.6  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.206839 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>