145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2660 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_2660  protein of unknown function RIO1  100 
 
 
334 aa  675    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.365628  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2087  RIO-like kinase  68.11 
 
 
291 aa  431  1e-119  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3650  RIO-like kinase  67.99 
 
 
291 aa  419  1e-116  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0701  Non-specific serine/threonine protein kinase  66.23 
 
 
306 aa  414  9.999999999999999e-116  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.577267  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1605  Non-specific serine/threonine protein kinase  62.35 
 
 
338 aa  380  1e-104  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1785  hypothetical protein  44.44 
 
 
260 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0947  protein of unknown function RIO1  43.07 
 
 
264 aa  224  2e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0170  protein of unknown function RIO1  45.65 
 
 
265 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2456  protein of unknown function RIO1  41.89 
 
 
259 aa  207  3e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2464  protein of unknown function RIO1  40.75 
 
 
256 aa  205  1e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000000196699  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2792  Non-specific serine/threonine protein kinase  41.25 
 
 
261 aa  200  3e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0132105  normal  0.045052 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2499  protein of unknown function RIO1  41.38 
 
 
258 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1749  hypothetical protein  40.91 
 
 
288 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.963768  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0288  non-specific serine/threonine protein kinase  37.72 
 
 
273 aa  178  1e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.414498  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1280  RIO-like kinase  37.85 
 
 
254 aa  177  2e-43  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1626  non-specific serine/threonine protein kinase  37.37 
 
 
273 aa  177  2e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1002  protein of unknown function RIO1  38.08 
 
 
273 aa  176  4e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.397015  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1476  non-specific serine/threonine protein kinase  37.32 
 
 
273 aa  168  1e-40  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.525707  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0513  protein of unknown function RIO1  38.98 
 
 
241 aa  166  5.9999999999999996e-40  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0594  non-specific serine/threonine protein kinase  34.03 
 
 
270 aa  160  2e-38  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.881106  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1410  non-specific serine/threonine protein kinase  31.54 
 
 
259 aa  156  4e-37  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0498  non-specific serine/threonine protein kinase  37.31 
 
 
280 aa  151  1e-35  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.30075  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_82126  protein serine kinase  34.92 
 
 
495 aa  144  2e-33  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.103532 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0186  RIO-like kinase  35.06 
 
 
254 aa  142  8e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0203142  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1180  protein of unknown function RIO1  38.85 
 
 
267 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_50135  predicted protein  33.98 
 
 
626 aa  139  7e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0654  non-specific serine/threonine protein kinase  33.75 
 
 
248 aa  137  2e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.106036  normal  0.167973 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0852  non-specific serine/threonine protein kinase  36.29 
 
 
266 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.738588 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1850  protein of unknown function RIO1  34.36 
 
 
268 aa  132  6.999999999999999e-30  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0857988 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06363  Extragenic suppressor of the bimD6 mutationPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:O13330]  35.68 
 
 
558 aa  131  2.0000000000000002e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.46432  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0773  protein of unknown function RIO1  35.14 
 
 
266 aa  129  7.000000000000001e-29  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.5402  hitchhiker  0.00560977 
 
 
-
 
NC_006683  CNN01780  extragenic suppressor of bimD6 mutation, putative  32.13 
 
 
622 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_2858  predicted protein  32.03 
 
 
375 aa  124  2e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.850153 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46310  predicted protein  33.98 
 
 
1269 aa  121  1.9999999999999998e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.789471  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2603  protein of unknown function RIO1  31.02 
 
 
286 aa  103  5e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2984  Serine/threonine protein kinase involved in cell cycle control-like protein  39.77 
 
 
291 aa  100  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.513296  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6050  hypothetical protein  32.5 
 
 
300 aa  100  5e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0482  protein of unknown function RIO1  30.08 
 
 
285 aa  95.9  8e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3036  protein of unknown function RIO1  35.62 
 
 
314 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2912  hypothetical protein  35.62 
 
 
297 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.562363 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1442  protein of unknown function RIO1  33.33 
 
 
283 aa  94.4  2e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.296233  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2871  protein of unknown function RIO1  34.2 
 
 
297 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2779  protein of unknown function RIO1  35.62 
 
 
297 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.432077  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1194  protein of unknown function RIO1  27.24 
 
 
285 aa  94.4  3e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40859  predicted protein  27.34 
 
 
320 aa  93.6  4e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0450714 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0811  protein of unknown function RIO1  35.06 
 
 
295 aa  93.2  6e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2321  protein of unknown function RIO1  29.39 
 
 
302 aa  93.2  6e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.243501 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63200  hypothetical protein  33.48 
 
 
297 aa  92.8  8e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0748  RIO1/ZK632.3/MJ0444 family protein  35.34 
 
 
298 aa  92.4  9e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0739  protein of unknown function RIO1  33.19 
 
 
301 aa  91.7  1e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.0000129617  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0650  hypothetical protein  35.34 
 
 
298 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0434  hypothetical protein  29.46 
 
 
286 aa  90.9  3e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0196  serine/threonine protein kinase  29.07 
 
 
301 aa  90.5  3e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.797756  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5502  hypothetical protein  33.48 
 
 
297 aa  90.5  4e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00124  RIO1 family protein kinase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G11730)  28.92 
 
 
405 aa  90.1  5e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.270962  normal  0.782816 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6141  protein of unknown function RIO1  32.26 
 
 
296 aa  90.1  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.487286  normal  0.0422512 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0658  hypothetical protein  33.62 
 
 
298 aa  89.7  6e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.390403  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2078  hypothetical protein  31.6 
 
 
285 aa  89.4  9e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0689  protein of unknown function RIO1  27.4 
 
 
306 aa  88.6  1e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.126334 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2197  protein of unknown function RIO1  36.43 
 
 
279 aa  87.8  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0148625  hitchhiker  0.00120245 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2335  protein of unknown function RIO1  29.12 
 
 
306 aa  87.8  3e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.861409  normal  0.0151879 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3233  protein of unknown function RIO1  32.19 
 
 
240 aa  87  4e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06240  serine/threonine protein kinase involved in cell cycle control  32.13 
 
 
299 aa  87  4e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0163  protein of unknown function RIO1  32.77 
 
 
284 aa  86.7  6e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5882  protein of unknown function RIO1  33.48 
 
 
285 aa  86.3  7e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0548  protein of unknown function RIO1  30.61 
 
 
288 aa  86.3  8e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0501425  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0966  RIO-like kinase  28.4 
 
 
301 aa  85.9  9e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0589044  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2841  serine/threonine protein kinase  26.91 
 
 
381 aa  85.5  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0659409  normal  0.112308 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2801  RIO-like kinase  28.85 
 
 
303 aa  84.7  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2139  protein of unknown function RIO1  30.87 
 
 
287 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.262343  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1977  protein of unknown function RIO1  31.48 
 
 
306 aa  84.7  0.000000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1866  hypothetical protein  29.49 
 
 
278 aa  84  0.000000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.012692  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0697  protein of unknown function RIO1  30.47 
 
 
286 aa  83.6  0.000000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3677  protein of unknown function RIO1  30.47 
 
 
286 aa  83.6  0.000000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000162658  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0676  protein of unknown function RIO1  30.47 
 
 
286 aa  83.6  0.000000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.295058  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0707  protein of unknown function RIO1  30.47 
 
 
286 aa  83.6  0.000000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.938334  normal  0.753401 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0977  hypothetical protein  28.7 
 
 
285 aa  83.2  0.000000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3064  protein of unknown function RIO1  37.04 
 
 
308 aa  83.6  0.000000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.128757 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1386  protein of unknown function RIO1  33.04 
 
 
282 aa  83.6  0.000000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0533  protein of unknown function RIO1  29.12 
 
 
304 aa  83.6  0.000000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.489947  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3113  protein of unknown function RIO1  31.36 
 
 
284 aa  82.8  0.000000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0593615 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3392  protein of unknown function RIO1  30.21 
 
 
285 aa  82.8  0.000000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2195  protein of unknown function RIO1  33.91 
 
 
412 aa  82  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0554937  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1558  putative RIO1/ZK632.3/MJ0444 family protein  32.43 
 
 
286 aa  82.4  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0385053  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5852  protein of unknown function RIO1  33.15 
 
 
387 aa  82  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.445195  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0664  protein of unknown function RIO1  30.47 
 
 
285 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0129863  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3358  protein of unknown function RIO1  30.47 
 
 
285 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.119571  normal  0.025527 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0663  protein of unknown function RIO1  30.04 
 
 
285 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.24041  normal  0.125481 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2401  serine/threonine protein kinase  25.27 
 
 
302 aa  82  0.00000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.225173  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3973  hypothetical protein  29.18 
 
 
285 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0099  serine/threonine protein kinase  29.29 
 
 
295 aa  81.3  0.00000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0361  protein of unknown function RIO1  27.92 
 
 
246 aa  81.3  0.00000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1682  protein of unknown function RIO1  33.91 
 
 
411 aa  81.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.179514  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1606  protein of unknown function RIO1  30.28 
 
 
275 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000519001  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1753  protein of unknown function RIO1  33.91 
 
 
417 aa  81.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.107958  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0611  hypothetical protein  32.16 
 
 
282 aa  80.9  0.00000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.14502 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0706  protein of unknown function RIO1  30.47 
 
 
285 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4056  protein of unknown function RIO1  30.74 
 
 
308 aa  80.1  0.00000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1034  RIO-type serine/threonine protein kinase  30.68 
 
 
282 aa  79.3  0.00000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0400289  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2105  protein of unknown function RIO1  31.65 
 
 
302 aa  79  0.0000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>