More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2073 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_2073  seryl-tRNA synthetase  100 
 
 		 456 aa  915    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.400527  normal  0.190866 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0367  seryl-tRNA synthetase  70.99 
 
 		 459 aa  678    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1764  seryl-tRNA synthetase  77.19 
 
 		 451 aa  690    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2178  seryl-tRNA synthetase  70.55 
 
 		 459 aa  681    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0744  seryl-tRNA synthetase  76.92 
 
 		 461 aa  709    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0124446  normal  0.521424 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21060  seryl-tRNA synthetase  52.86 
 
 		 422 aa  454  1.0000000000000001e-126  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0011  seryl-tRNA synthetase  54.05 
 
 		 427 aa  440  9.999999999999999e-123  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0824317  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0014  seryl-tRNA synthetase  51.58 
 
 		 424 aa  433  1e-120  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000307933  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0015  seryl-tRNA synthetase  52.24 
 
 		 424 aa  431  1e-119  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00255283  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0012  seryl-tRNA synthetase  50.79 
 
 		 424 aa  425  1e-118  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0448744  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0013  seryl-tRNA synthetase  51.24 
 
 		 424 aa  426  1e-118  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000183486  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0016  seryl-tRNA synthetase  51.24 
 
 		 424 aa  427  1e-118  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0015  seryl-tRNA synthetase  51.24 
 
 		 424 aa  427  1e-118  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0013  seryl-tRNA synthetase  51.24 
 
 		 424 aa  427  1e-118  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.15266  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5302  seryl-tRNA synthetase  51.24 
 
 		 424 aa  426  1e-118  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000149119  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0013  seryl-tRNA synthetase  51.24 
 
 		 424 aa  426  1e-118  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00217945  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0018  seryl-tRNA synthetase  51.01 
 
 		 424 aa  426  1e-118  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000212252  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0012  seryl-tRNA synthetase  51.24 
 
 		 424 aa  427  1e-118  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000751386  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0016  seryl-tRNA synthetase  51.24 
 
 		 424 aa  426  1e-118  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00101457  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0012  seryl-tRNA synthetase  51.24 
 
 		 424 aa  426  1e-118  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000327784  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0541  seryl-tRNA synthetase  48.08 
 
 		 423 aa  423  1e-117  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0287  seryl-tRNA synthetase  50.34 
 
 		 422 aa  424  1e-117  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000736944  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0008  seryl-tRNA synthetase  51.24 
 
 		 421 aa  421  1e-116  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00944776  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1828  seryl-tRNA synthetase  48.75 
 
 		 430 aa  419  1e-116  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0872  seryl-tRNA synthetase  48.87 
 
 		 420 aa  416  9.999999999999999e-116  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000202567  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0013  seryl-tRNA synthetase  52.24 
 
 		 425 aa  416  9.999999999999999e-116  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0089  seryl-tRNA synthetase  49.1 
 
 		 422 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000355791 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3528  seryl-tRNA synthetase  50.22 
 
 		 423 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0108  seryl-tRNA synthetase  48.88 
 
 		 422 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3236  seryl-tRNA synthetase  47.4 
 
 		 423 aa  414  1e-114  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0965  seryl-tRNA synthetase  49.1 
 
 		 426 aa  413  1e-114  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000308686  hitchhiker  0.0000000659657 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0037  seryl-tRNA synthetase  47.98 
 
 		 422 aa  410  1e-113  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0326  seryl-tRNA synthetase  49.33 
 
 		 423 aa  410  1e-113  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  4.81003e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0021  seryl-tRNA synthetase  48.87 
 
 		 427 aa  410  1e-113  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.410192  hitchhiker  0.00000214163 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0013  seryl-tRNA synthetase  49.44 
 
 		 422 aa  409  1e-113  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000021419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4645  seryl-tRNA synthetase  47.61 
 
 		 424 aa  410  1e-113  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000263094  normal  0.52654 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0368  seryl-tRNA synthetase  48.76 
 
 		 425 aa  409  1e-113  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4339  seryl-tRNA synthetase  48.54 
 
 		 423 aa  405  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.619806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0013  seryl-tRNA synthetase  50 
 
 		 424 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2381  seryl-tRNA synthetase  46.4 
 
 		 423 aa  406  1.0000000000000001e-112  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0028  seryl-tRNA synthetase  49.66 
 
 		 423 aa  403  1e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000346844  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1724  seryl-tRNA synthetase  45.91 
 
 		 426 aa  402  1e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3466  seryl-tRNA synthetase  49.21 
 
 		 424 aa  400  9.999999999999999e-111  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00344693 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0356  seryl-tRNA synthetase  47.07 
 
 		 425 aa  399  9.999999999999999e-111  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1229  seryl-tRNA synthetase  49.66 
 
 		 427 aa  400  9.999999999999999e-111  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03450  seryl-tRNA synthetase  46.85 
 
 		 427 aa  400  9.999999999999999e-111  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.375203 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2932  seryl-tRNA synthetase  46.26 
 
 		 427 aa  399  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.426668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2031  seryl-tRNA synthetase  46.4 
 
 		 423 aa  401  9.999999999999999e-111  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.19968  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1870  seryl-tRNA synthetase  48.1 
 
 		 423 aa  400  9.999999999999999e-111  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.961379  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2729  seryl-tRNA synthetase  45.68 
 
 		 426 aa  398  9.999999999999999e-111  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3186  seryl-tRNA synthetase  46.03 
 
 		 427 aa  398  1e-109  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0010  Serine--tRNA ligase  46.67 
 
 		 427 aa  397  1e-109  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0427717  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1765  seryl-tRNA synthetase  45.74 
 
 		 431 aa  398  1e-109  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1006  seryl-tRNA synthetase  45.7 
 
 		 427 aa  393  1e-108  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.224003  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2745  seryl-tRNA synthetase  45.95 
 
 		 425 aa  393  1e-108  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0616  seryl-tRNA synthetase  45.76 
 
 		 422 aa  394  1e-108  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0308191  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0253  seryl-tRNA synthetase  46.47 
 
 		 425 aa  391  1e-107  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0449  seryl-tRNA synthetase  44.37 
 
 		 428 aa  389  1e-107  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2756  seryl-tRNA synthetase  46.74 
 
 		 424 aa  389  1e-107  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.019051  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1494  seryl-tRNA synthetase  48.1 
 
 		 424 aa  389  1e-107  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.457179 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1338  seryl-tRNA synthetase  47.33 
 
 		 427 aa  390  1e-107  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00311598 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2337  seryl-tRNA synthetase  45.56 
 
 		 438 aa  386  1e-106  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.252974 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1823  seryl-tRNA synthetase  46.83 
 
 		 427 aa  386  1e-106  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0594  seryl-tRNA synthetase  47.22 
 
 		 430 aa  385  1e-106  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2991  seryl-tRNA synthetase  45.72 
 
 		 429 aa  387  1e-106  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0022  seryl-tRNA synthetase  46.73 
 
 		 422 aa  387  1e-106  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3523  seryl-tRNA synthetase  47.27 
 
 		 425 aa  387  1e-106  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.580114 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1426  seryl-tRNA synthetase  46.73 
 
 		 426 aa  387  1e-106  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0522014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0182  seryl-tRNA synthetase  45.11 
 
 		 435 aa  387  1e-106  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.38997  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1424  seryl-tRNA synthetase  45.95 
 
 		 423 aa  387  1e-106  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.188091 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0014  seryl-tRNA synthetase  46.4 
 
 		 426 aa  385  1e-105  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.192456  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0931  seryl-tRNA synthetase  45.43 
 
 		 431 aa  383  1e-105  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2145  seryl-tRNA synthetase  44.67 
 
 		 438 aa  383  1e-105  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.119162  normal  0.699626 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1300  seryl-tRNA synthetase  47.19 
 
 		 427 aa  382  1e-105  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.341204  normal  0.68468 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0731  seryl-tRNA synthetase  44.84 
 
 		 431 aa  384  1e-105  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.758935 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0391  seryl-tRNA synthetase  45.72 
 
 		 432 aa  384  1e-105  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.405433  normal  0.944422 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2551  seryl-tRNA synthetase  45.11 
 
 		 438 aa  384  1e-105  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1776  seryl-tRNA synthetase  47.75 
 
 		 428 aa  384  1e-105  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0781762  hitchhiker  0.00882047 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0695  seryl-tRNA synthetase  45.29 
 
 		 426 aa  380  1e-104  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0194542  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0979  seryl-tRNA synthetase  43.6 
 
 		 423 aa  381  1e-104  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1195  seryl-tRNA synthetase  46.49 
 
 		 417 aa  381  1e-104  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.877064  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2740  seryl-tRNA synthetase  46.95 
 
 		 424 aa  381  1e-104  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.697108 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2626  seryl-tRNA synthetase  43.69 
 
 		 427 aa  381  1e-104  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26270  seryl-tRNA synthetase  44.02 
 
 		 428 aa  381  1e-104  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2596  seryl-tRNA synthetase  46.85 
 
 		 426 aa  377  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.359075  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1404  seryl-tRNA synthetase  47.38 
 
 		 425 aa  376  1e-103  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0506465  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2594  seryl-tRNA synthetase  44.84 
 
 		 434 aa  378  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.365068  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0573  seryl-tRNA synthetase  43.86 
 
 		 425 aa  376  1e-103  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0768  seryl-tRNA synthetase  44.12 
 
 		 428 aa  375  1e-103  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0579537  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1518  seryl-tRNA synthetase  45.27 
 
 		 426 aa  377  1e-103  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0825  seryl-tRNA synthetase  45.25 
 
 		 427 aa  377  1e-103  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.771006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0014  seryl-tRNA synthetase  47.06 
 
 		 425 aa  377  1e-103  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0014  seryl-tRNA synthetase  46.83 
 
 		 425 aa  376  1e-103  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30330  seryl-tRNA synthetase  46.85 
 
 		 426 aa  375  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.705305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0550  seryl-tRNA synthetase  43.15 
 
 		 413 aa  372  1e-102  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2986  seryl-tRNA synthetase  45.29 
 
 		 433 aa  372  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.340897  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2118  seryl-tRNA synthetase  45.29 
 
 		 433 aa  372  1e-102  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.510487  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2131  seryl-tRNA synthetase  44.7 
 
 		 428 aa  372  1e-102  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0131347  normal  0.0177706 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2626  seryl-tRNA synthetase  45.29 
 
 		 433 aa  372  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.18292  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2020  seryl-tRNA synthetase  44.92 
 
 		 428 aa  373  1e-102  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000521115  hitchhiker  0.00090554 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>