More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1610 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_1610  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  100 
 
 
308 aa  624  1e-178  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4001  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  82.27 
 
 
332 aa  484  1e-136  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.18225  hitchhiker  0.00239808 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6437  bacteriochlorophyllide reductase subunit  78.76 
 
 
332 aa  481  1e-135  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.967786  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1293  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  81.61 
 
 
331 aa  479  1e-134  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.579367  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3756  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  80.67 
 
 
332 aa  478  1e-134  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00499393 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2980  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  79.6 
 
 
322 aa  471  1e-132  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.551452  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1710  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  80 
 
 
332 aa  474  1e-132  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2052  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  79.26 
 
 
329 aa  461  1e-129  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0401365 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2730  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  80 
 
 
334 aa  457  9.999999999999999e-129  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.44114  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0262  chlorophyllide reductase, BchX subunit  75.33 
 
 
333 aa  458  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1906  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  75.33 
 
 
333 aa  458  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.195312  normal  0.342059 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2852  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  79.73 
 
 
334 aa  454  1e-127  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.467181 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2957  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  79.67 
 
 
334 aa  457  1e-127  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.562644  normal  0.106043 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2818  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  80 
 
 
334 aa  455  1e-127  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.292291  normal  0.370983 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3517  bacteriachlorophyllide reductase iron protein subunit X  73.36 
 
 
335 aa  442  1e-123  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.326677 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2036  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  73.93 
 
 
333 aa  442  1e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.128879  normal  0.148477 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0179  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  73.03 
 
 
332 aa  437  1e-121  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3697  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  78.93 
 
 
334 aa  427  1e-119  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.326081  hitchhiker  0.00364932 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3746  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  44.83 
 
 
392 aa  239  2.9999999999999997e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0605815  hitchhiker  0.0000012212 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1792  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  43.87 
 
 
368 aa  233  4.0000000000000004e-60  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.344281  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3260  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  45.09 
 
 
392 aa  232  6e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0257772 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3127  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  42.04 
 
 
411 aa  231  2e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0979  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  45.39 
 
 
370 aa  228  9e-59  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0400  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  48.4 
 
 
369 aa  226  3e-58  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0534457  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0937  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  43.58 
 
 
372 aa  226  3e-58  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0897  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  44.3 
 
 
365 aa  225  8e-58  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.159363  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1423  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  48.79 
 
 
366 aa  221  9e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1535  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  47.04 
 
 
365 aa  221  9.999999999999999e-57  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.292172  normal  0.0217876 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2821  nitrogenase iron protein  39.1 
 
 
272 aa  177  2e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.436411  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2098  nitrogenase iron protein  37.87 
 
 
292 aa  177  3e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1023  nitrogenase iron protein  39.02 
 
 
275 aa  173  3.9999999999999995e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1573  nitrogenase iron protein subunit NifH  37.31 
 
 
284 aa  172  5.999999999999999e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0171  nitrogenase reductase  38.4 
 
 
273 aa  171  1e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.217628  normal  0.670038 
 
 
-
 
NC_002936  DET1158  nitrogenase reductase  37.23 
 
 
274 aa  168  1e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3030  nitrogenase iron protein  36.84 
 
 
288 aa  167  2e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1142  nitrogenase iron protein  36.74 
 
 
276 aa  167  2.9999999999999998e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.442855  normal  0.809863 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1049  nitrogenase iron protein  36.09 
 
 
275 aa  167  2.9999999999999998e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1019  nitrogenase reductase  37.45 
 
 
274 aa  167  2.9999999999999998e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.855562  normal  0.490785 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01380  Nitrogenase iron protein  37.17 
 
 
290 aa  166  4e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0834  nitrogenase reductase  36.94 
 
 
276 aa  166  5e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0561  nitrogenase iron protein  36.5 
 
 
276 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.0000368653  normal  0.199489 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3203  nitrogenase iron protein  38.28 
 
 
288 aa  165  9e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1751  nitrogenase reductase  38.76 
 
 
274 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.555016  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3467  nitrogenase iron protein  37.22 
 
 
288 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0506  nitrogenase reductase-like protein  35.38 
 
 
290 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0274  nitrogenase iron protein  38.29 
 
 
291 aa  164  2.0000000000000002e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.23577  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0793  nitrogenase  37.5 
 
 
280 aa  163  3e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00476725  normal  0.0446468 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1815  Nitrogenase  41.06 
 
 
251 aa  162  5.0000000000000005e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1415  nitrogenase iron protein subunit NifH  37.31 
 
 
296 aa  162  5.0000000000000005e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.210537 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0491  nitrogenase iron protein  36.8 
 
 
293 aa  162  5.0000000000000005e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1202  nitrogenase iron protein subunit NifH  36.43 
 
 
296 aa  162  6e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.451718  hitchhiker  0.00669218 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0237  Nitrogenase  37.64 
 
 
272 aa  161  1e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.848648  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1949  nitrogenase reductase  38.13 
 
 
274 aa  160  2e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00645764  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2907  nitrogenase iron protein  36.43 
 
 
289 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1627  nitrogenase reductase  38.37 
 
 
274 aa  160  2e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000481616  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2597  nitrogenase iron protein  36.43 
 
 
289 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.036256  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1201  nitrogenase iron protein  34.44 
 
 
273 aa  160  3e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4043  nitrogenase iron protein  35.19 
 
 
273 aa  160  3e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0162942 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1616  NifH/frxC-family protein  36.26 
 
 
276 aa  160  3e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0685  nitrogenase reductase  37.74 
 
 
274 aa  160  3e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1528  nitrogenase reductase  37.74 
 
 
274 aa  159  4e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3090  nitrogenase reductase  37.13 
 
 
277 aa  159  4e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2886  Nitrogenase  37.82 
 
 
290 aa  159  5e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.781168  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2083  nitrogenase  37.5 
 
 
270 aa  159  7e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1244  nitrogenase reductase  38.13 
 
 
274 aa  159  8e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000240583  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3534  nitrogenase reductase  34.88 
 
 
299 aa  158  9e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.332377  normal  0.0514365 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4930  nitrogenase reductase  35.59 
 
 
295 aa  158  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2120  nitrogenase iron protein  34.22 
 
 
299 aa  158  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.109902 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2145  nitrogenase iron protein  37.89 
 
 
289 aa  157  2e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.936237 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2074  nitrogenase iron protein  37.89 
 
 
289 aa  157  2e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1010  nitrogenase reductase  34.77 
 
 
295 aa  157  2e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2610  nitrogenase reductase  35.07 
 
 
275 aa  157  2e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.343866  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1240  nitrogenase reductase  36.94 
 
 
296 aa  157  3e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.118183 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1522  nitrogenase reductase  36.94 
 
 
296 aa  157  3e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4488  nitrogenase iron protein subunit NifH  35.56 
 
 
287 aa  156  4e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2008  nitrogenase iron protein  35.36 
 
 
324 aa  156  4e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.221735  normal  0.365396 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1224  nitrogenase reductase-like protein  36.12 
 
 
278 aa  156  4e-37  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2281  nitrogenase reductase  36.09 
 
 
275 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000562599  normal  0.173141 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1353  nitrogenase iron protein  34.95 
 
 
292 aa  156  5.0000000000000005e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000220216  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0088  nitrogenase reductase  35.25 
 
 
303 aa  155  6e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.55556  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02660  vanadium nitrogenase iron protein  37.16 
 
 
290 aa  155  6e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2613  nitrogenase reductase  35.79 
 
 
276 aa  155  7e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0662  nitrogenase iron protein subunit NifH  36.72 
 
 
289 aa  155  7e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.24324  normal  0.221237 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0095  Nitrogenase  44.39 
 
 
299 aa  155  9e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0228262 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0795  nitrogenase iron protein  35.69 
 
 
291 aa  155  9e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.835028  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1218  nitrogenase iron protein  36.96 
 
 
288 aa  155  9e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2821  nitrogenase iron protein  36.82 
 
 
289 aa  154  1e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5052  nitrogenase reductase  34.52 
 
 
295 aa  154  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5101  nitrogenase reductase  34.88 
 
 
298 aa  155  1e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0744  nitrogenase reductase  36.96 
 
 
274 aa  155  1e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5879  nitrogenase reductase  37.41 
 
 
295 aa  154  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0809019  normal  0.897591 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3916  nitrogenase reductase  34.94 
 
 
295 aa  154  2e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6881  nitrogenase iron protein  35.19 
 
 
289 aa  154  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.82086  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5925  nitrogenase reductase  37.41 
 
 
295 aa  154  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.780912  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0143  nitrogenase reductase  35.96 
 
 
293 aa  154  2e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4054  nitrogenase iron protein subunit NifH  33.55 
 
 
324 aa  153  2.9999999999999998e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00458685  normal  0.287563 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49000  nitrogenase reductase  35.34 
 
 
275 aa  153  4e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4247  nitrogenase iron protein subunit NifH  34.95 
 
 
296 aa  152  5e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.252394  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4684  nitrogenase reductase  33.83 
 
 
275 aa  152  5e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0774  nitrogenase  35.42 
 
 
290 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>