More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_3182 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_3182  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  100 
 
 
618 aa  1238    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1114  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  30.33 
 
 
605 aa  299  9e-80  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2141  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  29.17 
 
 
624 aa  281  2e-74  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2027  MutS-like mismatch repair protein, ATPase  30.12 
 
 
596 aa  267  5e-70  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3595  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  29.56 
 
 
607 aa  266  8.999999999999999e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0161652  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2469  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  28.14 
 
 
626 aa  263  1e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0247  DNA mismatch repair protein MutS-like protein  28.26 
 
 
601 aa  256  7e-67  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2411  MutS domain-containing protein  28.69 
 
 
595 aa  254  4.0000000000000004e-66  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.133991  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2123  MutS domain-containing protein  28.69 
 
 
595 aa  254  4.0000000000000004e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1070  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  29.53 
 
 
593 aa  253  7e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0359  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  30.33 
 
 
598 aa  250  5e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2709  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  28.45 
 
 
590 aa  246  9.999999999999999e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0186895  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5542  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  32.38 
 
 
610 aa  240  5e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0988  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  28.53 
 
 
615 aa  226  9e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.928875  normal  0.94372 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2547  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  35.43 
 
 
597 aa  222  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04875  DNA mismatch repair protein mutS  27.08 
 
 
601 aa  221  3.9999999999999997e-56  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2451  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  33.1 
 
 
597 aa  211  2e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.412357  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0156  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  26.49 
 
 
586 aa  211  3e-53  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1406  DNA mismatch repair protein MutS-like  35.07 
 
 
597 aa  211  3e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4132  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  29.85 
 
 
610 aa  204  3e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.300253 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2236  DNA mismatch repair protein  27.23 
 
 
590 aa  195  2e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0656  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  29.25 
 
 
604 aa  182  2e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2424  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  33.39 
 
 
594 aa  174  5e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.720949  normal  0.166887 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0562  DNA mismatch repair protein MutS-like  41.2 
 
 
243 aa  140  7e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0706  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  29.48 
 
 
438 aa  137  5e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.574952  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0300  MutS domain-containing protein  32.64 
 
 
521 aa  127  8.000000000000001e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0305  MutS domain-containing protein  31.12 
 
 
521 aa  126  1e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.667577  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2383  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  30.8 
 
 
558 aa  122  1.9999999999999998e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.356876  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1160  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  28.75 
 
 
554 aa  119  1.9999999999999998e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2122  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  26.56 
 
 
536 aa  114  8.000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0365547  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2085  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  26.56 
 
 
536 aa  114  8.000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00891152  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0552  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  28.57 
 
 
555 aa  113  1.0000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0886  MutS domain-containing protein  32.1 
 
 
557 aa  110  8.000000000000001e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.437767  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1660  MutS family protein  30.66 
 
 
538 aa  101  4e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0221998  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3054  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  30.98 
 
 
437 aa  98.2  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.613085  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1769  DNA mismatch repair protein MutS  23.69 
 
 
846 aa  97.1  9e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2226  DNA mismatch repair protein MutS  33.46 
 
 
956 aa  96.3  1e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.137389  normal  0.561287 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1768  DNA mismatch repair protein MutS  23.5 
 
 
846 aa  94.7  4e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0622  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  40.52 
 
 
112 aa  92.8  2e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000499338  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2666  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  30.08 
 
 
423 aa  91.7  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.892577  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0358  DNA mismatch repair protein MutS  29.08 
 
 
918 aa  90.1  1e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.613152  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3819  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  31.12 
 
 
445 aa  88.2  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.081272  normal  0.267024 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3053  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  29.86 
 
 
450 aa  87.4  6e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1822  DNA mismatch repair protein MutS  35.8 
 
 
871 aa  87.8  6e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0116284  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1520  DNA mismatch repair protein MutS  28.25 
 
 
848 aa  86.7  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1169  DNA mismatch repair protein MutS  31.6 
 
 
864 aa  86.3  0.000000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.29255 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2667  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  28.64 
 
 
442 aa  85.9  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.235578  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2380  DNA mismatch repair protein MutS  29.66 
 
 
893 aa  84.3  0.000000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1466  DNA mismatch repair protein MutS  31.07 
 
 
872 aa  84  0.000000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1202  DNA mismatch repair protein MutS  29.95 
 
 
860 aa  83.6  0.000000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000170445  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2095  DNA mismatch repair protein MutS  28.52 
 
 
903 aa  83.2  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01708  protein required for mismatch repair in mitosis and meiosis (Eurofung)  29.25 
 
 
1186 aa  82.4  0.00000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1115  DNA mismatch repair protein MutS  26.97 
 
 
793 aa  82.8  0.00000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2064  mismatch repair ATPase  36.22 
 
 
427 aa  82.4  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1166  MutS2 family protein  38.1 
 
 
761 aa  81.6  0.00000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.690197  normal  0.0205926 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7097  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  27.84 
 
 
443 aa  81.6  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000373438  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0434  DNA mismatch repair protein MutS  35.29 
 
 
853 aa  81.3  0.00000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0558205  normal  0.0590484 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0330  DNA mismatch repair protein MutS  24.81 
 
 
917 aa  81.3  0.00000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1976  DNA mismatch repair protein MutS  32.04 
 
 
904 aa  80.5  0.00000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0020973  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0899  MutS2 family protein  31.4 
 
 
789 aa  80.5  0.00000000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.461302  normal  0.733658 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1015  DNA mismatch repair protein MutS  26.16 
 
 
793 aa  80.1  0.0000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0553  DNA mismatch repair protein MutS  29.28 
 
 
882 aa  80.1  0.0000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1710  MutS2 family protein  32.59 
 
 
820 aa  79.7  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.261707  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1104  MutS2 family protein  34.93 
 
 
750 aa  79.3  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1332  DNA mismatch repair protein MutS  29.27 
 
 
930 aa  79.3  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2957  DNA mismatch repair protein MutS  29.25 
 
 
854 aa  79.3  0.0000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1950  DNA mismatch repair protein MutS  32.99 
 
 
872 aa  79.3  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.998424  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1896  DNA mismatch repair protein MutS  32.93 
 
 
872 aa  78.6  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0824451  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3337  DNA mismatch repair protein MutS  28.35 
 
 
854 aa  78.2  0.0000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4014  MutS2 family protein  30.9 
 
 
828 aa  78.2  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.301308  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81012  Mismatch repair ATPase MSH6 (MutS family)  28.31 
 
 
1212 aa  77.8  0.0000000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0833152 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0956  DNA mismatch repair protein MutS  27.78 
 
 
851 aa  78.2  0.0000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1033  DNA mismatch repair protein MutS  30.93 
 
 
872 aa  77.8  0.0000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.256802  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1611  DNA mismatch repair protein MutS  28.57 
 
 
867 aa  77.8  0.0000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.749504  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1619  DNA mismatch repair protein MutS  32.55 
 
 
897 aa  77.8  0.0000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.510747 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1001  DNA mismatch repair protein MutS  30 
 
 
819 aa  77.4  0.0000000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.280502  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0355  DNA mismatch repair protein MutS  36.36 
 
 
910 aa  77.4  0.0000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0171458 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3424  DNA mismatch repair protein MutS  27.78 
 
 
851 aa  77.4  0.0000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0458  DNA mismatch repair protein MutS  29.52 
 
 
865 aa  77  0.000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.143165  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0576  DNA mismatch repair protein MutS  34.38 
 
 
854 aa  76.6  0.000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0274453  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3528  DNA mismatch repair protein MutS  31.47 
 
 
894 aa  76.6  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3142  DNA mismatch repair protein MutS  28.28 
 
 
852 aa  76.6  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3224  DNA mismatch repair protein MutS  33.54 
 
 
895 aa  76.3  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3292  DNA mismatch repair protein MutS  27.78 
 
 
851 aa  77  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1431  DNA mismatch repair protein MutS  31.91 
 
 
892 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.964721 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3803  DNA mismatch repair protein MutS  31.91 
 
 
892 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3618  DNA mismatch repair protein MutS  31.47 
 
 
892 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3510  DNA mismatch repair protein MutS  31.47 
 
 
890 aa  76.3  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK02590  mismatch repair-related protein, putative  29.47 
 
 
1205 aa  75.9  0.000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.102659  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3905  DNA mismatch repair protein MutS  31.47 
 
 
892 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0528  DNA mismatch repair protein MutS  33.51 
 
 
911 aa  76.3  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0799066  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3816  DNA mismatch repair protein MutS  31.47 
 
 
892 aa  76.3  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0964  DNA mismatch repair protein MutS  27.13 
 
 
854 aa  75.9  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0854968  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3868  DNA mismatch repair protein MutS  31.91 
 
 
890 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3781  DNA mismatch repair protein MutS  31.47 
 
 
892 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0472636 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0833  DNA mismatch repair protein MutS  27.53 
 
 
851 aa  75.9  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0278286 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1576  DNA mismatch repair protein MutS  27.92 
 
 
854 aa  75.9  0.000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1256  DNA mismatch repair protein MutS  28.57 
 
 
887 aa  75.5  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.280018  hitchhiker  0.00178613 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1216  DNA mismatch repair protein MutS  31.29 
 
 
903 aa  75.1  0.000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0405457 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0777  DNA mismatch repair protein MutS  30.26 
 
 
870 aa  75.5  0.000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.235285  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>