More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_1575 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_1575  major facilitator transporter  100 
 
 
472 aa  948    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1968  major facilitator transporter  38.14 
 
 
461 aa  269  8e-71  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0193  major facilitator superfamily MFS_1  30.83 
 
 
448 aa  158  2e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4661  major facilitator transporter  33.26 
 
 
454 aa  155  2e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.731341  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3129  amino acid adenylation domain-containing protein  28.51 
 
 
1816 aa  150  6e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.975665  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6842  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  26.94 
 
 
1876 aa  146  6e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.731708  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0001  major facilitator transporter  29.36 
 
 
434 aa  146  7.0000000000000006e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.51078  hitchhiker  0.00413697 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2208  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  28.41 
 
 
1829 aa  145  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.190766  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1904  amino acid adenylation domain-containing protein  26.2 
 
 
1833 aa  143  6e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0692  major facilitator transporter  25.9 
 
 
439 aa  142  9.999999999999999e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3346  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  27.88 
 
 
1864 aa  138  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0153259 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5075  amino acid adenylation domain protein  26.96 
 
 
1769 aa  136  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.944137  normal  0.714561 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1747  major facilitator superfamily MFS_1  26.09 
 
 
463 aa  134  3e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.192343  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5583  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  28.88 
 
 
1806 aa  134  3.9999999999999996e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.786514 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2420  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  27.62 
 
 
1839 aa  127  4.0000000000000003e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.452144  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2407  major facilitator superfamily MFS_1  27.6 
 
 
437 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0245013  normal  0.811162 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4889  major facilitator transporter  28.82 
 
 
449 aa  124  3e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.295208 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6160  major facilitator superfamily MFS_1  30.39 
 
 
438 aa  124  4e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.48405  normal  0.204358 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3450  major facilitator superfamily MFS_1  28.88 
 
 
499 aa  123  6e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00033474 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3103  major facilitator superfamily MFS_1  26.97 
 
 
434 aa  123  7e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00979206  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3019  major facilitator superfamily MFS_1  26.97 
 
 
434 aa  123  7e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3179  major facilitator transporter  24.48 
 
 
445 aa  123  7e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4102  major facilitator transporter  28.63 
 
 
438 aa  122  9.999999999999999e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.277859  normal  0.56542 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4415  major facilitator transporter  26.01 
 
 
449 aa  120  3.9999999999999996e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1250  major facilitator transporter  28.54 
 
 
425 aa  119  9e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2654  macrolide efflux protein, putative  26.21 
 
 
414 aa  115  2.0000000000000002e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3334  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  24.64 
 
 
1776 aa  114  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.311515  normal  0.562431 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0208  major facilitator superfamily MFS_1  26.33 
 
 
433 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25090  Major facilitator superfamily transporter  25 
 
 
411 aa  111  2.0000000000000002e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2187  major facilitator family transporter  26.02 
 
 
495 aa  111  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189175  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4120  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  24.32 
 
 
2720 aa  110  5e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0715236 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1114  major facilitator superfamily MFS_1  24.66 
 
 
415 aa  105  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3682  major facilitator superfamily MFS_1  28.12 
 
 
432 aa  100  5e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3736  major facilitator superfamily MFS_1  28.12 
 
 
432 aa  100  5e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.854411  normal  0.0699565 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4328  major facilitator transporter  24.09 
 
 
430 aa  96.7  7e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0871  macrolide efflux protein, putative  23.13 
 
 
394 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1862  major facilitator transporter  28.27 
 
 
432 aa  94.7  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2511  ABC transporter, permease protein, putative  24.77 
 
 
414 aa  93.2  9e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00150223  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1559  major facilitator transporter  23.33 
 
 
412 aa  92  2e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000341731  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0024  macrolide-efflux protein  24.4 
 
 
397 aa  92  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0413389 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1539  major facilitator transporter  22.63 
 
 
412 aa  92  2e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000151531  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1381  major facilitator superfamily MFS_1  24.66 
 
 
407 aa  91.7  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000258845  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1517  major facilitator superfamily MFS_1  26.6 
 
 
412 aa  91.7  3e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.5366 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0536  major facilitator superfamily MFS_1  23.75 
 
 
432 aa  90.5  5e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.187699  hitchhiker  0.000017573 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1508  major facilitator superfamily permease  24.65 
 
 
403 aa  89.7  9e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2001  major facilitator transporter  25.28 
 
 
425 aa  89.7  9e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05460  macrolide-efflux transmembrane protein  24.05 
 
 
450 aa  89.4  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.810092  normal  0.114702 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5239  macrolide-efflux protein  23.92 
 
 
397 aa  89.4  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0593  major facilitator transporter  24.64 
 
 
413 aa  89  2e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00370301  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0578  major facilitator transporter  24.64 
 
 
413 aa  89  2e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0133344  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21930  major facilitator superfamily MFS_1  24.38 
 
 
432 aa  87  6e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1118  major facilitator superfamily MFS_1  24.63 
 
 
406 aa  86.7  8e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2273  permease; macrolide-efflux protein  23.82 
 
 
417 aa  86.7  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00046211  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2286  major facilitator transporter  25.2 
 
 
414 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0407537  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2305  ABC transporter permease  22.28 
 
 
417 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0193471  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1445  major facilitator transporter  24.21 
 
 
390 aa  85.5  0.000000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00616907  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1491  major facilitator transporter  24.21 
 
 
390 aa  85.5  0.000000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.326017  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2480  ABC transporter permease  22.28 
 
 
415 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0926781  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2227  permease; macrolide-efflux protein  23.82 
 
 
417 aa  85.1  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0120958  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2576  putative ABC transporter, permease protein  23.19 
 
 
415 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00174173  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2255  putative permease  23.44 
 
 
404 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.134353 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2046  hypothetical protein  24.48 
 
 
448 aa  84.3  0.000000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.258697 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2501  putative ABC transporter, permease protein  23.6 
 
 
415 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2925  major facilitator transporter  23.92 
 
 
425 aa  84.3  0.000000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3024  putative permease  23.79 
 
 
406 aa  83.2  0.000000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0098  major facilitator superfamily MFS_1  24.76 
 
 
428 aa  81.6  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2643  major facilitator transporter  26.49 
 
 
399 aa  82  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.238963  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2435  putative ABC transporter, permease protein  22.34 
 
 
414 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.70932  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3025  permease, putative  22.64 
 
 
406 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.076608  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2707  macrolide efflux protein  24.01 
 
 
406 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0968867  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2989  putative permease  22.84 
 
 
362 aa  80.1  0.00000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0872  H+ Antiporter protein  24.26 
 
 
405 aa  79.7  0.0000000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2582  permease, putative  25.69 
 
 
408 aa  79  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2318  macrolide-efflux protein  24.25 
 
 
408 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31097  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2631  putative permease  24.56 
 
 
408 aa  76.6  0.0000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0615976  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2726  macrolide efflux protein  23.79 
 
 
406 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.277105  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2355  macrolide-efflux protein  24.35 
 
 
408 aa  75.1  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000199839  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0066  macrolide-efflux protein  21.82 
 
 
441 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000436229  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0691  major facilitator transporter  24.65 
 
 
428 aa  74.7  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.877498 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2380  major facilitator transporter  24.57 
 
 
474 aa  75.1  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2984  putative permease  24.69 
 
 
404 aa  75.1  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000116191 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1928  major facilitator superfamily MFS_1  24.76 
 
 
414 aa  73.9  0.000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0688885  normal  0.183583 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5212  major facilitator superfamily MFS_1  24.25 
 
 
408 aa  73.9  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0948922  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2777  permease  23.27 
 
 
406 aa  73.2  0.000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.145309  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2988  permease  23.27 
 
 
406 aa  73.2  0.000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0240  transporter, putative  23.4 
 
 
393 aa  73.2  0.00000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2589  putative permease  23.88 
 
 
408 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.59543e-18 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2402  permease  23.88 
 
 
408 aa  72  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0859078  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3952  major facilitator transporter  26.39 
 
 
413 aa  72  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2577  permease  23.88 
 
 
408 aa  72  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.659755  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1011  major facilitator superfamily MFS_1  24.12 
 
 
458 aa  71.6  0.00000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3037  major facilitator superfamily MFS_1  23.31 
 
 
421 aa  71.2  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2024  major facilitator superfamily MFS_1  23.23 
 
 
419 aa  70.9  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1259  major facilitator superfamily MFS_1  24.58 
 
 
445 aa  70.9  0.00000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.186094  normal  0.385793 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2526  H+ Antiporter protein  23.93 
 
 
411 aa  70.9  0.00000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000735797  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2814  major facilitator superfamily MFS_1  24.15 
 
 
402 aa  70.5  0.00000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0369  major facilitator transporter  24.16 
 
 
418 aa  70.1  0.00000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.616869  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2326  major facilitator superfamily MFS_1  21.18 
 
 
410 aa  70.1  0.00000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0427  transporter, putative  22.76 
 
 
412 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3705  major facilitator superfamily MFS_1  22.9 
 
 
411 aa  69.7  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.224607  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>