More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_0684 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_0684  ABC transporter related  100 
 
 
598 aa  1202    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000210902  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1080  ABC transporter related  55.5 
 
 
601 aa  631  1e-180  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00169898 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  51.44 
 
 
598 aa  603  1.0000000000000001e-171  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3398  ABC transporter related  50.6 
 
 
598 aa  556  1e-157  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273417  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1216  ABC transporter related  49.91 
 
 
597 aa  540  9.999999999999999e-153  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.791805  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1385  ABC transporter related  48.15 
 
 
600 aa  521  1e-146  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0831464  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0186  ABC transporter related protein  45.9 
 
 
623 aa  501  1e-140  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.437337  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2815  ABC transporter related  44.56 
 
 
594 aa  496  1e-139  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.264488  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  45.75 
 
 
556 aa  495  9.999999999999999e-139  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2086  ABC transporter related  43.91 
 
 
597 aa  481  1e-134  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2159  ABC transporter related  45.08 
 
 
603 aa  475  1e-132  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.912689  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5540  ABC transporter related protein  42.76 
 
 
601 aa  467  9.999999999999999e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.27279 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4133  ABC transporter related  42.06 
 
 
614 aa  457  1e-127  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.293166 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0825  ABC transporter related  40.84 
 
 
575 aa  455  1.0000000000000001e-126  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0337  ABC transporter related  40.31 
 
 
582 aa  449  1e-125  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0285  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  41.04 
 
 
601 aa  447  1.0000000000000001e-124  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.451102  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4067  ABC transporter related  41.25 
 
 
596 aa  448  1.0000000000000001e-124  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00142757  normal  0.169154 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000242  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease component  40.87 
 
 
586 aa  444  1e-123  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3667  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  43.52 
 
 
608 aa  439  9.999999999999999e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0082  ATPase  42.11 
 
 
582 aa  437  1e-121  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2096  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  42.78 
 
 
616 aa  436  1e-121  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.163444  hitchhiker  0.0014118 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1495  ABC transporter-like protein protein  45.08 
 
 
578 aa  437  1e-121  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.155275  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3151  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  43.28 
 
 
619 aa  437  1e-121  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06023  ABC efflux transporter permease/ATP-binding protein  40.17 
 
 
586 aa  438  1e-121  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2836  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  40.14 
 
 
585 aa  433  1e-120  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.333651  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2260  ABC transporter ATP-binding protein  39.93 
 
 
571 aa  432  1e-120  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3626  ABC transporter related  40.41 
 
 
588 aa  434  1e-120  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.058238  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0797  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  41.8 
 
 
632 aa  432  1e-120  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.732522 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2616  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  39.82 
 
 
577 aa  432  1e-120  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0639798  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  38.99 
 
 
597 aa  433  1e-120  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2746  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  43.03 
 
 
627 aa  432  1e-119  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0546982 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4572  ABC transporter, transmembrane region  45.47 
 
 
546 aa  432  1e-119  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2349  ABC transporter-related protein  40.38 
 
 
571 aa  431  1e-119  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3501  ABC transporter related  45.01 
 
 
575 aa  429  1e-118  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1520  ABC transporter related  39.46 
 
 
597 aa  427  1e-118  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.887648  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1607  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  42.39 
 
 
590 aa  427  1e-118  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.343192 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4790  ABC transporter related  46.28 
 
 
550 aa  427  1e-118  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.187036  normal  0.356857 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1510  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  42.54 
 
 
628 aa  428  1e-118  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.639878 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3025  ABC transporter related  38.58 
 
 
582 aa  428  1e-118  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1285  ABC transporter related protein  38.81 
 
 
585 aa  425  1e-117  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.652863  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0672  ABC transporter related  45.42 
 
 
578 aa  423  1e-117  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4203  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  41.09 
 
 
650 aa  424  1e-117  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.089699 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1259  ATP-binding transport protein; multicopy suppressor of HtrB  38.5 
 
 
579 aa  424  1e-117  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4342  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  41.3 
 
 
639 aa  424  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.180584  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2719  ABC transporter related  39.38 
 
 
606 aa  423  1e-117  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1362  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  41.1 
 
 
580 aa  424  1e-117  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1461  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  37.99 
 
 
605 aa  425  1e-117  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3231  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  42.04 
 
 
572 aa  421  1e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.659501  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1830  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter  41.07 
 
 
589 aa  422  1e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4490  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  40.72 
 
 
641 aa  421  1e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.85611 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3183  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  41.07 
 
 
603 aa  419  1e-116  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1442  ABC transporter related  40.53 
 
 
606 aa  420  1e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2392  ABC transporter related  42.96 
 
 
580 aa  421  1e-116  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0289  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  38.92 
 
 
600 aa  422  1e-116  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2444  ABC transporter related  42.78 
 
 
580 aa  416  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.385044 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6942  ABC transporter ATP-binding protein  40.48 
 
 
619 aa  417  9.999999999999999e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.676963 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3238  ABC transporter related  40.49 
 
 
594 aa  416  9.999999999999999e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00207534  normal  0.825064 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0989  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  41.33 
 
 
634 aa  419  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2528  ABC transporter related  38.78 
 
 
580 aa  415  1e-114  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000757065  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3415  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  39.79 
 
 
580 aa  413  1e-114  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0332  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  41.07 
 
 
586 aa  414  1e-114  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1586  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  40.07 
 
 
579 aa  414  1e-114  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0765157  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3249  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  42.42 
 
 
600 aa  412  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.305361 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3627  ABC transporter related  39.37 
 
 
617 aa  414  1e-114  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2499  ABC transporter transmembrane region  39.32 
 
 
601 aa  415  1e-114  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0008  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  40.73 
 
 
590 aa  413  1e-114  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1920  ABC transporter related  38.51 
 
 
578 aa  409  1e-113  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3546  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  42.26 
 
 
600 aa  409  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2950  ABC efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  38.27 
 
 
589 aa  410  1e-113  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.183404  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1954  ABC transporter related  38.51 
 
 
578 aa  409  1e-113  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01193  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  40.99 
 
 
589 aa  410  1e-113  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.169603  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2497  ABC transporter related  39.02 
 
 
614 aa  409  1e-113  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2717  ABC transporter related  39.73 
 
 
608 aa  410  1e-113  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0584  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  38.51 
 
 
586 aa  409  1e-113  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2618  ABC transporter related  39.14 
 
 
617 aa  412  1e-113  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000100526  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  38.57 
 
 
575 aa  410  1e-113  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3335  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  37.89 
 
 
634 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.509209  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0583  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  38.51 
 
 
586 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5367  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  42.73 
 
 
614 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.765695  decreased coverage  0.00185624 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2627  ABC transporter related  40.81 
 
 
592 aa  409  1.0000000000000001e-112  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0496  ABC transporter ATP-binding/permease  38.17 
 
 
586 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.384636  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0439  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  38.34 
 
 
586 aa  408  1.0000000000000001e-112  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.214785  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0435  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  38.51 
 
 
586 aa  408  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.290198  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2350  ABC transporter related protein  39.9 
 
 
620 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1262  ABC transporter-related protein  39.13 
 
 
601 aa  406  1.0000000000000001e-112  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000140001 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3351  ABC transporter related  38.77 
 
 
579 aa  406  1.0000000000000001e-112  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.773989  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0528  ABC transporter permease/ATP-binding protein  38.17 
 
 
586 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.249641  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0532  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  38.17 
 
 
586 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.117534  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3544  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  41.24 
 
 
629 aa  407  1.0000000000000001e-112  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0511  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  38.34 
 
 
586 aa  408  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1370  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  38.82 
 
 
598 aa  407  1.0000000000000001e-112  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.15083  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1024  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  38.06 
 
 
634 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0955  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  37.89 
 
 
644 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2021  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  39.4 
 
 
589 aa  403  1e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.47227  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0845  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  40.59 
 
 
580 aa  405  1e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.814931  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4793  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  38.17 
 
 
586 aa  405  1e-111  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.646278  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3884  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  40.14 
 
 
597 aa  402  1e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.171171 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0444  ABC transporter related  37.82 
 
 
586 aa  404  1e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1057  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  37.89 
 
 
644 aa  405  1e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.681718  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3555  ABC transporter related  38.25 
 
 
584 aa  404  1e-111  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.530108  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>