44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_1464 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_1464  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 
296 aa  607  1e-173  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.111167  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0030  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.29 
 
 
295 aa  66.2  0.0000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2811  tetratricopeptide TPR_2  24.81 
 
 
782 aa  60.8  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0319314  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1020  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  23.94 
 
 
1441 aa  55.1  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0894  TPR-related region  23.98 
 
 
364 aa  55.5  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000179778 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  25.29 
 
 
2145 aa  53.5  0.000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.74 
 
 
991 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.77 
 
 
1022 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4173  diguanylate cyclase  27.82 
 
 
630 aa  50.4  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.53 
 
 
2240 aa  50.4  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.34 
 
 
988 aa  48.9  0.00009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4285  adenylate/guanylate cyclase  26.29 
 
 
1204 aa  48.5  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2671  tetratricopeptide TPR_2  22.04 
 
 
828 aa  48.1  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.290452  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1546  Protein of unknown function DUF835  25.91 
 
 
1147 aa  47.8  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.933731  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24191  hypothetical protein  26.32 
 
 
545 aa  47.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  23.05 
 
 
3145 aa  48.1  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3903  tetratricopeptide TPR_2  23.46 
 
 
809 aa  47.4  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.85 
 
 
1056 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1405  TPR repeat-containing protein  29.41 
 
 
300 aa  47.8  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.028548  normal  0.280947 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3806  TPR repeat-containing protein  23.56 
 
 
600 aa  47  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0299153 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0963  hypothetical protein  22.88 
 
 
1550 aa  46.6  0.0005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.424465 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23981  hypothetical protein  26.61 
 
 
587 aa  46.6  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0755  TPR repeat-containing protein  25.12 
 
 
421 aa  46.6  0.0005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3384  transcriptional regulator, SARP family  29.49 
 
 
1020 aa  46.6  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.799293 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1172  Tetratricopeptide domain protein  26.9 
 
 
1005 aa  45.8  0.0009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6475  hypothetical protein  34.78 
 
 
476 aa  45.4  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.53 
 
 
818 aa  45.4  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  26.45 
 
 
1979 aa  45.4  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6624  signal transduction histidine kinase, LytS  26.85 
 
 
650 aa  44.7  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.11241 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  26.7 
 
 
1737 aa  44.7  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25 
 
 
784 aa  44.3  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.09 
 
 
2741 aa  44.3  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1518  TPR repeat-containing protein  26.15 
 
 
597 aa  43.9  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00971618 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3586  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.21 
 
 
1077 aa  43.9  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1060  hypothetical protein  34.15 
 
 
384 aa  43.9  0.004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5300  transcriptional regulator, SARP family  25.93 
 
 
1017 aa  43.9  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.706654  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43095  predicted protein  25.93 
 
 
2327 aa  43.1  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.30291  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0462  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.32 
 
 
2741 aa  43.5  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4797  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  25.17 
 
 
1468 aa  43.1  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0229  tetratricopeptide TPR_3  25.6 
 
 
689 aa  43.1  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1257  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.18 
 
 
237 aa  42.4  0.01  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1304  hypothetical protein  30 
 
 
1404 aa  42.4  0.01  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2310  diguanylate cyclase  23.84 
 
 
718 aa  42.4  0.01  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1496  transcriptional regulator, SARP family  22.55 
 
 
1027 aa  42.4  0.01  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.905196  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>