More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0659 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0659  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 212 aa  432  1e-120  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.815067  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0569  Radical SAM domain protein  34.38 
 
 		 220 aa  116  1.9999999999999998e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1450  Radical SAM domain protein  33.48 
 
 		 209 aa  102  4e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4124  radical SAM domain-containing protein  29.2 
 
 		 230 aa  94.7  9e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0862  radical SAM domain-containing protein  38.93 
 
 		 231 aa  93.6  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1332  hypothetical protein  28.3 
 
 		 206 aa  90.9  1e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1392  Radical SAM domain protein  43.12 
 
 		 274 aa  90.9  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1877  radical activating enzyme  29.69 
 
 		 222 aa  90.1  2e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.460246  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2014  radical activating enzyme  30.57 
 
 		 222 aa  89.7  3e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1825  radical activating enzyme  30.3 
 
 		 233 aa  89.4  4e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.40401  normal  0.903036 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2341  Radical SAM domain protein  42.2 
 
 		 280 aa  89  5e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1974  radical SAM domain-containing protein  30.08 
 
 		 210 aa  89  5e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3058  Radical SAM domain protein  41.51 
 
 		 258 aa  89  5e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1617  hypothetical protein  29.25 
 
 		 202 aa  88.2  9e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2960  radical SAM family protein  30.58 
 
 		 248 aa  87.8  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2551  radical activating enzyme  26.64 
 
 		 222 aa  86.7  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.92162  normal  0.0345357 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1100  radical SAM domain-containing protein  29.88 
 
 		 246 aa  85.9  4e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.256897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1959  radical SAM family protein  30.43 
 
 		 235 aa  85.9  5e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3107  radical SAM family protein  29.38 
 
 		 210 aa  85.5  6e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2883  radical SAM domain-containing protein  28.7 
 
 		 222 aa  84  0.000000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.470396  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0267  radical SAM domain-containing protein  32.72 
 
 		 202 aa  83.6  0.000000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.953431  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3374  hypothetical protein  29.46 
 
 		 223 aa  83.6  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1855  radical activating enzyme  29.26 
 
 		 222 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.328449  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3531  hypothetical protein  29.46 
 
 		 223 aa  83.2  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.786232  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2254  radical activating enzyme  29.74 
 
 		 222 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.499803  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2268  radical activating enzyme  29.74 
 
 		 222 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00320351  normal  0.189151 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4540  hypothetical protein  29.74 
 
 		 222 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1917  radical activating enzyme  27.51 
 
 		 222 aa  82.4  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0152798  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2501  radical activating enzyme  27.51 
 
 		 222 aa  82.4  0.000000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2116  radical activating enzyme  29.74 
 
 		 222 aa  82.4  0.000000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.054229  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3084  radical SAM domain protein  28.45 
 
 		 223 aa  82  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.000000000000255818  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3109  radical SAM domain protein  28.88 
 
 		 223 aa  82  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0000108893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3265  radical SAM domain-containing protein  28.45 
 
 		 223 aa  82  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000025013  normal  0.189038 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0978  hypothetical protein  30.29 
 
 		 245 aa  82  0.000000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3148  radical SAM domain-containing protein  28.45 
 
 		 223 aa  82  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000734892  normal  0.311004 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3167  hypothetical protein  28.45 
 
 		 223 aa  82  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000157264  normal  0.548962 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2163  radical activating enzyme  27.51 
 
 		 222 aa  82  0.000000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00224373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2162  radical activating enzyme  29.74 
 
 		 222 aa  81.6  0.000000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.221208  normal  0.837279 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2209  radical SAM domain-containing protein  29.3 
 
 		 202 aa  81.6  0.000000000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02724  radical activating enzyme  30.47 
 
 		 224 aa  81.6  0.000000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0591  Radical SAM domain protein  38.32 
 
 		 258 aa  81.6  0.000000000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1687  Radical SAM domain protein  29.02 
 
 		 208 aa  81.6  0.000000000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7690  hypothetical protein  27.83 
 
 		 235 aa  81.3  0.000000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.273315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1757  radical SAM domain-containing protein  28.57 
 
 		 247 aa  80.9  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0707  Radical SAM domain protein  37.4 
 
 		 227 aa  81.3  0.00000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.654115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2348  radical SAM domain-containing protein  29 
 
 		 222 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0536039  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0935  hypothetical protein  28.02 
 
 		 223 aa  80.1  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000274693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3229  radical SAM domain-containing protein  28.07 
 
 		 223 aa  80.1  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000000624181  normal  0.126781 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02385  hypothetical protein  30.67 
 
 		 216 aa  80.1  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2111  Radical SAM domain protein  28.44 
 
 		 211 aa  80.1  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2058  radical activating enzyme  29.69 
 
 		 222 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00725057  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02622  hypothetical protein  28.02 
 
 		 223 aa  79.7  0.00000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000486823  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0912  conserved hypothetical protein  28.02 
 
 		 223 aa  79.7  0.00000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000203902  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2910  hypothetical protein  28.02 
 
 		 223 aa  79.7  0.00000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000863859  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3099  hypothetical protein  28.02 
 
 		 223 aa  79.3  0.00000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000000109551  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4033  hypothetical protein  28.02 
 
 		 223 aa  79.7  0.00000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000000488158  normal  0.75822 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3080  hypothetical protein  28.02 
 
 		 223 aa  79.7  0.00000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000477114  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2061  radical SAM domain-containing protein  28.02 
 
 		 222 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2049  radical activating enzyme  26.64 
 
 		 222 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.341171  normal  0.258883 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02584  hypothetical protein  28.02 
 
 		 223 aa  79.7  0.00000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000638386  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2918  hypothetical protein  28.02 
 
 		 223 aa  79.7  0.00000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  3.7449199999999994e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1116  hypothetical protein  27.23 
 
 		 205 aa  79  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1319  Radical SAM domain protein  28.17 
 
 		 210 aa  79  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0593  Radical SAM domain protein  28.33 
 
 		 251 aa  78.6  0.00000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1145  radical activating enzyme  27.23 
 
 		 205 aa  78.2  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.723359 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0808  radical SAM domain-containing protein  32.39 
 
 		 223 aa  78.2  0.00000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0634  radical SAM domain-containing protein  33.94 
 
 		 204 aa  78.2  0.00000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003398  queuosine Biosynthesis QueE Radical SAM  29.31 
 
 		 226 aa  77.8  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.593414  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1783  putative organic radical activating protein  33.84 
 
 		 225 aa  77.4  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.644545  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0856  hypothetical protein  27.19 
 
 		 224 aa  77.8  0.0000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0220  hypothetical protein  29.18 
 
 		 223 aa  77.8  0.0000000000001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.56743  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0977  radical SAM domain-containing protein  32.39 
 
 		 223 aa  77  0.0000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3444  radical SAM domain-containing protein  32.39 
 
 		 223 aa  77  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29591  putative organic radical activating protein  29.18 
 
 		 226 aa  76.6  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2236  organic radical activating protein  29.22 
 
 		 205 aa  77  0.0000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2467  radical SAM domain-containing protein  26.42 
 
 		 210 aa  77  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1702  Radical SAM domain protein  36.27 
 
 		 222 aa  77.4  0.0000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.86531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3313  radical SAM domain-containing protein  32.39 
 
 		 223 aa  77  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.566212  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0318  queuosine biosynthesis protein QueE  33.2 
 
 		 233 aa  76.3  0.0000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.321571  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2947  hypothetical protein  25.22 
 
 		 226 aa  75.5  0.0000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.500667  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0822  hypothetical protein  25.73 
 
 		 223 aa  75.1  0.0000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1234  radical SAM domain-containing protein  25.31 
 
 		 246 aa  75.1  0.0000000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2045  radical SAM family protein  28.81 
 
 		 235 aa  74.7  0.0000000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3632  Radical SAM domain protein  26.54 
 
 		 211 aa  74.7  0.0000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.597891 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3844  hypothetical protein  27.71 
 
 		 212 aa  73.9  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.621065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4050  radical SAM family protein  34.71 
 
 		 212 aa  74.3  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19001  putative organic radical activating protein  33.33 
 
 		 225 aa  74.3  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.843472  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0779  Radical SAM domain protein  32.04 
 
 		 223 aa  73.9  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.141038  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0148  radical SAM domain-containing protein  26.17 
 
 		 213 aa  73.9  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1985  radical SAM domain-containing protein  36.89 
 
 		 215 aa  73.9  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2562  Radical SAM domain protein  25.68 
 
 		 210 aa  73.2  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00464069  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1782  organic radical activating enzyme  26.89 
 
 		 216 aa  73.6  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.330721  normal  0.904053 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1396  radical SAM domain protein  28.7 
 
 		 238 aa  73.2  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0288655  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18811  putative organic radical activating protein  31.14 
 
 		 223 aa  72.8  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.533025  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06800  hypothetical protein  30.99 
 
 		 210 aa  73.2  0.000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0516243  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1943  Radical SAM domain protein  31.82 
 
 		 260 aa  73.2  0.000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.228441  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0080  hypothetical protein  27.31 
 
 		 207 aa  72.8  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.557073  normal  0.147757 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0635  radical SAM domain-containing protein  30.77 
 
 		 195 aa  72.8  0.000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2832  radical SAM family protein  33.04 
 
 		 234 aa  72.8  0.000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.641503  normal  0.195448 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1280  radical SAM domain-containing protein  33.98 
 
 		 226 aa  72.4  0.000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.281332  normal  0.805859 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>