23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_1458 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008309  HS_1458  lipopolysaccharide choline phosphotransferase  100 
 
 		 266 aa  552  1e-156  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0727  lipopolysaccharide cholinephosphotransferase  52.41 
 
 		 218 aa  192  4e-48  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.257586  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0917  licD family protein  37.73 
 
 		 270 aa  147  2.0000000000000003e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000119843  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1418  polysaccharide biosynthesis protein, putative  30.71 
 
 		 274 aa  118  9e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.792739  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05850  LPS biosynthesis protein  29.11 
 
 		 290 aa  118  9e-26  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000114788 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2420  LicD family protein  26.67 
 
 		 277 aa  112  9e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.295674  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0589  LicD family protein  34.55 
 
 		 266 aa  109  5e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000965792  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2589  LicD family protein  30.29 
 
 		 284 aa  109  6e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05870  LPS biosynthesis protein  29.37 
 
 		 284 aa  105  7e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000878073 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05940  LPS biosynthesis protein  30.97 
 
 		 290 aa  103  3e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0032299  hitchhiker  0.000000000543053 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1000  LicD family protein  29.15 
 
 		 307 aa  94.7  1e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1004  LicD family protein  29.48 
 
 		 281 aa  93.6  3e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0988018  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2035  LicD family protein  28.18 
 
 		 286 aa  92.8  5e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.450228  normal  0.03368 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14490  LPS biosynthesis protein  26.69 
 
 		 540 aa  91.3  2e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.71965  normal  0.345378 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12330  LPS biosynthesis protein  26.13 
 
 		 322 aa  86.7  3e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.806434  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2033  LicD family protein  27.24 
 
 		 284 aa  85.1  0.000000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.412766  hitchhiker  0.000530756 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2440  LicD family protein  35.16 
 
 		 273 aa  83.6  0.000000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12380  LPS biosynthesis protein  27.41 
 
 		 261 aa  82.8  0.000000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14540  LPS biosynthesis protein  27.5 
 
 		 602 aa  76.6  0.0000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.18006 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1746  LicD family protein  27.24 
 
 		 319 aa  72.4  0.000000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1186  LICD Protein Family  31.45 
 
 		 384 aa  69.7  0.00000000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1016  LicD family protein  47.06 
 
 		 315 aa  65.5  0.0000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1750  LPS biosynthesis protein-like protein  24.81 
 
 		 338 aa  59.7  0.00000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>