99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0498 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0733  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  100 
 
 		 144 aa  304  3e-82  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00269425 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0498  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  100 
 
 		 144 aa  304  3e-82  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.115067 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1137  cytidine deaminase  67.15 
 
 		 137 aa  202  2e-51  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000157258  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5437  hypothetical protein  38.38 
 
 		 100 aa  70.9  0.000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.491914  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0009  cytidine deaminase  34.85 
 
 		 126 aa  68.6  0.00000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.080456  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0331  cytidine deaminase  32.14 
 
 		 131 aa  60.1  0.00000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0042  cytidine deaminase  30.91 
 
 		 131 aa  58.5  0.00000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0173738 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0045  cytidine deaminase  30.36 
 
 		 127 aa  58.5  0.00000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.51644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1469  cytidine deaminase  32.14 
 
 		 136 aa  57.8  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0427929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3099  cytidine deaminase  27.43 
 
 		 138 aa  57.8  0.00000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.296617 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1794  cytidine deaminase  34.26 
 
 		 133 aa  55.5  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000395488  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0011  cytidine deaminase  29.1 
 
 		 127 aa  53.9  0.0000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0081  cytidine deaminase  33.64 
 
 		 132 aa  53.9  0.0000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000436242  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_11146  cytidine deaminase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G02770)  28.83 
 
 		 138 aa  53.1  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.152404  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1085  cytidine deaminase  29.91 
 
 		 138 aa  53.1  0.000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0025  cytidine deaminase  36.75 
 
 		 134 aa  53.5  0.000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00901236 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1777  cytidine deaminase  33.65 
 
 		 135 aa  53.5  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.172773  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3340  cytidine deaminase  32.38 
 
 		 152 aa  52.8  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.568351 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0407  cytidine deaminase  33.64 
 
 		 135 aa  52.4  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0081  cytidine deaminase  32.08 
 
 		 132 aa  52.4  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000394049  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4174  cytidine deaminase  31.37 
 
 		 129 aa  52.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4804  hypothetical protein  27.83 
 
 		 141 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.558671  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4462  cytidine deaminase  31.37 
 
 		 129 aa  52  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.238856  normal  0.450546 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2234  cytidine deaminase  29.09 
 
 		 125 aa  50.8  0.000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.561027  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0622  cytidine deaminase  24.24 
 
 		 131 aa  50.1  0.00001  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0443  cytidine deaminase  32.41 
 
 		 129 aa  48.9  0.00002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.617897  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6907  hypothetical protein  27.78 
 
 		 139 aa  48.9  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.373552 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0657  cytidine deaminase  33.33 
 
 		 128 aa  48.5  0.00003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.589099 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4587  cytidine deaminase  29.82 
 
 		 135 aa  48.5  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00127227  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1562  cytidine deaminase  30.19 
 
 		 132 aa  48.5  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.546128  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1324  cytidine deaminase  33.33 
 
 		 131 aa  48.5  0.00003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0294653  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0786  cytidine deaminase  29.73 
 
 		 137 aa  48.5  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4270  hypothetical protein  26.09 
 
 		 141 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.372249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1068  cytidine deaminase  29.63 
 
 		 128 aa  48.5  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1507  cytidine deaminase  29.36 
 
 		 134 aa  48.1  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.492073  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1393  cytidine deaminase  32.11 
 
 		 125 aa  48.1  0.00004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.245306  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3635  cytidine deaminase  28.57 
 
 		 142 aa  47.8  0.00005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.825648 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl466  cytidine deaminase  26.09 
 
 		 134 aa  47  0.00009  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.063527  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1291  hypothetical protein  24.35 
 
 		 141 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4168  hypothetical protein  25.22 
 
 		 142 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.250781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1621  cytidine deaminase  27.52 
 
 		 135 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.339634  normal  0.293483 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1931  cytidine deaminase  34.62 
 
 		 136 aa  45.8  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2480  cytidine deaminase  30.48 
 
 		 142 aa  46.2  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.548526  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1838  cytidine deaminase  30.77 
 
 		 144 aa  45.8  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01844  Cytidine deaminase  27.62 
 
 		 157 aa  45.4  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.595326  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0855  cytidine deaminase  28.7 
 
 		 132 aa  45.1  0.0003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1835  cytidine deaminase  25 
 
 		 137 aa  45.1  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4399  cytidine deaminase  27.43 
 
 		 135 aa  44.7  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0739  cytidine deaminase  26.36 
 
 		 137 aa  45.1  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1508  cytidine deaminase  30.91 
 
 		 129 aa  44.7  0.0005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1390  hypothetical protein  27.45 
 
 		 131 aa  44.7  0.0005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0510  cytidine deaminase  25.93 
 
 		 142 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2657  cytidine deaminase  30.1 
 
 		 135 aa  44.3  0.0006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.697109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0763  cytidine deaminase, homotetrameric  31.9 
 
 		 151 aa  44.3  0.0006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.499923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4191  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  24.81 
 
 		 147 aa  44.3  0.0006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0968  cytidine deaminase  35.19 
 
 		 132 aa  43.9  0.0007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.365904  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1606  hypothetical protein  27.45 
 
 		 131 aa  43.9  0.0008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2536  cytidine deaminase  33.94 
 
 		 136 aa  43.9  0.0008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.289649  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0636  cytidine deaminase  29.73 
 
 		 139 aa  43.1  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00119957 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0953  cytidine deaminase  32.69 
 
 		 129 aa  43.1  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.234119  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0262  cytidine deaminase  28.43 
 
 		 130 aa  42.4  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4396  cytidine deaminase  26.67 
 
 		 136 aa  42  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.300415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1626  cytidine deaminase  29.03 
 
 		 134 aa  42.7  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1660  cytidine deaminase  29.03 
 
 		 134 aa  42.7  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0790  cytidine deaminase  26.92 
 
 		 132 aa  42.7  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000426322  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1214  cytidine deaminase  27.52 
 
 		 133 aa  42.4  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000278122 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1988  cytidine deaminase  31.68 
 
 		 132 aa  42.4  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1969  cytidine deaminase  26.42 
 
 		 139 aa  42.4  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4525  cytidine deaminase  27.36 
 
 		 132 aa  41.6  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00234494  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4200  cytidine deaminase  27.36 
 
 		 132 aa  41.6  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0101414  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4048  cytidine deaminase  27.36 
 
 		 132 aa  41.6  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000101486  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4038  cytidine deaminase  27.36 
 
 		 132 aa  41.6  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000126639  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0145  cytidine deaminase  30.43 
 
 		 145 aa  42  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4323  cytidine deaminase  27.36 
 
 		 132 aa  41.6  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.09373e-57 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4434  cytidine deaminase  27.36 
 
 		 132 aa  41.6  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000171056  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2273  cytidine deaminase  30.69 
 
 		 132 aa  42  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl143  cytidine deaminase  27.18 
 
 		 135 aa  42  0.003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00772481  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12520  cytidine deaminase  32.71 
 
 		 133 aa  41.6  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1828  cytidine deaminase  28.03 
 
 		 132 aa  41.6  0.004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3945  cytidine deaminase  25.86 
 
 		 136 aa  41.2  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.98121  hitchhiker  0.00191304 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1356  cytidine deaminase  29.2 
 
 		 132 aa  41.2  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.796052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0578  cytidine deaminase  25.47 
 
 		 129 aa  41.2  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4152  cytidine deaminase  27.36 
 
 		 132 aa  41.2  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000232365  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4276  cytidine deaminase  29.7 
 
 		 139 aa  40.8  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4381  cytidine deaminase  27.36 
 
 		 132 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00104367  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1706  cytidine deaminase  28.7 
 
 		 131 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000355072  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1735  cytidine deaminase  28.7 
 
 		 131 aa  40.8  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000541202  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1895  cytidine deaminase  28.7 
 
 		 131 aa  40.8  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000738736  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1757  cytidine deaminase  28.7 
 
 		 131 aa  40.8  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000261998  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1930  cytidine deaminase  28.7 
 
 		 131 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  8.03425e-50 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25720  cytidine deaminase  26.32 
 
 		 136 aa  40.8  0.007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.362555 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2005  cytidine deaminase  28.7 
 
 		 131 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000237527  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0939  cytidine deaminase  28.21 
 
 		 133 aa  40.4  0.008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.743414  normal  0.851216 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0818  cytidine deaminase  26.42 
 
 		 132 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000529216  decreased coverage  5.58138e-23 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0599  cytidine deaminase  33.33 
 
 		 129 aa  40.4  0.009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1203  cytidine deaminase  27.62 
 
 		 138 aa  40.4  0.009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0287032  normal  0.397725 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13346  cytidine deaminase  29.52 
 
 		 133 aa  40.4  0.009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.19995 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1978  cytidine deaminase  29.41 
 
 		 131 aa  40  0.01  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00152916  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2422  cytidine deaminase  27.52 
 
 		 159 aa  40  0.01  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>