More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_4073 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_4073  methionine-R-sulfoxide reductase  100 
 
 		 177 aa  374  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000057525  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1981  methionine-R-sulfoxide reductase  66.2 
 
 		 185 aa  221  6e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4070  methionine-R-sulfoxide reductase  68.18 
 
 		 132 aa  207  6e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000043688 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0263  methionine-R-sulfoxide reductase  60.28 
 
 		 180 aa  203  1e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0248  methionine-R-sulfoxide reductase  60.28 
 
 		 180 aa  201  4e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000151138 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3026  methionine-R-sulfoxide reductase  65.15 
 
 		 133 aa  200  8e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2110  protein-methionine-S-oxide reductase  63.08 
 
 		 136 aa  194  4.0000000000000005e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0327209  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5464  methionine-R-sulfoxide reductase  61.83 
 
 		 135 aa  184  8e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4217  methionine sulfoxide reductase B  62.5 
 
 		 148 aa  183  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.117492 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0660  protein-methionine-S-oxide reductase  61.11 
 
 		 138 aa  180  9.000000000000001e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.7252  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2190  methionine sulfoxide reductase B  60.16 
 
 		 140 aa  178  4e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.443162 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1027  methionine sulfoxide reductase B  64.23 
 
 		 161 aa  176  2e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.197554  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1817  methionine sulfoxide reductase B  56.25 
 
 		 154 aa  175  3e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.706847  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0743  methionine sulfoxide reductase B  56.39 
 
 		 142 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.881647 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1426  methionine-R-sulfoxide reductase  56.39 
 
 		 136 aa  172  1.9999999999999998e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.118161  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2786  protein-methionine-S-oxide reductase  56.06 
 
 		 134 aa  170  1e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2571  methionine-R-sulfoxide reductase  61.29 
 
 		 183 aa  170  1e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0863  methionine-R-sulfoxide reductase  57.14 
 
 		 136 aa  168  4e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.121954  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1612  methionine-R-sulfoxide reductase  60.32 
 
 		 130 aa  167  5e-41  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0472443  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2336  methionine-R-sulfoxide reductase  54.26 
 
 		 134 aa  167  6e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0845  methionine-R-sulfoxide reductase  57.48 
 
 		 139 aa  167  6e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.686886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5232  methionine-R-sulfoxide reductase  56.59 
 
 		 131 aa  167  8e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.299585 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2451  PilB-related protein  55.73 
 
 		 137 aa  166  1e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1643  methionine-R-sulfoxide reductase  53.33 
 
 		 146 aa  166  1e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.240011  normal  0.30587 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0083  methionine-R-sulfoxide reductase  54.96 
 
 		 189 aa  165  2e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.532406 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2964  methionine sulfoxide reductase B  52.14 
 
 		 156 aa  165  2.9999999999999998e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2658  methionine-R-sulfoxide reductase  55.38 
 
 		 133 aa  165  2.9999999999999998e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.173178  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2257  methionine sulfoxide reductase B  57.03 
 
 		 133 aa  164  4e-40  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.619242 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5431  methionine-R-sulfoxide reductase  54.69 
 
 		 131 aa  163  1.0000000000000001e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.881722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2039  methionine-R-sulfoxide reductase  57.03 
 
 		 131 aa  162  2.0000000000000002e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.122601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2840  methionine-R-sulfoxide reductase  55.2 
 
 		 151 aa  161  3e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.795882 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0423  methionine sulfoxide reductase B  53.91 
 
 		 133 aa  161  4.0000000000000004e-39  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.249651  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0606  methionine-R-sulfoxide reductase  59.06 
 
 		 163 aa  161  5.0000000000000005e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.875626 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2728  protein-methionine-S-oxide reductase  55.04 
 
 		 135 aa  160  7e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0705  methionine-R-sulfoxide reductase  55.2 
 
 		 137 aa  160  1e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.906192  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1499  methionine-R-sulfoxide reductase  53.79 
 
 		 159 aa  160  1e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1128  methionine sulfoxide reductase B  55.81 
 
 		 137 aa  159  2e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2492  methionine-R-sulfoxide reductase  54.76 
 
 		 167 aa  159  2e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.177324  normal  0.194691 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1889  methionine sulfoxide reductase B  55.12 
 
 		 132 aa  159  3e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1105  methionine sulfoxide reductase B  52.34 
 
 		 132 aa  159  3e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00407533  normal  0.774201 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1350  protein-methionine-S-oxide reductase  53.38 
 
 		 133 aa  158  5e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00000258473  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4765  methionine-R-sulfoxide reductase  54.62 
 
 		 131 aa  157  6e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.220604  normal  0.0308681 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2740  protein-methionine-S-oxide reductase  53.12 
 
 		 167 aa  157  1e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.726229  normal  0.194587 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0697  methionine-R-sulfoxide reductase  50.76 
 
 		 135 aa  156  1e-37  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0013  protein-methionine-S-oxide reductase  55.56 
 
 		 130 aa  156  2e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15440  methionine sulfoxide reductase B  53.54 
 
 		 133 aa  155  3e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.141406  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1275  methionine-R-sulfoxide reductase  55.91 
 
 		 134 aa  155  3e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.285091  normal  0.167765 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2617  peptide methionine sulfoxide reductase  55.91 
 
 		 134 aa  155  3e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0781659  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2521  methionine sulfoxide reductase B  57.14 
 
 		 131 aa  155  3e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0744717  normal  0.336049 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1855  methionine sulfoxide reductase B  55.47 
 
 		 136 aa  155  3e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27510  methionine sulfoxide reductase B  55.56 
 
 		 132 aa  155  4e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.156355  normal  0.0230939 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0822  methionine-R-sulfoxide reductase  52.67 
 
 		 154 aa  154  5.0000000000000005e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000300416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2328  methionine sulfoxide reductase B  54.76 
 
 		 132 aa  154  7e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.516522  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5395  methionine-R-sulfoxide reductase  55.2 
 
 		 174 aa  154  7e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.074958  normal  0.0409442 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0645  methionine-R-sulfoxide reductase  54.03 
 
 		 161 aa  153  1e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0307048 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1595  methionine-R-sulfoxide reductase  52.8 
 
 		 134 aa  153  1e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.470278  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3833  methionine sulfoxide reductase B  53.91 
 
 		 137 aa  153  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.459209 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0159  methionine-R-sulfoxide reductase  54.69 
 
 		 164 aa  153  1e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1498  methionine sulfoxide reductase B  54.03 
 
 		 128 aa  153  1e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.0060677  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3799  methionine-R-sulfoxide reductase  44.91 
 
 		 161 aa  153  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1482  methionine sulfoxide reductase B  54.33 
 
 		 133 aa  152  2e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2552  methionine-R-sulfoxide reductase  55.65 
 
 		 148 aa  152  2e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.417643  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4176  methionine-R-sulfoxide reductase  49.23 
 
 		 142 aa  152  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000115767  normal  0.515653 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1796  methionine sulfoxide reductase B  53.91 
 
 		 164 aa  153  2e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0102  peptide methionine sulfoxide reductase  47.56 
 
 		 381 aa  152  2e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2424  methionine-R-sulfoxide reductase  56.25 
 
 		 158 aa  152  2.9999999999999998e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.072868 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2960  methionine sulfoxide reductase B  52.24 
 
 		 137 aa  152  2.9999999999999998e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.165913  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1457  methionine sulfoxide reductase B  53.23 
 
 		 128 aa  152  2.9999999999999998e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00518905  hitchhiker  0.000051953 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0325  methionine-S-oxide reductase  54.84 
 
 		 150 aa  152  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.231035  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0557  peptide methionine sulfoxide reductase  50.69 
 
 		 394 aa  152  2.9999999999999998e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.921771  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3504  methionine-R-sulfoxide reductase  46.71 
 
 		 160 aa  152  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1747  methionine sulfoxide reductase B  53.23 
 
 		 128 aa  151  4e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0864529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3054  methionine-R-sulfoxide reductase  54.55 
 
 		 155 aa  151  4e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000457549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4459  methionine sulfoxide reductase B  53.12 
 
 		 165 aa  151  5e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0924782  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0998  methionine sulfoxide reductase B  49.22 
 
 		 137 aa  151  5e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2816  methionine-R-sulfoxide reductase  52.31 
 
 		 159 aa  151  5e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.10011 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1873  methionine sulfoxide reductase B  51.97 
 
 		 131 aa  150  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0253598  normal  0.296694 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0853  methionine-R-sulfoxide reductase  55.2 
 
 		 138 aa  150  5.9999999999999996e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0880  methionine-R-sulfoxide reductase  55.2 
 
 		 138 aa  150  5.9999999999999996e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.286149  normal  0.443314 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3842  methionine sulfoxide reductase B  51.97 
 
 		 131 aa  150  7e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0499897  normal  0.348854 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1165  protein-methionine-S-oxide reductase  53.08 
 
 		 134 aa  150  7e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000102663 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1777  methionine sulfoxide reductase B  52.8 
 
 		 166 aa  150  8e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0348  methionine-R-sulfoxide reductase  53.6 
 
 		 140 aa  150  8.999999999999999e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0336  methionine-R-sulfoxide reductase  53.6 
 
 		 140 aa  150  1e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.834226  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03048  methionine sulfoxide reductase B  51.54 
 
 		 166 aa  150  1e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1518  methionine sulfoxide reductase B  56.35 
 
 		 137 aa  150  1e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3328  protein-methionine-S-oxide reductase  53.97 
 
 		 135 aa  150  1e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002909  peptide methionine sulfoxide reductase msrB  51.54 
 
 		 136 aa  150  1e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000132728  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1663  methionine sulfoxide reductase B  52.34 
 
 		 165 aa  150  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.623127  normal  0.248193 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3073  methionine-R-sulfoxide reductase  50 
 
 		 155 aa  150  1e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.833991 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1448  methionine sulfoxide reductase B  51.97 
 
 		 131 aa  149  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.03902  normal  0.443778 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2329  methionine sulfoxide reductase B  48.44 
 
 		 142 aa  149  2e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03241  putative methionine sulfoxide reductase family protein  56.3 
 
 		 144 aa  149  3e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3821  methionine sulfoxide reductase B  52.38 
 
 		 165 aa  149  3e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.631036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1459  methionine sulfoxide reductase B  54.76 
 
 		 137 aa  148  3e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0872  methionine sulfoxide reductase B  48.44 
 
 		 137 aa  148  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.69535  normal  0.693986 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1907  methionine-R-sulfoxide reductase  53.49 
 
 		 134 aa  148  4e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.954215 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2777  methionine-R-sulfoxide reductase  49.61 
 
 		 140 aa  148  4e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5425  methionine-R-sulfoxide reductase  50.4 
 
 		 174 aa  148  5e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1835  methionine-R-sulfoxide reductase  50 
 
 		 136 aa  147  6e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.462521 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>