More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3764 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0642  signal recognition particle protein  84.29 
 
 		 452 aa  782    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0127185  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3432  signal recognition particle protein  84.86 
 
 		 453 aa  748    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000327935  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2872  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  85.4 
 
 		 452 aa  790    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107321  hitchhiker  0.00000141752 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2449  signal recognition particle protein  79.09 
 
 		 463 aa  719    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000152943  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3764  signal recognition particle protein  100 
 
 		 449 aa  904    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000380679  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3494  signal recognition particle protein  84.86 
 
 		 453 aa  747    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.28336e-32 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1099  signal recognition particle protein  81.38 
 
 		 453 aa  729    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000944997  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2225  signal recognition particle protein  67.04 
 
 		 451 aa  625  1e-178  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000252662  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3304  signal recognition particle protein  63.49 
 
 		 492 aa  554  1e-156  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2310  signal recognition particle protein  60.88 
 
 		 443 aa  531  1e-149  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0985246  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1498  signal recognition particle protein  61.11 
 
 		 448 aa  526  1e-148  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.225316  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2141  signal recognition particle protein  59.5 
 
 		 508 aa  521  1e-146  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1804  signal recognition particle protein  60.94 
 
 		 512 aa  519  1e-146  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0197886  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0966  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  60.42 
 
 		 447 aa  520  1e-146  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000570112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2996  signal recognition particle protein  61.7 
 
 		 454 aa  516  1.0000000000000001e-145  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000641047  normal  0.948328 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3038  signal recognition particle protein  61.7 
 
 		 454 aa  516  1.0000000000000001e-145  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000193458  normal  0.986059 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2888  signal recognition particle protein  60 
 
 		 518 aa  512  1e-144  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.403346 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1100  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  59.3 
 
 		 512 aa  512  1e-144  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1713  signal recognition particle protein  57.81 
 
 		 446 aa  505  9.999999999999999e-143  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000859311  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2056  signal recognition particle protein  57.97 
 
 		 446 aa  508  9.999999999999999e-143  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000690531  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1196  signal recognition particle protein  57.91 
 
 		 449 aa  502  1e-141  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0364721  normal  0.124331 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07290  signal recognition particle protein  58.22 
 
 		 444 aa  502  1e-141  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.3957e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1417  signal recognition particle protein  58.18 
 
 		 445 aa  499  1e-140  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.0000000188375  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2026  signal recognition particle protein  56.84 
 
 		 493 aa  499  1e-140  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000241588  hitchhiker  0.00894206 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1087  signal recognition particle protein  57.78 
 
 		 446 aa  495  1e-139  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000240128  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0770  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  58.27 
 
 		 446 aa  494  9.999999999999999e-139  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000241723  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1978  signal recognition particle protein  58.59 
 
 		 469 aa  494  9.999999999999999e-139  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1321  signal recognition particle protein  56.58 
 
 		 455 aa  492  9.999999999999999e-139  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000465855  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1296  signal recognition particle protein  56.58 
 
 		 455 aa  492  9.999999999999999e-139  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000399025  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0803  signal recognition particle protein  56.8 
 
 		 455 aa  491  1e-137  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000079449  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3887  signal recognition particle protein  57.77 
 
 		 449 aa  489  1e-137  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000347799  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3586  signal recognition particle protein  57.77 
 
 		 449 aa  489  1e-137  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000116729  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3604  signal recognition particle protein  57.77 
 
 		 449 aa  489  1e-137  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000432061  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3859  signal recognition particle protein  57.77 
 
 		 449 aa  489  1e-137  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.8952e-61 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3893  signal recognition particle protein  57.77 
 
 		 449 aa  489  1e-137  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0655  signal recognition particle protein  60.7 
 
 		 452 aa  489  1e-137  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000216081  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0503  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  57.75 
 
 		 462 aa  488  1e-137  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0709  signal recognition particle protein  57.11 
 
 		 448 aa  488  1e-136  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000338232  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3696  signal recognition particle protein  57.54 
 
 		 449 aa  487  1e-136  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000361017  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3944  signal recognition particle protein  57.54 
 
 		 449 aa  488  1e-136  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000995401  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0967  signal recognition particle protein  55.23 
 
 		 443 aa  486  1e-136  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000109658  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3983  signal recognition particle protein  57.54 
 
 		 449 aa  487  1e-136  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000408298  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3761  signal recognition particle protein  56.98 
 
 		 453 aa  488  1e-136  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000277324  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2497  signal recognition particle protein  57.54 
 
 		 449 aa  486  1e-136  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000243009  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3668  signal recognition particle protein  57.31 
 
 		 449 aa  485  1e-136  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000016406  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1299  signal recognition particle protein  57.54 
 
 		 449 aa  488  1e-136  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000157828  unclonable  2.8199000000000005e-25 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0522  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  54.67 
 
 		 450 aa  480  1e-134  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.823996  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2671  signal recognition particle protein  56.25 
 
 		 450 aa  474  1e-132  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000192246  unclonable  0.0000000276763 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1667  signal recognition particle protein  54.26 
 
 		 444 aa  472  1e-132  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000671364  hitchhiker  0.00227852 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4622  signal recognition particle protein  53.01 
 
 		 449 aa  468  1.0000000000000001e-131  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000364274  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1027  signal recognition particle protein  53.97 
 
 		 450 aa  470  1.0000000000000001e-131  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.588339  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3035  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  53.12 
 
 		 454 aa  468  1.0000000000000001e-131  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.296692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2754  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  52.6 
 
 		 443 aa  469  1.0000000000000001e-131  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1368  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  56.4 
 
 		 447 aa  470  1.0000000000000001e-131  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000018858  normal  0.195447 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0067  signal recognition particle protein  52.36 
 
 		 446 aa  467  9.999999999999999e-131  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1286  signal recognition particle protein  54.02 
 
 		 444 aa  465  9.999999999999999e-131  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.524326  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02499  Signal Recognition Particle (SRP) component with 4.5S RNA (ffs)  53.56 
 
 		 453 aa  462  1e-129  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0363313  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1064  signal recognition particle protein  53.56 
 
 		 453 aa  462  1e-129  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000203805  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2762  signal recognition particle protein  53.56 
 
 		 453 aa  464  1e-129  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00925068  normal  0.0680462 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3849  signal recognition particle protein  53.56 
 
 		 453 aa  462  1e-129  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000605639  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02463  hypothetical protein  53.56 
 
 		 453 aa  462  1e-129  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0259356  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0244  signal recognition particle protein  53.92 
 
 		 450 aa  462  1e-129  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.450094  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1670  signal recognition particle protein  52.93 
 
 		 458 aa  462  1e-129  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1073  signal recognition particle protein  53.56 
 
 		 453 aa  462  1e-129  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0286434  normal  0.0192406 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2769  signal recognition particle protein  53.56 
 
 		 453 aa  462  1e-129  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000211534  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2999  signal recognition particle protein  53.56 
 
 		 453 aa  462  1e-129  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000534435  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2894  signal recognition particle protein  53.56 
 
 		 453 aa  462  1e-129  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000003333  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39570  signal recognition particle protein  54.08 
 
 		 458 aa  461  9.999999999999999e-129  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.224172  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1228  signal recognition particle protein  54.55 
 
 		 433 aa  461  9.999999999999999e-129  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000301134  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2891  signal recognition particle protein  53.56 
 
 		 453 aa  461  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0766211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2873  signal recognition particle protein  53.56 
 
 		 453 aa  461  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.110714  normal  0.0858138 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3091  signal recognition particle protein  54.57 
 
 		 453 aa  459  9.999999999999999e-129  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.113189  normal  0.0737969 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2893  signal recognition particle protein  53.56 
 
 		 453 aa  461  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0469323  normal  0.518118 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3005  signal recognition particle protein  53.56 
 
 		 453 aa  461  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.242955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1227  signal recognition particle protein  54.55 
 
 		 433 aa  460  9.999999999999999e-129  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000121808  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1327  signal recognition particle protein  52.28 
 
 		 441 aa  461  9.999999999999999e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.609194 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2823  signal recognition particle protein  53.56 
 
 		 453 aa  461  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00851471  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4758  signal recognition particle protein  52.71 
 
 		 439 aa  458  9.999999999999999e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.259533  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1253  signal recognition particle protein  52.77 
 
 		 457 aa  456  1e-127  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000049947  hitchhiker  0.0000752283 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2477  signal recognition particle protein  51.63 
 
 		 458 aa  456  1e-127  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0998  signal recognition particle protein  53.33 
 
 		 459 aa  456  1e-127  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0384  signal recognition particle protein  52.22 
 
 		 451 aa  457  1e-127  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05915  signal recognition particle protein  54.74 
 
 		 442 aa  456  1e-127  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.414308  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1351  signal recognition particle protein  50.54 
 
 		 479 aa  457  1e-127  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0023431  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0777  signal recognition particle protein  53.49 
 
 		 441 aa  456  1e-127  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2856  signal recognition particle protein  51.63 
 
 		 458 aa  456  1e-127  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2921  signal recognition particle protein  53.22 
 
 		 457 aa  456  1e-127  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00726192  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1304  signal recognition particle protein  55.48 
 
 		 445 aa  457  1e-127  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000911633  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3683  signal recognition particle protein  53.47 
 
 		 444 aa  456  1e-127  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0888  signal recognition particle protein  53.21 
 
 		 457 aa  457  1e-127  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000142989  normal  0.373446 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0884  signal recognition particle protein  53.9 
 
 		 453 aa  451  1.0000000000000001e-126  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.138728  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3365  signal recognition particle protein  53.9 
 
 		 453 aa  452  1.0000000000000001e-126  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.089536  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1155  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  52.01 
 
 		 481 aa  452  1.0000000000000001e-126  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000491114  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2373  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  53.9 
 
 		 447 aa  454  1.0000000000000001e-126  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.377557 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3230  signal recognition particle protein  53.9 
 
 		 453 aa  451  1.0000000000000001e-126  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0218227  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1062  signal recognition particle protein  52.33 
 
 		 457 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0147174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1178  signal recognition particle protein  53.44 
 
 		 456 aa  454  1.0000000000000001e-126  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.520274  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1158  signal recognition particle protein  52.77 
 
 		 457 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000642448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1399  signal recognition particle protein  53.2 
 
 		 449 aa  449  1e-125  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000293601  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0990  signal recognition particle protein  53.21 
 
 		 453 aa  450  1e-125  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00945365  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>