38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3473 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_3473  peptidoglycan binding domain-containing protein  100 
 
 		 580 aa  1144    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4328  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.91 
 
 		 568 aa  139  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0238879  normal  0.546066 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8552  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.55 
 
 		 587 aa  120  4.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4331  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  40.45 
 
 		 440 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8187  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.36 
 
 		 593 aa  105  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2962  hypothetical protein  29.86 
 
 		 547 aa  85.5  0.000000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.41173  hitchhiker  0.00173595 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0814  hypothetical protein  38.24 
 
 		 420 aa  79.7  0.0000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0429314  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0225  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  36.75 
 
 		 605 aa  79  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.354634 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27870  hypothetical protein  38.12 
 
 		 515 aa  77  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.287743  normal  0.874552 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2495  hypothetical protein  30.63 
 
 		 543 aa  75.9  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0373  hypothetical protein  29.03 
 
 		 454 aa  75.9  0.000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.417823  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0306  hypothetical protein  36.36 
 
 		 401 aa  72.8  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0478  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  42.86 
 
 		 471 aa  72.8  0.00000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.298298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0082  hypothetical protein  30.59 
 
 		 391 aa  70.9  0.00000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.619134 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4786  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  37.04 
 
 		 376 aa  70.1  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0569189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3158  hypothetical protein  33.97 
 
 		 542 aa  67.4  0.0000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09470  putative peptidoglycan binding protein  29.3 
 
 		 335 aa  65.9  0.000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.265495  normal  0.614505 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0027  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  30.26 
 
 		 367 aa  65.1  0.000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5941  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  29.5 
 
 		 381 aa  63.5  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25300  membrane-fusion protein  34.15 
 
 		 379 aa  63.2  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.344012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0084  peptidoglycan binding domain-containing protein  27.82 
 
 		 408 aa  58.9  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1588  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  33.1 
 
 		 359 aa  57.8  0.0000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0248929  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3175  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  41.18 
 
 		 363 aa  55.8  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1030  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  28.87 
 
 		 410 aa  55.1  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.13226 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0582  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  26.83 
 
 		 405 aa  53.9  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.246879  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3994  peptidoglycan binding domain-containing protein  48.94 
 
 		 266 aa  49.7  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.552337  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4070  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  30.71 
 
 		 358 aa  47.8  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00672322  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1949  cell wall hydrolase, SleB  43.86 
 
 		 224 aa  47.4  0.0007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000201814  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1812  peptidoglycan binding domain-containing protein  48.98 
 
 		 77 aa  46.2  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00132339  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0344  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  36.23 
 
 		 309 aa  45.8  0.002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3528  peptidoglycan binding domain-containing protein  50 
 
 		 389 aa  45.8  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6252  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.75 
 
 		 386 aa  45.4  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0853  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  30.57 
 
 		 360 aa  45.4  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4725  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  46.3 
 
 		 433 aa  45.4  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4180  peptidoglycan binding domain-containing protein  41.77 
 
 		 414 aa  45.1  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.988623 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4194  peptidoglycan binding domain-containing protein  39.29 
 
 		 528 aa  44.3  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13610  hypothetical protein  32.29 
 
 		 431 aa  44.3  0.007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.470397 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3362  RND family efflux transporter MFP subunit  29.73 
 
 		 358 aa  43.9  0.008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>