72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2474 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_2474  hypothetical protein  100 
 
 		 551 aa  1145    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.671413  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0171  sulfurtransferase DndC  63.66 
 
 		 507 aa  634  1e-180  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2209  hypothetical protein  54.75 
 
 		 566 aa  539  9.999999999999999e-153  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.184763 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2458  hypothetical protein  53.21 
 
 		 538 aa  536  1e-151  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0199548 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2401  hypothetical protein  54.51 
 
 		 528 aa  534  1e-150  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1932  hypothetical protein  53.96 
 
 		 518 aa  523  1e-147  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0230474  normal  0.0642464 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4840  hypothetical protein  55.09 
 
 		 541 aa  520  1e-146  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.567316 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0739  hypothetical protein  47.86 
 
 		 496 aa  455  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.25742  normal  0.1584 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0011  hypothetical protein  48.31 
 
 		 484 aa  432  1e-120  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0359  hypothetical protein  44.96 
 
 		 487 aa  411  1e-113  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.296452  normal  0.0315828 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1368  hypothetical protein  45.09 
 
 		 486 aa  394  1e-108  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.871064 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4572  hypothetical protein  46.19 
 
 		 495 aa  392  1e-107  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00813276  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2306  hypothetical protein  38.32 
 
 		 588 aa  327  4.0000000000000003e-88  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.816445  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0471  hypothetical protein  38.83 
 
 		 544 aa  312  1e-83  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.565409  normal  0.314219 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0833  hypothetical protein  35.99 
 
 		 522 aa  306  6e-82  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0620  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  37.57 
 
 		 378 aa  233  7.000000000000001e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2950  3'-phosphoadenosine 5'-phosphosulfate sulfotransferase  37.23 
 
 		 391 aa  231  2e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.000917196  normal  0.689261 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1300  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  30.85 
 
 		 342 aa  167  4e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0038  phosphoadenosine phosphosulfate reductase family protein  27.81 
 
 		 590 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000866534 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0104  hypothetical protein  27.81 
 
 		 600 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.149062  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0061  phosphoadenosine phosphosulfate reductase family protein  27.81 
 
 		 310 aa  140  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2353  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  29.18 
 
 		 335 aa  138  3.0000000000000003e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0021  hypothetical protein  25.91 
 
 		 663 aa  110  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.347972  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0317  hypothetical protein  28.32 
 
 		 607 aa  105  2e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2713  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  29.1 
 
 		 803 aa  103  1e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.92017 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5041  hypothetical protein  31.9 
 
 		 632 aa  102  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0110707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1053  hypothetical protein  29.96 
 
 		 574 aa  101  4e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0944363  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6191  hypothetical protein  30.34 
 
 		 597 aa  96.7  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.450588 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4334  hypothetical protein  30.77 
 
 		 598 aa  95.9  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4327  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  29.54 
 
 		 612 aa  95.9  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4980  hypothetical protein  30.55 
 
 		 604 aa  94  6e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.519167  hitchhiker  0.00845932 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6782  hypothetical protein  30.19 
 
 		 600 aa  92  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0703339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0129  hypothetical protein  30.22 
 
 		 817 aa  92.4  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5337  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  29.09 
 
 		 608 aa  90.1  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0127085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1110  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  29.29 
 
 		 392 aa  86.3  0.000000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00714375  hitchhiker  0.00000984633 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6014  3'-phosphoadenosine 5'-phosphosulfate sulfotransferase (PAPS reductase)/FAD synthetase  28.42 
 
 		 597 aa  84.3  0.000000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.605416  normal  1 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0022  hypothetical protein  22.15 
 
 		 388 aa  73.9  0.000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0523508  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5743  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  28.26 
 
 		 419 aa  70.9  0.00000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.613269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2060  hypothetical protein  28.21 
 
 		 594 aa  69.3  0.0000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.124935 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1596  hypothetical protein  28.87 
 
 		 594 aa  67  0.0000000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2578  hypothetical protein  26.03 
 
 		 466 aa  65.9  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1263  hypothetical protein  29.47 
 
 		 464 aa  65.5  0.000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0437521  normal  0.232729 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1725  hypothetical protein  28.93 
 
 		 491 aa  64.3  0.000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.830403  normal  0.95658 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2713  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  24.44 
 
 		 334 aa  63.9  0.000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2089  hypothetical protein  28.02 
 
 		 469 aa  63.5  0.000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1809  hypothetical protein  25.32 
 
 		 592 aa  62.4  0.00000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000370304 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1153  hypothetical protein  28.31 
 
 		 469 aa  62.4  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1327  hypothetical protein  24.6 
 
 		 667 aa  62  0.00000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0410  hypothetical protein  27.83 
 
 		 472 aa  60.8  0.00000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0165126  hitchhiker  0.000394368 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1195  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  25 
 
 		 580 aa  60.5  0.00000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.500722  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0665  hypothetical protein  26.14 
 
 		 614 aa  57.8  0.0000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.545372  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0559  hypothetical protein  23.35 
 
 		 634 aa  57.4  0.0000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4362  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  28.28 
 
 		 531 aa  57.4  0.0000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.178305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1929  hypothetical protein  25.97 
 
 		 633 aa  57.4  0.0000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.986915  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0827  hypothetical protein  26.29 
 
 		 588 aa  57  0.0000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2943  hypothetical protein  25.94 
 
 		 796 aa  54.3  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00440971 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0943  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  28.88 
 
 		 421 aa  50.4  0.00008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1122  hypothetical protein  28.49 
 
 		 879 aa  50.1  0.0001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0188  hypothetical protein  24.87 
 
 		 502 aa  49.3  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.882321 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0981  hypothetical protein  24.91 
 
 		 428 aa  49.3  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.534482  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1714  hypothetical protein  23.83 
 
 		 512 aa  48.1  0.0004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.414906  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0748  hypothetical protein  22.78 
 
 		 503 aa  48.1  0.0004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2091  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  25.49 
 
 		 298 aa  47.8  0.0005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1343  hypothetical protein  23.63 
 
 		 441 aa  47.4  0.0007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0248  hypothetical protein  25 
 
 		 491 aa  47  0.0008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1177  hypothetical protein  27.23 
 
 		 509 aa  47  0.001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.112818  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1726  hypothetical protein  23.83 
 
 		 428 aa  46.2  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.422238  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0991  hypothetical protein  24.02 
 
 		 428 aa  45.8  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.536257  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6216  hypothetical protein  28.19 
 
 		 496 aa  45.4  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.621118 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0954  hypothetical protein  24.46 
 
 		 428 aa  44.3  0.006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.438042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2219  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  25.81 
 
 		 885 aa  43.9  0.007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.911418 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4585  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  26 
 
 		 279 aa  43.5  0.009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>