215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4469 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_4469  carbonic anhydrase  100 
 
 
164 aa  332  1e-90  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4424  carbonic anhydrase  53.09 
 
 
163 aa  178  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2270  carbonic anhydrase  50.92 
 
 
163 aa  176  9e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.397664  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3921  carbonic anhydrase  51.53 
 
 
163 aa  174  5e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.348754  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3995  carbonic anhydrase  51.53 
 
 
163 aa  174  5e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.00734118  normal  0.767989 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3936  carbonic anhydrase  51.53 
 
 
163 aa  174  5e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.186955 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3284  carbonic anhydrase  52.17 
 
 
163 aa  173  7e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35320  carbonic anhydrase  51.53 
 
 
163 aa  172  1.9999999999999998e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0672264  normal  0.58662 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0344  carbonic anhydrase  50.92 
 
 
163 aa  170  1e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.677491  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0216  carbonic anhydrase  49.07 
 
 
162 aa  167  8e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.202706  normal  0.234797 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11310  hypothetical protein  49.07 
 
 
163 aa  166  1e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2353  carbonic anhydrase  54.55 
 
 
174 aa  166  2e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.157586  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2947  carbonic anhydrase  51.55 
 
 
164 aa  164  5.9999999999999996e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.609065  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2774  carbonic anhydrase  49.69 
 
 
162 aa  162  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0708  carbonic anhydrase  57.24 
 
 
205 aa  157  5e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4355  carbonic anhydrase  50 
 
 
163 aa  155  2e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2393  carbonic anhydrase  50 
 
 
164 aa  154  6e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.442285  normal  0.447491 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0861  carbonic anhydrase  46.34 
 
 
181 aa  153  1e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.677611 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5906  carbonic anhydrase  52.55 
 
 
192 aa  145  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.46464  normal  0.626114 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2645  carbonic anhydrase  48.15 
 
 
163 aa  143  1e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.334819 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57799  predicted protein  43.83 
 
 
162 aa  127  7.000000000000001e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.339062  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1800  hypothetical protein  40.85 
 
 
165 aa  124  7e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.157179  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0111  carbonic anhydrase-related protein  40.74 
 
 
165 aa  121  4e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.159855  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1601  carbonic anhydrase  41.82 
 
 
165 aa  120  6e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.972482 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1333  carbonic anhydrase  43.29 
 
 
165 aa  119  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.454871  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1310  carbonic anhydrase  40.72 
 
 
165 aa  118  3.9999999999999996e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1891  carbonic anhydrase  38.92 
 
 
193 aa  113  1.0000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3687  carbonic anhydrase  41.3 
 
 
141 aa  105  3e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.127217  normal  0.010333 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7083  putative carbonate hydratase  37.42 
 
 
164 aa  100  8e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0910  carbonic anhydrase  35.03 
 
 
197 aa  99  2e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.308845  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2834  carbonic anhydrase  36.02 
 
 
198 aa  99.4  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.130165  normal  0.144825 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0910  carbonic anhydrase, putative  36.41 
 
 
192 aa  97.8  5e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.165973  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1341  carbonic anhydrase  35.14 
 
 
193 aa  97.4  6e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.587905  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1431  carbonic anhydrase  34.97 
 
 
194 aa  95.5  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.193943  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1027  carbonic anhydrase  37.87 
 
 
179 aa  95.5  3e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0168514  normal  0.661784 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2619  carbonic anhydrase, putative  33.7 
 
 
192 aa  94.7  5e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.358215 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1529  carbonic anhydrase  41.35 
 
 
193 aa  93.6  1e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.35811  normal  0.123592 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4023  carbonic anhydrase  38.97 
 
 
134 aa  90.1  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.943502 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0579  carbonic anhydrase  33.33 
 
 
150 aa  87.4  7e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1375  carbonic anhydrase  33.77 
 
 
157 aa  86.7  1e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.333229  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3304  carbonic anhydrase  35.62 
 
 
175 aa  85.9  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0609  carbonic anhydrase  45.05 
 
 
150 aa  85.9  2e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0207  carbonic anhydrase  48.72 
 
 
172 aa  84  8e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.329295  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0544  carbonic anhydrase  33.11 
 
 
150 aa  84  8e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0618446  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0294  carbonic anhydrase  34.44 
 
 
150 aa  82.4  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.202596  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1464  carbonic anhydrase  31.69 
 
 
180 aa  82  0.000000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2952  carbonic anhydrase  32.14 
 
 
166 aa  80.1  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.437593  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2390  carbonic anhydrase  33.12 
 
 
166 aa  78.2  0.00000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0603112  normal  0.371663 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3273  carbonic anhydrase  36.99 
 
 
189 aa  75.9  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.694792  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2132  carbonic anhydrase, putative  32.52 
 
 
167 aa  75.5  0.0000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1672  carbonic anhydrase  35.82 
 
 
179 aa  75.9  0.0000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0022086 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2035  carbonic anhydrase  45.12 
 
 
90 aa  73.2  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1887  carbonic anhydrase  31.18 
 
 
180 aa  71.6  0.000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2322  carbonic anhydrase  31.18 
 
 
180 aa  70.9  0.000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3320  carbonic anhydrase  30.27 
 
 
180 aa  68.9  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0809  carbonic anhydrase, putative  29.89 
 
 
192 aa  67.8  0.00000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.914808  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0774  carbonic anhydrase  28.42 
 
 
181 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2168  carbonic anhydrase  26.34 
 
 
185 aa  67  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1668  carbonic anhydrase  33.96 
 
 
197 aa  66.6  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0414  carbonic anhydrase  25.56 
 
 
190 aa  62.4  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0397  carbonic anhydrase  30.68 
 
 
190 aa  62.4  0.000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5352  carbonic anhydrase  30.1 
 
 
245 aa  62  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.541632  normal  0.601447 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0410  carbonic anhydrase  24.46 
 
 
186 aa  61.2  0.000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4911  carbonic anhydrase  30.94 
 
 
193 aa  60.5  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0014  carbonate dehydratase  31.61 
 
 
193 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4948  carbonic anhydrase  26.78 
 
 
187 aa  58.5  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4933  putative carbonic anhydrase, prokaryotic type  26.78 
 
 
187 aa  58.2  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4689  carbonic anhydrase  26.78 
 
 
187 aa  58.2  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4527  carbonic anhydrase; carbonate dehydratase  26.78 
 
 
187 aa  58.2  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4546  carbonic anhydrase; carbonate dehydratase  26.78 
 
 
187 aa  58.2  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5049  carbonic anhydrase  26.78 
 
 
187 aa  58.2  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4919  putative carbonic anhydrase, prokaryotic type  26.78 
 
 
187 aa  58.2  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4912  putative carbonic anhydrase, prokaryotic type  26.78 
 
 
187 aa  58.2  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0752  hypothetical protein  27.15 
 
 
768 aa  57.8  0.00000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0734  hypothetical protein  27.15 
 
 
768 aa  57.8  0.00000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6172  carbonic anhydrase  29.52 
 
 
180 aa  57.8  0.00000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0885188  decreased coverage  0.000818733 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0790  carbonic anhydrase  28.5 
 
 
234 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.518522 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2753  carbonic anhydrase  29.57 
 
 
236 aa  56.6  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1254  carbonic anhydrase  31.64 
 
 
180 aa  56.2  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000271417  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1186  carbonic anhydrase  31.64 
 
 
180 aa  56.2  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0321  putative carbonic anhydrase, prokaryotic type  26.23 
 
 
187 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1166  carbonic anhydrase  28.25 
 
 
180 aa  56.6  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.991497 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1125  carbonic anhydrase  31.64 
 
 
180 aa  55.5  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4620  carbonic anhydrase  26.56 
 
 
234 aa  55.1  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2003  carbonic anhydrase  25.53 
 
 
256 aa  54.7  0.0000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.000744018  normal  0.230248 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4373  carbonic anhydrase  29.8 
 
 
180 aa  54.7  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0784956 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4628  carbonic anhydrase  27.74 
 
 
187 aa  54.3  0.0000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3696  carbonic anhydrase  31.29 
 
 
251 aa  53.1  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2767  carbonic anhydrase  27.17 
 
 
182 aa  52.8  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0526  carbonic anhydrase  25.26 
 
 
235 aa  52.8  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00212922 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3463  carbonic anhydrase  25.97 
 
 
187 aa  52  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2143  hypothetical protein  37.7 
 
 
208 aa  51.6  0.000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2118  hypothetical protein  37.7 
 
 
208 aa  51.6  0.000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2031  carbonic anhydrase  31.25 
 
 
291 aa  52  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0949457  normal  0.0961352 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0867  carbonic anhydrase  28.27 
 
 
235 aa  51.6  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0728812  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0361  carbonic anhydrase  38.71 
 
 
236 aa  51.6  0.000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.738606  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1257  putative carbonic anhydrase precursor  29.47 
 
 
242 aa  51.2  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4310  carbonic anhydrase  30.3 
 
 
232 aa  50.8  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000873696  normal  0.0127245 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4248  carbonic anhydrase  30.3 
 
 
232 aa  50.8  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20500  carbonic anhydrase  26.94 
 
 
204 aa  50.1  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.196424  normal  0.646859 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>