47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1610 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_1610  protein of unknown function DUF1486  100 
 
 		 146 aa  295  2e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.692563  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1179  protein of unknown function DUF1486  51.49 
 
 		 153 aa  145  2.0000000000000003e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1595  hypothetical protein  30.15 
 
 		 138 aa  72.8  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000510897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3272  hypothetical protein  34.33 
 
 		 133 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1820  hypothetical protein  30.53 
 
 		 136 aa  58.2  0.00000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.394206  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3131  hypothetical protein  28.79 
 
 		 135 aa  55.5  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.437849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4153  hypothetical protein  29.6 
 
 		 138 aa  55.1  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.870281  normal  0.17015 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1039  protein of unknown function DUF1486  33.08 
 
 		 144 aa  53.9  0.0000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0997  hypothetical protein  34.31 
 
 		 132 aa  53.5  0.0000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.954295  hitchhiker  0.000000182894 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0894  hypothetical protein  32.85 
 
 		 132 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0933  hypothetical protein  32.85 
 
 		 132 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4457  hypothetical protein  30.66 
 
 		 132 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00222547 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0723  hypothetical protein  30.4 
 
 		 147 aa  51.2  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00486014 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2926  hypothetical protein  32.03 
 
 		 141 aa  48.9  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2875  hypothetical protein  34.13 
 
 		 133 aa  48.1  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.191047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2666  protein of unknown function DUF1486  42.86 
 
 		 142 aa  48.1  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2636  protein of unknown function DUF1486  31.67 
 
 		 128 aa  47.4  0.00007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000287228  hitchhiker  0.00453298 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1644  hypothetical protein  32.77 
 
 		 139 aa  45.4  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.25271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0629  hypothetical protein  30.4 
 
 		 133 aa  45.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.91146  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4712  protein of unknown function DUF1486  29.41 
 
 		 139 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.719641 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5286  hypothetical protein  31.96 
 
 		 137 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5540  protein of unknown function DUF1486  25.56 
 
 		 138 aa  45.1  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2281  hypothetical protein  30.4 
 
 		 134 aa  44.3  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.30011 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3328  hypothetical protein  36.07 
 
 		 153 aa  44.3  0.0006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0918311  normal  0.125783 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3560  hypothetical protein  30.16 
 
 		 131 aa  44.3  0.0006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.549553  normal  0.183463 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4914  hypothetical protein  37.29 
 
 		 137 aa  43.9  0.0008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.208327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1042  hypothetical protein  32.28 
 
 		 141 aa  43.5  0.0009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.141033  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5449  hypothetical protein  26.87 
 
 		 155 aa  43.5  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2641  hypothetical protein  29.23 
 
 		 176 aa  42.4  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0292741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1346  hypothetical protein  36.8 
 
 		 147 aa  42.4  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.199001  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0316  protein of unknown function DUF1486  29.32 
 
 		 138 aa  42.4  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4728  hypothetical protein  31.82 
 
 		 134 aa  42.4  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.467083  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3219  protein of unknown function DUF1486  41.3 
 
 		 148 aa  42  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000247367  hitchhiker  0.000405951 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0776  protein of unknown function DUF1486  28.57 
 
 		 174 aa  42  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.181215 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3428  limonene-1,2-epoxide hydrolase  33.58 
 
 		 139 aa  41.6  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0351  protein of unknown function DUF1486  24.19 
 
 		 145 aa  41.6  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03632  hypothetical protein  30.71 
 
 		 139 aa  42  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2313  hypothetical protein  35.71 
 
 		 145 aa  40.8  0.006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05376  conserved hypothetical protein  38.64 
 
 		 412 aa  40.8  0.006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.964155  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3154  hypothetical protein  40 
 
 		 120 aa  40.4  0.007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.34037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3314  limonene-1,2-epoxide hydrolase  32.5 
 
 		 156 aa  40.8  0.007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.225216 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4925  hypothetical protein  37.78 
 
 		 137 aa  40.4  0.007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.773252  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5607  hypothetical protein  30.16 
 
 		 157 aa  40.4  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.206103  normal  0.841881 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3674  hypothetical protein  30.16 
 
 		 157 aa  40.4  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0168299  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4693  hypothetical protein  30.16 
 
 		 157 aa  40.4  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0146781  normal  0.148088 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1719  protein of unknown function DUF1486  25 
 
 		 152 aa  40.4  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1646  protein of unknown function DUF1486  25 
 
 		 152 aa  40.4  0.009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.081161  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>