More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_3179 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_3179  response regulator receiver domain-containing protein  100 
 
 		 120 aa  237  4e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.164981 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3253  response regulator  90.68 
 
 		 123 aa  194  3e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0406  response regulator receiver protein  75 
 
 		 126 aa  192  1e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0029  response regulator receiver protein  72.88 
 
 		 126 aa  191  2e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3466  response regulator receiver protein  75 
 
 		 125 aa  190  6e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3403  response regulator receiver protein  74.17 
 
 		 124 aa  189  2e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.809384  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0854  response regulator receiver protein  75 
 
 		 124 aa  188  2e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2959  two component signal transduction response regulator  59.17 
 
 		 128 aa  154  6e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.888929  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0187  response regulator receiver protein  50.43 
 
 		 122 aa  113  8.999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.283319  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0458  response regulator receiver protein  43.86 
 
 		 120 aa  110  7.000000000000001e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000275929  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1426  response regulator receiver protein  45.13 
 
 		 118 aa  107  7.000000000000001e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0460  response regulator receiver protein  41.59 
 
 		 119 aa  104  5e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.903697  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3609  response regulator receiver domain-containing protein  45.3 
 
 		 122 aa  100  9e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1423  response regulator receiver protein  44.35 
 
 		 116 aa  96.3  1e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1469  response regulator receiver protein  44.35 
 
 		 116 aa  96.3  1e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1110  response regulator receiver protein  42.86 
 
 		 117 aa  94  6e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1627  response regulator receiver protein  39.66 
 
 		 119 aa  94  7e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2332  response regulator receiver protein  46.36 
 
 		 122 aa  92  2e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2829  response regulator receiver protein  46.36 
 
 		 126 aa  87.8  4e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.597834  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1521  transcriptional regulatory protein OmpR, putative  37.93 
 
 		 241 aa  75.5  0.0000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.675435  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1644  two component transcriptional regulator  37.93 
 
 		 235 aa  75.5  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1472  putative transcriptional regulatory protein OmpR  37.93 
 
 		 241 aa  75.5  0.0000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.830233  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2748  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.13 
 
 		 233 aa  72  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0628  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  39.47 
 
 		 446 aa  72.8  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3011  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.13 
 
 		 233 aa  72  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2142  two component transcriptional regulator  36.97 
 
 		 240 aa  72  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.46457  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1294  DNA-binding response regulator  37.89 
 
 		 180 aa  72  0.000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000125664  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0626  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  38.84 
 
 		 460 aa  72  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0841  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.29 
 
 		 223 aa  71.6  0.000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3323  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  34.82 
 
 		 458 aa  72  0.000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.581416  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2105  two component transcriptional regulator  41.67 
 
 		 253 aa  72  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3546  two component transcriptional regulator  36.36 
 
 		 273 aa  71.2  0.000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.376665  normal  0.686762 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2177  response regulator receiver protein  35.96 
 
 		 120 aa  70.9  0.000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5905  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.44 
 
 		 237 aa  70.5  0.000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2558  two component transcriptional regulator  40.57 
 
 		 239 aa  70.1  0.000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.403313  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2506  sensory box protein/sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  37.04 
 
 		 564 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.92979  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2109  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  36.13 
 
 		 515 aa  70.1  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4779  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  33.05 
 
 		 494 aa  69.7  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2511  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.54 
 
 		 244 aa  70.1  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3222  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  43.21 
 
 		 447 aa  68.9  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0905113 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1878  two component transcriptional regulator  36.52 
 
 		 242 aa  68.6  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.559477 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0581  winged helix family two component transcriptional regulator  36.52 
 
 		 242 aa  68.9  0.00000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.296955  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0558  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.33 
 
 		 237 aa  69.3  0.00000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4207  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.52 
 
 		 247 aa  69.3  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1234  response regulator receiver protein  35.29 
 
 		 122 aa  68.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1264  response regulator receiver protein  35.29 
 
 		 122 aa  68.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0578681  hitchhiker  0.00155192 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5055  two component transcriptional regulator  38.6 
 
 		 223 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3926  two component transcriptional regulator  38.32 
 
 		 254 aa  67.8  0.00000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1618  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis family  34.48 
 
 		 486 aa  67.8  0.00000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3941  two component transcriptional regulator  38.32 
 
 		 254 aa  67.8  0.00000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0990172 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4000  two component transcriptional regulator  38.32 
 
 		 254 aa  67.8  0.00000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5379  DNA-binding response regulator  38.6 
 
 		 223 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4944  DNA-binding response regulator  38.6 
 
 		 223 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0109954  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1115  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.39 
 
 		 243 aa  67.4  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0950226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1453  two component transcriptional regulator  37.39 
 
 		 244 aa  67.4  0.00000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.952418  normal  0.0249242 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01481  two-component response regulator  35.09 
 
 		 248 aa  67.4  0.00000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5433  DNA-binding response regulator  38.6 
 
 		 223 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0005  response regulator  37.07 
 
 		 243 aa  67.4  0.00000000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.201532  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4959  DNA-binding response regulator  38.6 
 
 		 223 aa  67.4  0.00000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000160223  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5353  DNA-binding response regulator  38.6 
 
 		 223 aa  67.4  0.00000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1106  response regulator receiver protein  35.79 
 
 		 180 aa  67.4  0.00000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0674112  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3029  two component transcriptional regulator  36.07 
 
 		 238 aa  67  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.452516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0644  two component transcriptional regulator  32.71 
 
 		 222 aa  67.4  0.00000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.553024  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1078  DNA-binding response regulator  35.79 
 
 		 180 aa  67  0.00000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000000000063084  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3201  response regulator receiver domain-containing protein  36.75 
 
 		 143 aa  67  0.00000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0954  two component transcriptional regulator  36.52 
 
 		 243 aa  67  0.00000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0817018 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1312  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 455 aa  66.6  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.502008  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2786  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  35.85 
 
 		 480 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.543097  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1299  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.13 
 
 		 242 aa  66.6  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0317425  normal  0.569469 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2302  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.65 
 
 		 243 aa  66.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1498  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 500 aa  66.2  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0754  response regulator receiver domain-containing protein  34.15 
 
 		 120 aa  66.6  0.0000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8872  response regulator receiver protein  38.26 
 
 		 234 aa  66.2  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.347509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3620  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.67 
 
 		 239 aa  66.2  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0253056  normal  0.477246 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2353  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.65 
 
 		 243 aa  66.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0794558  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1837  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis family  34.75 
 
 		 480 aa  66.6  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3477  two component transcriptional regulator  35.04 
 
 		 261 aa  66.2  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1669  two component LuxR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 221 aa  66.6  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1797  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  34.48 
 
 		 461 aa  66.2  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.774224  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0956  DNA-binding response regulator  32.79 
 
 		 223 aa  66.6  0.0000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.504019  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3695  response regulator receiver  35.29 
 
 		 236 aa  66.6  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.795948  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2242  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  35.04 
 
 		 464 aa  65.9  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.719582 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2863  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis Family  35.34 
 
 		 480 aa  65.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1510  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 448 aa  65.5  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5113  DNA-binding response regulator  37.72 
 
 		 223 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00211772  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4070  nitrogen metabolism transcriptional regulator NtrC  35.34 
 
 		 480 aa  66.2  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.131979  normal  0.446618 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2280  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  31.93 
 
 		 453 aa  66.2  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.620123 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2365  two component signal transduction response regulator  37.8 
 
 		 575 aa  65.5  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5504  DNA-binding response regulator  37.72 
 
 		 223 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0252  response regulator receiver protein  39.02 
 
 		 239 aa  65.9  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.114255 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2882  nitrogen metabolism transcriptional regulator NtrC  35.34 
 
 		 480 aa  65.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.173418  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0441  two component transcriptional regulator  39.17 
 
 		 245 aa  65.9  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.270311  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2578  nitrogen metabolism transcriptional regulator NtrC  35.34 
 
 		 480 aa  65.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.152448  normal  0.275348 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2135  nitrogen regulation protein NR(I)  34.71 
 
 		 483 aa  65.5  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.13203  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0516  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 468 aa  65.5  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000971097  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2590  nitrogen metabolism transcriptional regulator NtrC  35.34 
 
 		 480 aa  65.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.858566  normal  0.0152229 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4508  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.93 
 
 		 231 aa  65.9  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1016  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.71 
 
 		 243 aa  66.2  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0585  DNA-binding response regulator  34.17 
 
 		 230 aa  65.9  0.0000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00125793  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1737  two component transcriptional regulator  34.21 
 
 		 243 aa  65.9  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.151372  normal  0.336316 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>