181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2881 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_2881  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase-like  100 
 
 		 370 aa  761    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00275572 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3383  glycosyl transferase family 9  27.91 
 
 		 313 aa  97.1  4e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3797  glycosyl transferase family protein  30.55 
 
 		 343 aa  95.1  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1607  putative ADP-heptose--lipopolysaccharide heptosyltransferase II  22.87 
 
 		 299 aa  94.7  3e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.376535  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18890  Three-deoxy-D-manno-octulosonic-acid transferase domain protein  26.82 
 
 		 779 aa  80.9  0.00000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000185158  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0800  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  24.66 
 
 		 353 aa  67  0.0000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1060  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  24.59 
 
 		 334 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.845943 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1264  heptosyl transferase I  24.23 
 
 		 350 aa  62  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2100  glycosyl transferase family protein  23.65 
 
 		 361 aa  61.6  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18880  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  22.35 
 
 		 348 aa  61.2  0.00000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0347069  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0860  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  24.86 
 
 		 339 aa  61.2  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0670  ADP-heptoselps heptosyltransferase  26.12 
 
 		 365 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.374437  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0577  heptosyltransferase family protein  25.35 
 
 		 365 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.902815  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0552  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  24.85 
 
 		 516 aa  60.5  0.00000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1968  putative heptosyltransferase (O-antigen related)  25.84 
 
 		 388 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.78963  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0582  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  29.48 
 
 		 325 aa  60.5  0.00000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000000000638797  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0389  glycosyl transferase family 9  21.82 
 
 		 330 aa  60.1  0.00000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1977  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase, putative  25.63 
 
 		 365 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3421  putative lipopolysaccharide heptosyltransferase-1  22.33 
 
 		 334 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2616  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  21.41 
 
 		 346 aa  59.3  0.00000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2224  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  27.3 
 
 		 340 aa  58.5  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.112899  normal  0.0907149 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0849  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  25.24 
 
 		 332 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.727875  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0170  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  22.97 
 
 		 361 aa  57.4  0.0000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.792363  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1601  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  29.31 
 
 		 358 aa  57.4  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0507  glycosyl transferase family protein  21.64 
 
 		 406 aa  57.4  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1955  glycosyl transferase family 9  23.8 
 
 		 354 aa  57  0.0000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1258  glycosyl transferase family 9  25.28 
 
 		 471 aa  56.6  0.0000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0861  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  24.92 
 
 		 332 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.288239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3700  putative lipopolysaccharide heptosyltransferase-1  24.44 
 
 		 333 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.603484 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4092  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  25.25 
 
 		 340 aa  55.5  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.102262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4830  glycosyl transferase family protein  23.86 
 
 		 363 aa  55.5  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.244067  hitchhiker  0.0000484932 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0351  glycosyl transferase family protein  26.35 
 
 		 328 aa  55.5  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0921  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  24.84 
 
 		 333 aa  54.7  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0661  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  23.81 
 
 		 336 aa  54.7  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.796134 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0576  glycosyl transferase family protein  22.14 
 
 		 331 aa  54.3  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1490  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  25.31 
 
 		 355 aa  54.7  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0863183  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4362  glycosyl transferase family protein  26.09 
 
 		 368 aa  54.7  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.03216 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0772  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  23.65 
 
 		 359 aa  53.9  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0949  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  23.81 
 
 		 332 aa  53.9  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17200  glycosyl transferase family 9  24.65 
 
 		 360 aa  53.9  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3215  glycosyl transferase family protein  23.1 
 
 		 347 aa  53.9  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0114  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  23.9 
 
 		 367 aa  53.5  0.000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2266  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  24.76 
 
 		 380 aa  53.1  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.370229  normal  0.206331 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3404  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  23.4 
 
 		 351 aa  52.8  0.000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2795  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  21.97 
 
 		 332 aa  52.8  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3025  heptosyltransferase family protein  25.22 
 
 		 517 aa  52.4  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2700  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  21.97 
 
 		 332 aa  52.8  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.257964  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3406  glycosyl transferase family 9  25.57 
 
 		 337 aa  52.4  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3949  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  24.66 
 
 		 361 aa  52.8  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0353  glycosyl transferase family protein  27.85 
 
 		 357 aa  52.8  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2514  glycosyl transferase family protein  22.68 
 
 		 333 aa  52.8  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.566705  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0692  lipopolysaccharide heptosyltransferase protein  26.42 
 
 		 332 aa  52  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00185807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1263  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  23.58 
 
 		 343 aa  52  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0510  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  23.81 
 
 		 332 aa  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4147  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  30.08 
 
 		 354 aa  51.6  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0989  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  23.81 
 
 		 332 aa  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0259349  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0063  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  30.08 
 
 		 354 aa  52  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.877737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0069  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  30.08 
 
 		 354 aa  51.6  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.270694  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2715  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  24.29 
 
 		 363 aa  51.2  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.902664  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2496  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  25.22 
 
 		 357 aa  51.2  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2614  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  21.45 
 
 		 332 aa  50.8  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.82358  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4375  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  20.38 
 
 		 356 aa  50.4  0.00005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0746  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  45.83 
 
 		 357 aa  50.4  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3141  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  25.08 
 
 		 355 aa  50.1  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001794  ADP-heptose--lipooligosaccharide heptosyltransferase II  26.53 
 
 		 352 aa  50.1  0.00006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.578647  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3118  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  25.08 
 
 		 355 aa  50.1  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.145361  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0370  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  24.85 
 
 		 352 aa  50.1  0.00007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.381359 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4371  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  24.67 
 
 		 327 aa  49.7  0.00007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3770  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  28.07 
 
 		 351 aa  49.7  0.00007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.242011  normal  0.536434 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0567  glycosyl transferase family 9  25.95 
 
 		 362 aa  50.1  0.00007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4036  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  31.58 
 
 		 348 aa  49.7  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3910  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  31.58 
 
 		 348 aa  49.7  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0446452 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0372  glycosyl transferase family protein  22.56 
 
 		 369 aa  49.7  0.00008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3929  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  31.58 
 
 		 348 aa  49.7  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2713  lipopolysaccharide heptosyltransferase-1, putative  22.88 
 
 		 349 aa  49.7  0.00009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3991  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  31.58 
 
 		 348 aa  49.7  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3082  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  25 
 
 		 331 aa  49.7  0.00009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4097  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  31.58 
 
 		 348 aa  49.7  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3947  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  30.7 
 
 		 350 aa  49.3  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0342  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  24.39 
 
 		 352 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.826178 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0152  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  22.38 
 
 		 367 aa  49.3  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1613  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.5 
 
 		 358 aa  49.3  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.938574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1411  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25 
 
 		 299 aa  49.3  0.0001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2642  family 9 glycosyl transferase  22.9 
 
 		 343 aa  48.9  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3977  glycosyl transferase family protein  27.17 
 
 		 376 aa  48.9  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.67849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0116  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  31.3 
 
 		 348 aa  48.9  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0367  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  24.39 
 
 		 352 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03478  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  25.17 
 
 		 326 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00734996  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0085  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  29.57 
 
 		 348 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000038978  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2190  heptosyltransferase I  25 
 
 		 331 aa  48.1  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.362399  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03428  hypothetical protein  29.57 
 
 		 348 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000123646  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4993  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  29.57 
 
 		 348 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000211589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3958  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  24.75 
 
 		 323 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0259947  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4721  glycosyl transferase family protein  27.89 
 
 		 318 aa  48.1  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0089  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  29.57 
 
 		 348 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000834595  normal  0.156713 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2063  heptosyltransferase I  25 
 
 		 331 aa  48.1  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0184643  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03429  hypothetical protein  24.41 
 
 		 300 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00616403  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3831  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  29.57 
 
 		 348 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000276456  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4123  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  29.57 
 
 		 348 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0437858  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4826  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  27.64 
 
 		 348 aa  48.5  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.290967  hitchhiker  0.000199841 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>