More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2204 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007517  Gmet_2204  enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 
263 aa  535  1e-151  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00482519  normal  0.0288404 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2097  enoyl-CoA hydratase  33.96 
 
 
257 aa  141  9.999999999999999e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00356109  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2184  enoyl-CoA hydratase  33.58 
 
 
257 aa  139  3.9999999999999997e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.182901  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0715  enoyl-CoA hydratase  33.21 
 
 
257 aa  138  1e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000436418  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2866  short chain enoyl-CoA hydratase  35 
 
 
257 aa  136  4e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.18512  normal  0.106284 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2850  enoyl-CoA hydratase  36.4 
 
 
258 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  unclonable  0.00000000000104318  normal  0.652493 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4172  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.46 
 
 
258 aa  132  6e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.863442  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11088  enoyl-CoA hydratase  33.46 
 
 
257 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0399052  normal  0.611468 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1545  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.89 
 
 
258 aa  130  3e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0882  short chain enoyl-CoA hydratase  35.5 
 
 
259 aa  129  4.0000000000000003e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.533532 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2899  enoyl-CoA hydratase  34.87 
 
 
258 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000000596096  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1450  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.35 
 
 
256 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.290494  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2195  short chain enoyl-CoA hydratase  29.51 
 
 
257 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000647858  hitchhiker  0.00875803 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0717  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37 
 
 
258 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3030  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.8 
 
 
257 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.045049 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3574  enoyl-CoA hydratase  35.06 
 
 
257 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000415637 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3454  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.46 
 
 
257 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.73615  normal  0.177072 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1843  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.69 
 
 
257 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0607617  normal  0.0948943 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0090  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  35.47 
 
 
258 aa  127  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3557  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.05 
 
 
259 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.203643  normal  0.505075 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2662  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.71 
 
 
259 aa  126  4.0000000000000003e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2217  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.31 
 
 
257 aa  125  5e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.47616  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3521  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.31 
 
 
257 aa  125  5e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.759702  normal  0.0494202 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1738  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.09 
 
 
259 aa  125  5e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0269497 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.23 
 
 
259 aa  124  1e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1036  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.24 
 
 
258 aa  124  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2135  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.01 
 
 
260 aa  124  2e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.322719 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1908  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.61 
 
 
259 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.74 
 
 
260 aa  124  2e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.655694  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4101  enoyl-CoA hydratase  31.58 
 
 
257 aa  123  2e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2014  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.16 
 
 
259 aa  123  3e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.162316  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3370  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 
258 aa  123  3e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.67 
 
 
266 aa  123  4e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3005  short chain enoyl-CoA hydratase  36.68 
 
 
259 aa  123  4e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.717917 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  34.51 
 
 
259 aa  123  4e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4211  short chain enoyl-CoA hydratase  33.58 
 
 
258 aa  122  4e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4231  enoyl-CoA hydratase  32.82 
 
 
257 aa  122  4e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.89202 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4156  enoyl-CoA hydratase  32.82 
 
 
257 aa  122  4e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4387  enoyl-CoA hydratase  32.82 
 
 
257 aa  122  4e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3308  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.2 
 
 
256 aa  122  5e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.795882 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.49 
 
 
268 aa  122  5e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0239  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.63 
 
 
258 aa  122  5e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3485  enoyl-CoA hydratase  34.87 
 
 
258 aa  122  6e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.00000000302611  hitchhiker  0.000530427 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3162  enoyl-CoA hydratase  33.33 
 
 
258 aa  122  6e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000276465  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3030  short chain enoyl-CoA hydratase  33.72 
 
 
258 aa  122  6e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.390398 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3661  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.18 
 
 
258 aa  122  7e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.57083  hitchhiker  9.492269999999999e-21 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0471  enoyl-CoA hydratase  35.25 
 
 
258 aa  122  7e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000928124  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2872  enoyl-CoA hydratase  33.83 
 
 
258 aa  121  9.999999999999999e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  unclonable  0.000000338858  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3801  short chain enoyl-CoA hydratase  33.47 
 
 
258 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0161017  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2561  enoyl-CoA hydratase  34.48 
 
 
258 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000238691  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0449  enoyl-CoA hydratase  34.87 
 
 
258 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000000595981  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0474  enoyl-CoA hydratase  34.87 
 
 
258 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  unclonable  0.0000000000253276  normal  0.535209 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0544  enoyl-CoA hydratase  34.48 
 
 
258 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000000181699  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0544  enoyl-CoA hydratase  34.87 
 
 
258 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  unclonable  0.0000000212345  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3544  enoyl-CoA hydratase  34.87 
 
 
258 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  unclonable  0.00000000000159011  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3563  enoyl-CoA hydratase  34.87 
 
 
258 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000000063446  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0632  enoyl-CoA hydratase  34.87 
 
 
258 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000040968  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1899  enoyl-CoA hydratase  34.87 
 
 
258 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00000141088  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0930  enoyl-CoA hydratase  34.87 
 
 
258 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000000286464  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3571  enoyl-CoA hydratase  34.87 
 
 
264 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00545367  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0009  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.21 
 
 
258 aa  120  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0516  enoyl-CoA hydratase  34.48 
 
 
258 aa  119  3e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000000195576  normal  0.432666 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3163  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  32.79 
 
 
257 aa  120  3e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.236024  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1340  short chain enoyl-CoA hydratase  33.21 
 
 
258 aa  120  3e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1276  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.35 
 
 
257 aa  120  3e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.547187  normal  0.938839 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4640  enoyl-CoA hydratase  34.34 
 
 
257 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.774216  normal  0.012557 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1936  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  33.33 
 
 
260 aa  119  4.9999999999999996e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0876  enoyl-CoA hydratase  32.66 
 
 
258 aa  118  7.999999999999999e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000377465  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1529  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.73 
 
 
259 aa  118  7.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.338476 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1122  short chain enoyl-CoA hydratase  33.2 
 
 
262 aa  118  9e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3114  enoyl-CoA hydratase  34.9 
 
 
258 aa  117  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00000516225  normal  0.042562 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3631  enoyl-CoA hydratase  34.87 
 
 
258 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000000251765  normal  0.928843 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2688  enoyl-CoA hydratase  33.33 
 
 
258 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00000000387614  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4513  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.08 
 
 
258 aa  117  9.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3977  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.67 
 
 
236 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2036  enoyl-CoA hydratase  32.4 
 
 
257 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.26077  normal  0.189819 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3779  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.22 
 
 
260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.834377  normal  0.388082 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2280  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.89 
 
 
259 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0401  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.74 
 
 
260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1573  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.33 
 
 
259 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0661339  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2933  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.13 
 
 
259 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.143661  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0790  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  32.3 
 
 
260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0423  short chain enoyl-CoA hydratase  31.66 
 
 
259 aa  117  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1430  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  32.1 
 
 
255 aa  116  3e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4681  enoyl-CoA hydratase  33.74 
 
 
260 aa  117  3e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.417656  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2252  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.38 
 
 
259 aa  117  3e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3078  short chain enoyl-CoA hydratase  35.63 
 
 
258 aa  117  3e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.13392  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3623  short chain enoyl-CoA hydratase  35.02 
 
 
277 aa  116  3e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0461  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.94 
 
 
259 aa  116  3.9999999999999997e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.773057  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2864  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.6 
 
 
258 aa  116  3.9999999999999997e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2585  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  32.08 
 
 
260 aa  115  6e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1202  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.87 
 
 
261 aa  115  6.9999999999999995e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.255383  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0597  short chain enoyl-CoA hydratase  34.18 
 
 
262 aa  115  7.999999999999999e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00392493  normal 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_55192  hydratase enyol-coa hydratase  31.56 
 
 
269 aa  114  1.0000000000000001e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1548  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.91 
 
 
248 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1713  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.97 
 
 
252 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0176  short chain enoyl-CoA hydratase  33.76 
 
 
257 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.212196  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2128  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.02 
 
 
259 aa  114  2.0000000000000002e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00663938 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2287  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  31.7 
 
 
260 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.867439  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4369  enoyl-CoA hydratase  34.72 
 
 
257 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0156166 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>