More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1099 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_1099  L-alanine dehydrogenase  100 
 
 		 365 aa  717    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.305636  hitchhiker  0.000729988 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2292  alanine dehydrogenase  74.52 
 
 		 365 aa  542  1e-153  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1607  alanine dehydrogenase  66.67 
 
 		 360 aa  478  1e-133  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0106599  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3004  alanine dehydrogenase  63.59 
 
 		 368 aa  421  1e-117  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.914674  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1155  alanine dehydrogenase  55.25 
 
 		 373 aa  384  1e-105  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0320425  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1049  alanine dehydrogenase  51.79 
 
 		 374 aa  369  1e-101  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2087  L-alanine dehydrogenase  51.92 
 
 		 371 aa  370  1e-101  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.193129 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0416  alanine dehydrogenase  53.3 
 
 		 390 aa  368  1e-101  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.533057  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1520  alanine dehydrogenase  52.76 
 
 		 371 aa  369  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0484059  hitchhiker  0.000320344 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2104  L-alanine dehydrogenase  51.92 
 
 		 371 aa  370  1e-101  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.364817  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2355  alanine dehydrogenase  51.65 
 
 		 371 aa  370  1e-101  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00470205 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0022  alanine dehydrogenase  50 
 
 		 372 aa  370  1e-101  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0666  alanine dehydrogenase  51.51 
 
 		 372 aa  369  1e-101  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2150  L-alanine dehydrogenase  51.92 
 
 		 371 aa  370  1e-101  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.093949 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0663  alanine dehydrogenase and pyridine nucleotide transhydrogenase  52.34 
 
 		 367 aa  365  1e-100  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0662308 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2902  alanine dehydrogenase  50.14 
 
 		 376 aa  365  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.877105  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2109  L-alanine dehydrogenase  55.77 
 
 		 370 aa  364  1e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1847  alanine dehydrogenase  55.77 
 
 		 370 aa  364  1e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2462  alanine dehydrogenase  51.53 
 
 		 376 aa  363  2e-99  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000220592  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0543  alanine dehydrogenase  56.27 
 
 		 371 aa  363  2e-99  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3512  alanine dehydrogenase  51.53 
 
 		 377 aa  362  4e-99  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1767  alanine dehydrogenase  55.49 
 
 		 370 aa  361  9e-99  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3131  alanine dehydrogenase  53.35 
 
 		 371 aa  361  1e-98  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0048846  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2565  Alanine dehydrogenase  53.07 
 
 		 371 aa  360  2e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.502023 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6248  alanine dehydrogenase  54.37 
 
 		 368 aa  360  2e-98  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.504475  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4017  alanine dehydrogenase  51.92 
 
 		 371 aa  360  2e-98  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00737201 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2154  alanine dehydrogenase  51.37 
 
 		 371 aa  360  2e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000415402  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2325  alanine dehydrogenase  51.37 
 
 		 371 aa  360  3e-98  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000753672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3222  L-alanine dehydrogenase  52.92 
 
 		 372 aa  360  3e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0766245  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2189  alanine dehydrogenase  51.51 
 
 		 371 aa  359  4e-98  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000553576  normal  0.0277936 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0203  alanine dehydrogenase  49.73 
 
 		 370 aa  358  8e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.193787  normal  0.15922 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2217  alanine dehydrogenase  50.96 
 
 		 371 aa  358  9e-98  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000174643  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12793  secreted L-alanine dehydrogenase ald (40 kDa antigen)  51.1 
 
 		 371 aa  357  1.9999999999999998e-97  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.74924 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1961  L-alanine dehydrogenase  51.1 
 
 		 371 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000331426  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2015  L-alanine dehydrogenase  51.1 
 
 		 371 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000641536  normal  0.0233457 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0822  alanine dehydrogenase  51.24 
 
 		 371 aa  356  3.9999999999999996e-97  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.231531  normal  0.709879 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2048  L-alanine dehydrogenase  51.1 
 
 		 371 aa  356  3.9999999999999996e-97  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000213241  hitchhiker  0.00195154 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2908  L-alanine dehydrogenase  54.55 
 
 		 374 aa  355  5e-97  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1797  L-alanine dehydrogenase  53.44 
 
 		 371 aa  355  8.999999999999999e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.297694 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4430  alanine dehydrogenase  54.02 
 
 		 371 aa  354  1e-96  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.421727  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2068  alanine dehydrogenase  51.78 
 
 		 371 aa  354  1e-96  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000347962  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1131  alanine dehydrogenase  50.27 
 
 		 370 aa  352  5.9999999999999994e-96  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3605  alanine dehydrogenase  49.86 
 
 		 371 aa  352  7e-96  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4054  alanine dehydrogenase  51.79 
 
 		 371 aa  352  8e-96  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1765  alanine dehydrogenase  46.98 
 
 		 372 aa  351  1e-95  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1800  alanine dehydrogenase  46.98 
 
 		 372 aa  351  1e-95  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1770  alanine dehydrogenase  50.14 
 
 		 370 aa  351  1e-95  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000379801  normal  0.0234483 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1930  alanine dehydrogenase  52.47 
 
 		 376 aa  350  2e-95  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.275818  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2013  alanine dehydrogenase  49.73 
 
 		 371 aa  350  2e-95  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000175382  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2485  alanine dehydrogenase  50.69 
 
 		 371 aa  350  2e-95  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000102544  unclonable  0.0000000221603 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3804  alanine dehydrogenase  49.73 
 
 		 366 aa  349  3e-95  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2026  alanine dehydrogenase  51.24 
 
 		 371 aa  350  3e-95  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000138522  unclonable  0.00000166199 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0104  alanine dehydrogenase  48.08 
 
 		 374 aa  350  3e-95  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2170  alanine dehydrogenase  51.5 
 
 		 369 aa  350  3e-95  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.443019  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0622  alanine dehydrogenase  52.51 
 
 		 373 aa  348  6e-95  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2698  alanine dehydrogenase  48.08 
 
 		 373 aa  348  6e-95  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4356  alanine dehydrogenase  50.82 
 
 		 379 aa  348  7e-95  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.80752  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0986  hypothetical protein  51.65 
 
 		 373 aa  348  1e-94  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2235  alanine dehydrogenase  50.41 
 
 		 371 aa  347  1e-94  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000122217  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4385  alanine dehydrogenase  54.55 
 
 		 371 aa  348  1e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4146  alanine dehydrogenase  52.89 
 
 		 371 aa  347  2e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.110875  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3297  alanine dehydrogenase  52.89 
 
 		 371 aa  347  2e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0906  L-alanine dehydrogenase  49.58 
 
 		 367 aa  347  2e-94  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2125  alanine dehydrogenase  50.41 
 
 		 371 aa  347  3e-94  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000258427  normal  0.0430396 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3106  alanine dehydrogenase  48.75 
 
 		 373 aa  346  3e-94  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.625905 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4220  alanine dehydrogenase  52.62 
 
 		 371 aa  345  5e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.757032  normal  0.167036 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0955  hypothetical protein  51.37 
 
 		 373 aa  345  6e-94  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2145  L-alanine dehydrogenase  53.59 
 
 		 371 aa  344  1e-93  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.147893 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3643  alanine dehydrogenase  53.17 
 
 		 371 aa  343  2e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5016  alanine dehydrogenase  51.94 
 
 		 372 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0921868 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1368  alanine dehydrogenase  53.06 
 
 		 372 aa  343  2.9999999999999997e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1914  alanine dehydrogenase  52.79 
 
 		 371 aa  342  4e-93  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.225329  hitchhiker  0.00147074 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1923  alanine dehydrogenase  53.63 
 
 		 371 aa  342  5e-93  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.156676 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2747  alanine dehydrogenase  52.49 
 
 		 367 aa  342  5.999999999999999e-93  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.339433  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4118  alanine dehydrogenase  52.89 
 
 		 371 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3482  alanine dehydrogenase  55.43 
 
 		 361 aa  341  1e-92  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0213091 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3380  alanine dehydrogenase  49.58 
 
 		 377 aa  340  2e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.748696  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1216  alanine dehydrogenase  49.86 
 
 		 369 aa  339  2.9999999999999998e-92  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.605353  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2966  L-alanine dehydrogenase  52.29 
 
 		 371 aa  340  2.9999999999999998e-92  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3009  alanine dehydrogenase  52.89 
 
 		 368 aa  339  4e-92  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.40821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0765  alanine dehydrogenase  47.8 
 
 		 372 aa  339  4e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1557  alanine dehydrogenase  49.59 
 
 		 372 aa  339  4e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1670  L-alanine dehydrogenase  47.4 
 
 		 371 aa  339  5e-92  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.379169  hitchhiker  0.00928718 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1793  alanine dehydrogenase  50.68 
 
 		 378 aa  339  5e-92  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000000626319  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1261  alanine dehydrogenase  49.59 
 
 		 369 aa  338  8e-92  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02114  Alanine dehydrogenase A  54.83 
 
 		 323 aa  337  9.999999999999999e-92  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000532758  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4758  alanine dehydrogenase  46.7 
 
 		 377 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4521  alanine dehydrogenase  46.7 
 
 		 377 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.693738  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4357  alanine dehydrogenase  46.7 
 
 		 377 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1743  alanine dehydrogenase  49.03 
 
 		 371 aa  337  1.9999999999999998e-91  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.359397  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4368  alanine dehydrogenase  46.7 
 
 		 377 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.103175  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0504  alanine dehydrogenase  46.7 
 
 		 377 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2630  alanine dehydrogenase  46.01 
 
 		 370 aa  337  1.9999999999999998e-91  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0012805  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0509  alanine dehydrogenase  46.93 
 
 		 377 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.153171  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4873  alanine dehydrogenase  46.7 
 
 		 377 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4752  alanine dehydrogenase  46.7 
 
 		 377 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000212885  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05750  alanine dehydrogenase  53.44 
 
 		 373 aa  337  2.9999999999999997e-91  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.747804  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19910  L-alanine dehydrogenase  51.59 
 
 		 380 aa  337  2.9999999999999997e-91  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.653017  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2442  alanine dehydrogenase  55.12 
 
 		 372 aa  336  2.9999999999999997e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.4786 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1570  alanine dehydrogenase  53.04 
 
 		 373 aa  336  3.9999999999999995e-91  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.59479  normal  0.391065 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>