168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0455 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007517  Gmet_0455  N-acetylneuraminate synthase  100 
 
 
286 aa  587  1e-166  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1140  polysaccharide biosynthesis protein, putative sialic acid synthase  68.09 
 
 
287 aa  417  9.999999999999999e-116  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0423  N-acetylneuraminate synthase  65.23 
 
 
288 aa  391  1e-108  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1405  N-acetylneuraminic acid synthase domain protein  63.48 
 
 
290 aa  382  1e-105  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2958  N-acetylneuraminic acid synthase domain-containing protein  64.16 
 
 
286 aa  384  1e-105  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3261  polysaccharide biosynthesis related-protein  62.77 
 
 
290 aa  376  1e-103  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0614  N-acetylneuraminic acid synthase domain protein  58.88 
 
 
332 aa  375  1e-103  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.984154  normal  0.288463 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1329  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  35.51 
 
 
358 aa  149  5e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0756  N-acetylneuraminate synthase  35.32 
 
 
337 aa  146  4.0000000000000006e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.556038 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0643  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  37.36 
 
 
342 aa  145  8.000000000000001e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1248  N-acetylneuraminate synthase  38.26 
 
 
348 aa  144  2e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.862744  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0131  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  31.65 
 
 
351 aa  144  2e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    unclonable  0.00000000000000538819 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0960  neuB family protein  35.22 
 
 
379 aa  143  3e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1974  N-acetylneuraminate synthase  37.22 
 
 
305 aa  138  8.999999999999999e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3980  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  35.93 
 
 
350 aa  137  2e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2327  N-acetylneuraminate synthase  36.05 
 
 
350 aa  136  3.0000000000000003e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.463819 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1576  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  33.81 
 
 
350 aa  136  4e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3027  pseudaminic acid synthase  33.98 
 
 
349 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2713  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  35.11 
 
 
310 aa  135  7.000000000000001e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.314547  normal  0.787059 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3318  Sialic acid synthase-like protein  36.98 
 
 
672 aa  135  8e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.785348  normal  0.206825 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1304  N-acetylneuraminate synthase  37.55 
 
 
350 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.583965  normal  0.823534 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3208  pseudaminic acid synthase  34.69 
 
 
351 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2097  neuB protein  35.37 
 
 
352 aa  132  5e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.268336  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0010  n-acetylneuraminate synthase  35.71 
 
 
303 aa  132  5e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.124512  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0420  N-acetylneuraminate synthase  32.59 
 
 
349 aa  132  5e-30  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1161  N-acetyl neuramic acid synthetase NeuB  33.09 
 
 
341 aa  132  6.999999999999999e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16950  N-acetylneuraminate synthase  31.85 
 
 
331 aa  131  1.0000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2641  N-acetylneuraminate synthase  33.21 
 
 
330 aa  130  2.0000000000000002e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0506  N-acetylneuraminate synthase  35.06 
 
 
348 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3113  N-acetylneuraminic acid synthase-like protein  34.42 
 
 
359 aa  130  3e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01550  N-acetylneuraminate synthase  34.87 
 
 
349 aa  129  6e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0492033 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1235  flagellin modification protein PtmC, putative N-acetylneuraminic acid synthetase  31.05 
 
 
334 aa  129  6e-29  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000000147783  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1204  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  32.14 
 
 
346 aa  128  9.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.6921 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2229  N-acetylneuraminate synthase  33.98 
 
 
350 aa  128  1.0000000000000001e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1586  N-acetylneuraminate synthase  35.37 
 
 
347 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2590  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  34.55 
 
 
338 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00139935 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1970  polysaccharide biosynthesis protein, putative  32.36 
 
 
350 aa  126  3e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.237085  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4269  pseudaminic acid synthase  36.27 
 
 
351 aa  126  3e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.948479 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3405  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  36.28 
 
 
358 aa  126  5e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00670  sialic acid synthase  33.81 
 
 
333 aa  125  5e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0210  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  33.45 
 
 
349 aa  125  9e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.803069  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4942  N-acetylneuraminate synthase  34.55 
 
 
748 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0527  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  32.97 
 
 
335 aa  124  1e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.783884  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12451  sialic acid synthase  31.5 
 
 
337 aa  124  1e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0694401  hitchhiker  0.00593947 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2407  N-acetylneuraminate synthase  33.33 
 
 
500 aa  124  2e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.378262  normal  0.284066 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0562  N-acetylneuraminate synthase  32.97 
 
 
333 aa  123  4e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0587  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  37.12 
 
 
349 aa  122  9e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.518416  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3008  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  34.22 
 
 
350 aa  122  9e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1772  N-acetylneuraminate synthase  36.15 
 
 
350 aa  121  9.999999999999999e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1523  N-acetylneuraminate synthase  37.72 
 
 
350 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.242955  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2668  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  33.1 
 
 
749 aa  121  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3448  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  33.1 
 
 
749 aa  121  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3942  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  32.69 
 
 
349 aa  121  9.999999999999999e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0693356 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0660  N-acetylneuraminate synthase  35.47 
 
 
349 aa  121  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.297547  normal  0.963703 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0774  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  38.86 
 
 
354 aa  121  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.453022  normal  0.512992 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3707  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  39.22 
 
 
350 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.170147  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02907  NeuB:Antifreeze-like protein  34.8 
 
 
347 aa  120  3e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.269494  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3098  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  37.68 
 
 
347 aa  120  3e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.298576  normal  0.187894 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1724  pseudaminic acid synthase  30.69 
 
 
349 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000954999 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3564  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  37.25 
 
 
343 aa  120  3.9999999999999996e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4853  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  32.12 
 
 
352 aa  119  4.9999999999999996e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.31192  normal  0.276031 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2303  general stress protein 14 (GSP14)  34.05 
 
 
333 aa  119  6e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0595  N-acetylneuraminate synthase  30.69 
 
 
333 aa  119  7.999999999999999e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2331  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  31.65 
 
 
332 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.206004 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0631  N-acetylneuraminate synthase  32.56 
 
 
359 aa  117  1.9999999999999998e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1289  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  38.65 
 
 
350 aa  117  3e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2625  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  34.04 
 
 
349 aa  116  3e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3556  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  37.83 
 
 
358 aa  116  5e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.434108 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2977  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  31.29 
 
 
334 aa  115  8.999999999999998e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3121  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  31.29 
 
 
334 aa  115  8.999999999999998e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0364  N-acetylneuraminic acid synthase domain-containing protein  38.95 
 
 
358 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.431709  normal  0.842753 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0818  N-acetylneuraminic acid condensing enzyme  31.41 
 
 
340 aa  114  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1458  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  32.12 
 
 
334 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0151  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  32.73 
 
 
349 aa  113  3e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2758  N-acetylneuraminate synthase  32.18 
 
 
348 aa  113  3e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0789  N-acetylneuraminic acid condensing enzyme  31.07 
 
 
340 aa  112  8.000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1456  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  33.21 
 
 
354 aa  112  8.000000000000001e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1391  N-acetylneuraminate synthase  31.72 
 
 
337 aa  112  8.000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0754706 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4086  N-acetylneuraminate synthase  34.9 
 
 
363 aa  112  9e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3681  N-acetylneuraminate synthase  30.08 
 
 
344 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1534  N-acetylneuraminate synthase  36.82 
 
 
332 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13043  sialic acid synthase  32.68 
 
 
338 aa  111  1.0000000000000001e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.276449  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1516  N-acetylneuraminic acid synthetase  32.76 
 
 
334 aa  111  2.0000000000000002e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.350916  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2425  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  31.64 
 
 
345 aa  110  2.0000000000000002e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.149839  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2841  N-acetylneuraminate synthase  36.08 
 
 
300 aa  110  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.893161  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3076  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  31.05 
 
 
355 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0385  N-acetylneuraminic acid synthetase  32.76 
 
 
334 aa  110  2.0000000000000002e-23  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0843  N-acetylneuraminate synthase  33.46 
 
 
296 aa  111  2.0000000000000002e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1664  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  31.47 
 
 
344 aa  110  3e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1969  N-acetylneuraminate synthase  34.22 
 
 
364 aa  109  5e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0891356  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0647  antifreeze-like protein  31.16 
 
 
350 aa  108  8.000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.318568  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3726  N-acetylneuraminic acid synthase domain  29.63 
 
 
338 aa  108  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1556  sialic acid synthase  33.58 
 
 
340 aa  108  1e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1582  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  29.9 
 
 
359 aa  107  2e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.807685  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001800  N-acetylneuraminate synthase  29.87 
 
 
357 aa  106  5e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14241  sialic acid synthase  24.63 
 
 
356 aa  105  6e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.532641  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1196  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  37.13 
 
 
350 aa  104  1e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4303  N-acetylneuraminate synthase  35.14 
 
 
361 aa  105  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1512  N-acetylneuraminic acid synthetase  30.77 
 
 
343 aa  104  2e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1845  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  35.78 
 
 
344 aa  103  2e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>