180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2578 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_2578  purine or other phosphorylase family 1  100 
 
 		 252 aa  523  1e-147  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.149672  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0281  purine phosphorylase family 1  35.74 
 
 		 253 aa  166  5e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00127495  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0551  phosphorylase, Pnp/Udp family  35.85 
 
 		 269 aa  163  3e-39  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000889574 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0955  phosphorylase, Pnp/Udp family  35.08 
 
 		 254 aa  159  4e-38  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0510178  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1115  purine or other phosphorylase family 1  34.94 
 
 		 258 aa  157  2e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000837521  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0591  phosphorylase, Pnp/Udp family, putative  33.76 
 
 		 256 aa  156  3e-37  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000246027  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1043  uridine phosphorylase  32.6 
 
 		 233 aa  120  1.9999999999999998e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1429  purine phosphorylases family protein 1  32.74 
 
 		 264 aa  108  9.000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000543791  normal  0.161681 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4070  purine or other phosphorylase family 1  30.62 
 
 		 265 aa  107  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0414  hypothetical protein  32.88 
 
 		 153 aa  98.2  1e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0020  purine phosphorylase family 1  34 
 
 		 248 aa  88.6  8e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0965  purine phosphorylase family 1  33.16 
 
 		 292 aa  84  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.470514  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2731  purine or other phosphorylase family 1  41.03 
 
 		 272 aa  80.5  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.036458  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4378  purine phosphorylases family protein 1  38.85 
 
 		 268 aa  80.5  0.00000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.340466  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41980  phosphorylase  30 
 
 		 244 aa  80.1  0.00000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4539  purine phosphorylases family protein 1  34.29 
 
 		 268 aa  79.7  0.00000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0773482  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1714  purine phosphorylase family 1  32.89 
 
 		 253 aa  76.3  0.0000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000616031  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06138  hypothetical protein  27.67 
 
 		 243 aa  71.2  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000334  N-Ribosylnicotinamide phosphorylase  26.09 
 
 		 243 aa  69.7  0.00000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00958039  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2318  purine or other phosphorylase family 1  31.85 
 
 		 241 aa  69.7  0.00000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3654  uridine phosphorylase  29.05 
 
 		 243 aa  68.9  0.00000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1527  S-methyl-5-thioadenosine phosphorylase  28.57 
 
 		 241 aa  68.6  0.00000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0754  uridine phosphorylase  31.52 
 
 		 250 aa  68.2  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0818347  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1675  purine or other phosphorylase family 1  29.03 
 
 		 247 aa  67.4  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0520  purine or other phosphorylase family 1  26.95 
 
 		 236 aa  66.2  0.0000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.3914  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4297  uridine phosphorylase, putative  23.38 
 
 		 241 aa  65.1  0.0000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0375  uridine phosphorylase  27.18 
 
 		 261 aa  65.5  0.0000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0370  uridine phosphorylase  26.7 
 
 		 261 aa  64.7  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0567  Purine-nucleoside phosphorylase  28.1 
 
 		 242 aa  63.9  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2504  uridine phosphorylase  25.66 
 
 		 259 aa  63.9  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.568287  normal  0.357218 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0962  purine or other phosphorylase family 1  28.02 
 
 		 263 aa  64.3  0.000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2072  uridine phosphorylase  28.43 
 
 		 259 aa  63.5  0.000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00214406  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4454  purine phosphorylase family 1  33.33 
 
 		 274 aa  63.2  0.000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.637484 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1606  purine or other phosphorylase family 1  27.46 
 
 		 252 aa  62.8  0.000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0545  purine phosphorylase family 1  26.8 
 
 		 244 aa  62.8  0.000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0598  uridine phosphorylase  25.14 
 
 		 275 aa  62  0.000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4122  uridine phosphorylase  25.68 
 
 		 247 aa  62  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0544  purine or other phosphorylase family 1  27.08 
 
 		 248 aa  62  0.000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1269  purine phosphorylase family 1  38.79 
 
 		 273 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.763005 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0126  purine phosphorylases family protein 1  29.49 
 
 		 242 aa  61.2  0.00000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4137  uridine phosphorylase  25.68 
 
 		 247 aa  61.6  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2738  purine or other phosphorylase family 1  23.3 
 
 		 272 aa  60.1  0.00000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3488  purine phosphorylase family protein 1  22.89 
 
 		 241 aa  60.1  0.00000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4352  uridine phosphorylase  26.83 
 
 		 256 aa  59.3  0.00000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1344  purine nucleoside phosphorylase  25.53 
 
 		 235 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0963  purine or other phosphorylase family 1  25.12 
 
 		 271 aa  58.2  0.0000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3794  purine phosphorylases family protein 1  27.45 
 
 		 244 aa  58.2  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0004  uridine phosphorylase  21.98 
 
 		 243 aa  58.2  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000523211  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0550  purine or other phosphorylase family 1  27.45 
 
 		 244 aa  58.2  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1187  purine nucleoside phosphorylase  25.29 
 
 		 235 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.562168  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0187  uridine phosphorylase  28.86 
 
 		 252 aa  58.5  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0304  purine phosphorylase family 1  21.92 
 
 		 262 aa  58.2  0.0000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1588  purine nucleoside phosphorylase  25.53 
 
 		 235 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0326912  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1372  purine nucleoside phosphorylase  25.53 
 
 		 235 aa  57.4  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.896759  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1345  purine nucleoside phosphorylase  25.53 
 
 		 235 aa  57.4  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1483  purine nucleoside phosphorylase  25.53 
 
 		 235 aa  57.4  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1624  purine nucleoside phosphorylase  25.53 
 
 		 235 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3827  purine nucleoside phosphorylase  25.53 
 
 		 235 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000284162 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1386  purine nucleoside phosphorylase  25.53 
 
 		 235 aa  57.4  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1555  purine nucleoside phosphorylase  25.53 
 
 		 235 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000650002 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1837  uridine phosphorylase  28.3 
 
 		 261 aa  57.4  0.0000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.748158 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0938  purine or other phosphorylase family 1  23.47 
 
 		 275 aa  57.4  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.686275 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1385  purine or other phosphorylase family 1  21.92 
 
 		 293 aa  57.4  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.534425  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1518  purine nucleoside phosphorylase  25.53 
 
 		 235 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1527  AMP nucleosidase  26.53 
 
 		 256 aa  57  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3079  AMP nucleosidase  31.25 
 
 		 287 aa  57  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0103921 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0244  uridine phosphorylase  26.17 
 
 		 253 aa  56.6  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.104641 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4067  uridine phosphorylase  26.22 
 
 		 256 aa  56.2  0.0000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3372  AMP nucleosidase  30.07 
 
 		 258 aa  55.8  0.0000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.570748 
 
 
-
 
NC_002620  TC0132  AMP nucleosidase  31.09 
 
 		 289 aa  55.5  0.0000009  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.622836  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0980  AMP nucleosidase  29.37 
 
 		 277 aa  54.7  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3932  uridine phosphorylase  28.19 
 
 		 253 aa  54.7  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1578  purine phosphorylase family 1  25.15 
 
 		 238 aa  54.7  0.000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00464289 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1831  uridine phosphorylase  25.45 
 
 		 252 aa  54.3  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0507  purine or other phosphorylase family 1  30.56 
 
 		 274 aa  54.3  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01516  uridine phosphorylase  24.6 
 
 		 283 aa  54.3  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0092  purine nucleoside phosphorylase  24.83 
 
 		 236 aa  53.9  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4355  uridine phosphorylase  28.67 
 
 		 253 aa  53.5  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.597183  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4295  uridine phosphorylase  28.67 
 
 		 253 aa  53.5  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4176  uridine phosphorylase  28.67 
 
 		 253 aa  53.5  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.82731  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3950  uridine phosphorylase  25.5 
 
 		 253 aa  53.5  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0552  uridine phosphorylase  24.85 
 
 		 258 aa  53.5  0.000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0266  uridine phosphorylase  25.5 
 
 		 253 aa  53.5  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4199  uridine phosphorylase  28.67 
 
 		 253 aa  53.5  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4248  uridine phosphorylase  28.67 
 
 		 253 aa  53.5  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3646  uridine phosphorylase  25.5 
 
 		 253 aa  53.5  0.000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1391  purine nucleoside phosphorylase  26.42 
 
 		 235 aa  52.8  0.000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000867516  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2079  AMP nucleosidase  27.33 
 
 		 256 aa  52.8  0.000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0671255  normal  0.2634 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1546  purine phosphorylase family 1  27.22 
 
 		 238 aa  52  0.000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0539686  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1318  purine nucleoside phosphorylase  27.44 
 
 		 233 aa  52  0.000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000021408  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2464  purine or other phosphorylase family 1  23 
 
 		 278 aa  51.2  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1652  purine nucleoside phosphorylase  25.91 
 
 		 235 aa  51.6  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000543003  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3962  uridine phosphorylase  24.83 
 
 		 253 aa  51.2  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.072436 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004006  uridine phosphorylase  24.24 
 
 		 252 aa  51.6  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03718  uridine phosphorylase  27.33 
 
 		 254 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03667  hypothetical protein  27.33 
 
 		 253 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0606  purine-nucleoside phosphorylase  25.47 
 
 		 236 aa  50.8  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0603  purine phosphorylase family 1  29.88 
 
 		 222 aa  51.2  0.00002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4055  uridine phosphorylase  27.33 
 
 		 253 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4352  uridine phosphorylase  27.33 
 
 		 253 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>