225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1953 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_1953  hypothetical protein  100 
 
 		 477 aa  966    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4180  hypothetical protein  58.97 
 
 		 498 aa  538  9.999999999999999e-153  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4549  hypothetical protein  58.97 
 
 		 498 aa  539  9.999999999999999e-153  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0105062  normal  0.998456 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0344  hypothetical protein  58.82 
 
 		 479 aa  535  1e-151  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0291416  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4628  hypothetical protein  58.33 
 
 		 475 aa  531  1e-150  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.120494 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4693  hypothetical protein  58.59 
 
 		 459 aa  519  1e-146  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.264866  normal  0.0864427 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1246  hypothetical protein  57.17 
 
 		 474 aa  517  1.0000000000000001e-145  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.821043  normal  0.296431 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4337  hypothetical protein  57.29 
 
 		 478 aa  507  9.999999999999999e-143  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.210186 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0940  hypothetical protein  54.74 
 
 		 469 aa  477  1e-133  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2305  hypothetical protein  53.9 
 
 		 478 aa  472  1e-132  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2574  hypothetical protein  42.83 
 
 		 473 aa  357  2.9999999999999997e-97  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3532  hypothetical protein  42.83 
 
 		 473 aa  356  3.9999999999999996e-97  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1476  hypothetical protein  43.16 
 
 		 474 aa  353  2.9999999999999997e-96  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.276999  normal  0.151455 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0868  hypothetical protein  44.03 
 
 		 475 aa  353  5e-96  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.11828  decreased coverage  0.00000126503 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1028  hypothetical protein  41 
 
 		 485 aa  347  4e-94  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.197499 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4885  hypothetical protein  42.22 
 
 		 475 aa  344  2e-93  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1584  hypothetical protein  44.63 
 
 		 492 aa  343  5e-93  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5064  hypothetical protein  42.83 
 
 		 482 aa  339  7e-92  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2138  hypothetical protein  42.89 
 
 		 478 aa  336  5e-91  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28081  hypothetical protein  43.09 
 
 		 493 aa  320  5e-86  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.339946 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2755  hypothetical protein  40.12 
 
 		 497 aa  242  9e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1167  hypothetical protein  42.26 
 
 		 494 aa  236  6e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.902691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2948  hypothetical protein  41.57 
 
 		 492 aa  236  6e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3863  hypothetical protein  41.71 
 
 		 491 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1520  hypothetical protein  41.11 
 
 		 508 aa  234  2.0000000000000002e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1567  hypothetical protein  39.88 
 
 		 484 aa  234  4.0000000000000004e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.288237  normal  0.989546 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1035  hypothetical protein  41.16 
 
 		 481 aa  232  9e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.414237  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2375  hypothetical protein  40.87 
 
 		 481 aa  231  3e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.645275  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2495  hypothetical protein  44.67 
 
 		 492 aa  229  8e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.469671  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1564  hypothetical protein  38.57 
 
 		 487 aa  228  2e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.418835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2521  hypothetical protein  38.02 
 
 		 483 aa  227  4e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.243145 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01411  hypothetical protein  36.07 
 
 		 489 aa  226  7e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0192  protein of unknown function UPF0061  41.41 
 
 		 500 aa  224  3e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.212573  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0945  hypothetical protein  44.25 
 
 		 505 aa  224  4e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.600857  normal  0.567123 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1901  hypothetical protein  39.33 
 
 		 481 aa  222  9e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0677  protein of unknown function UPF0061  38.95 
 
 		 491 aa  222  9.999999999999999e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.377469 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0519  hypothetical protein  38.95 
 
 		 491 aa  222  9.999999999999999e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0997  hypothetical protein  41.64 
 
 		 491 aa  222  9.999999999999999e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2210  hypothetical protein  36.31 
 
 		 485 aa  221  1.9999999999999999e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0842577  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2066  protein of unknown function UPF0061  40.12 
 
 		 491 aa  221  3e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000546144 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5402  hypothetical protein  40.75 
 
 		 498 aa  221  3e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15540  hypothetical protein  40.83 
 
 		 459 aa  219  6e-56  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00170521  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4892  hypothetical protein  43.55 
 
 		 491 aa  219  7e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.856599  hitchhiker  0.00960553 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004051  UPF0061 domain-containing protein  36.07 
 
 		 489 aa  219  1e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.243743  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1019  hypothetical protein  34.82 
 
 		 488 aa  218  2e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00586805 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3454  hypothetical protein  39.66 
 
 		 492 aa  218  2e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.160092  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2120  hypothetical protein  35.59 
 
 		 473 aa  218  2.9999999999999998e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000120704 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5582  hypothetical protein  39.58 
 
 		 481 aa  217  5e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0331562  normal  0.339627 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5202  hypothetical protein  39.58 
 
 		 481 aa  216  5e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.177002  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2436  protein of unknown function UPF0061  43.71 
 
 		 494 aa  216  5e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000535326  normal  0.0221167 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5290  hypothetical protein  39.58 
 
 		 481 aa  216  5e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.689507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0857  hypothetical protein  39.81 
 
 		 500 aa  216  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.220495  normal  0.340098 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1059  hypothetical protein  38.38 
 
 		 485 aa  215  9.999999999999999e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2335  hypothetical protein  39.27 
 
 		 491 aa  216  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.331723 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1045  hypothetical protein  42.09 
 
 		 494 aa  215  9.999999999999999e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0432954 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4863  hypothetical protein  40.64 
 
 		 497 aa  215  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0982  hypothetical protein  38.58 
 
 		 500 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0019  hypothetical protein  34.77 
 
 		 507 aa  214  3.9999999999999995e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5348  hypothetical protein  40.64 
 
 		 497 aa  213  5.999999999999999e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1192  protein of unknown function UPF0061  36.68 
 
 		 492 aa  213  7e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3269  hypothetical protein  42.8 
 
 		 483 aa  212  9e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2214  hypothetical protein  37.8 
 
 		 491 aa  212  1e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000439829  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5772  hypothetical protein  43.23 
 
 		 482 aa  212  1e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.927305  decreased coverage  0.00684565 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3434  protein of unknown function UPF0061  43.57 
 
 		 512 aa  212  1e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.42028  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1157  protein of unknown function UPF0061  36.75 
 
 		 481 aa  210  4e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.240564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3772  hypothetical protein  36.16 
 
 		 493 aa  210  4e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0297  hypothetical protein  40.97 
 
 		 492 aa  209  8e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5118  hypothetical protein  38.19 
 
 		 486 aa  209  9e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.380647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4941  hypothetical protein  38.71 
 
 		 486 aa  209  1e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0691  hypothetical protein  32.09 
 
 		 507 aa  207  3e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.300324  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3221  hypothetical protein  33.65 
 
 		 488 aa  207  4e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0963189  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5068  hypothetical protein  37.86 
 
 		 540 aa  207  5e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1790  protein of unknown function UPF0061  44.29 
 
 		 486 aa  207  5e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3632  protein of unknown function UPF0061  33.97 
 
 		 464 aa  206  1e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3307  hypothetical protein  33.75 
 
 		 488 aa  205  2e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3567  hypothetical protein  33.75 
 
 		 488 aa  205  2e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0716  protein of unknown function UPF0061  39.76 
 
 		 491 aa  204  2e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1456  hypothetical protein  36.57 
 
 		 480 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2000  hypothetical protein  36.57 
 
 		 480 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.407713 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4049  hypothetical protein  45.67 
 
 		 491 aa  204  2e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0398  hypothetical protein  38.24 
 
 		 486 aa  204  3e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3523  hypothetical protein  33.5 
 
 		 488 aa  204  3e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.766796 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1677  hypothetical protein  36.59 
 
 		 495 aa  204  3e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2958  hypothetical protein  40.75 
 
 		 505 aa  204  4e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2495  hypothetical protein  42.2 
 
 		 494 aa  203  5e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1828  hypothetical protein  36.57 
 
 		 480 aa  203  5e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0310  hypothetical protein  42.33 
 
 		 499 aa  203  5e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1440  hypothetical protein  36.57 
 
 		 480 aa  203  6e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0641647 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3508  hypothetical protein  32.11 
 
 		 488 aa  203  6e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1736  hypothetical protein  37.63 
 
 		 480 aa  203  6e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.106684 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1802  hypothetical protein  38.2 
 
 		 480 aa  202  7e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.322883 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4843  protein of unknown function UPF0061  44.84 
 
 		 502 aa  203  7e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.287354  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1740  hypothetical protein  31.9 
 
 		 488 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0492514 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3522  hypothetical protein  33.08 
 
 		 488 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.202942  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3222  hypothetical protein  33.5 
 
 		 488 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1474  hypothetical protein  36.25 
 
 		 480 aa  202  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3274  hypothetical protein  33 
 
 		 488 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.456821  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2027  protein of unknown function UPF0061  36.31 
 
 		 495 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0596  hypothetical protein  34.23 
 
 		 517 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1631  hypothetical protein  36.84 
 
 		 483 aa  200  3.9999999999999996e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>